Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2C5

Rnf149, E3 ubiquitin-protein ligase RNF149, mousemouse

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Length 394 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf149Q3U2C5 Gm20715-201ENSMUST00000054781 4460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Rnf149Q3U2C5 5730596B20Rik-201ENSMUST00000070587 3354 ntAPPRIS P1 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Rnf149Q3U2C5 Pold1-201ENSMUST00000049343 3454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Rnf149Q3U2C5 Rhox2-ps-201ENSMUST00000117421 322 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
Rnf149Q3U2C5 Gm12616-201ENSMUST00000118594 382 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
Rnf149Q3U2C5 n-R5s14-201ENSMUST00000122688 107 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
Rnf149Q3U2C5 Gm16341-201ENSMUST00000126385 377 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Rnf149Q3U2C5 Gm13822-201ENSMUST00000127563 346 ntTSL 3 BASIC9.7□□□□□ -0.86
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Rnf149Q3U2C5 Gm10320-201ENSMUST00000170205 527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
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Rnf149Q3U2C5 Gm12622-201ENSMUST00000177975 382 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
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Rnf149Q3U2C5 Gm12613-201ENSMUST00000180323 382 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
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Rnf149Q3U2C5 Ints3-201ENSMUST00000029542 4337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
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Rnf149Q3U2C5 Spata16-201ENSMUST00000047005 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
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Rnf149Q3U2C5 Pcdha6-201ENSMUST00000193389 4653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
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