Protein–RNA interactions for Protein: Q1RNF8

Samd11, Sterile alpha motif domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 542 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd11Q1RNF8 Dync2li1-201ENSMUST00000025101 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Samd11Q1RNF8 Ms4a7-203ENSMUST00000067532 1334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Samd11Q1RNF8 Myo16-201ENSMUST00000042103 6725 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Samd11Q1RNF8 Srd5a3-203ENSMUST00000113507 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Samd11Q1RNF8 Gm19027-201ENSMUST00000187291 1355 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Samd11Q1RNF8 Entpd8-203ENSMUST00000114380 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Samd11Q1RNF8 C1qtnf3-201ENSMUST00000022853 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Samd11Q1RNF8 Mark3-208ENSMUST00000221753 2394 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Samd11Q1RNF8 Tcl1b4-202ENSMUST00000222867 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Samd11Q1RNF8 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Samd11Q1RNF8 Gm44153-201ENSMUST00000204162 1580 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Samd11Q1RNF8 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Samd11Q1RNF8 Helq-201ENSMUST00000044684 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Samd11Q1RNF8 Stxbp4-203ENSMUST00000107875 1660 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Samd11Q1RNF8 AC113282.1-201ENSMUST00000225278 1707 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Samd11Q1RNF8 Dpep2-201ENSMUST00000034373 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Samd11Q1RNF8 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Samd11Q1RNF8 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Samd11Q1RNF8 Zfp410-215ENSMUST00000222832 1859 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Samd11Q1RNF8 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Samd11Q1RNF8 Lgsn-201ENSMUST00000062560 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Samd11Q1RNF8 Fam222b-203ENSMUST00000155571 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Samd11Q1RNF8 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Samd11Q1RNF8 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Samd11Q1RNF8 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Samd11Q1RNF8 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Samd11Q1RNF8 Slc35a4-201ENSMUST00000036158 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Samd11Q1RNF8 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Samd11Q1RNF8 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Samd11Q1RNF8 Psmb3-201ENSMUST00000103147 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Samd11Q1RNF8 Gm14997-201ENSMUST00000119232 636 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Samd11Q1RNF8 Gm13688-201ENSMUST00000121557 608 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Samd11Q1RNF8 Gm13857-201ENSMUST00000139645 173 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Samd11Q1RNF8 Tbata-210ENSMUST00000151886 915 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Samd11Q1RNF8 Tnfrsf14-205ENSMUST00000219534 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Samd11Q1RNF8 Hbb-y-201ENSMUST00000033229 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Samd11Q1RNF8 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Samd11Q1RNF8 Stab1-201ENSMUST00000036618 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Samd11Q1RNF8 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Samd11Q1RNF8 Mier3-201ENSMUST00000047412 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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Samd11Q1RNF8 Dmtf1-201ENSMUST00000071921 3806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Samd11Q1RNF8 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Samd11Q1RNF8 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Samd11Q1RNF8 Samhd1-203ENSMUST00000109549 3245 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Samd11Q1RNF8 Rnf214-208ENSMUST00000161187 2847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Samd11Q1RNF8 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Samd11Q1RNF8 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Samd11Q1RNF8 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Samd11Q1RNF8 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Samd11Q1RNF8 Als2cl-203ENSMUST00000130386 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Samd11Q1RNF8 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Samd11Q1RNF8 Fads6-201ENSMUST00000056153 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Samd11Q1RNF8 Vmn1r38-201ENSMUST00000226457 3462 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Samd11Q1RNF8 Gm19792-201ENSMUST00000222522 2021 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
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Samd11Q1RNF8 Prdm1-201ENSMUST00000039174 5281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
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