Protein–RNA interactions for Protein: Q149F1

Rpusd2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd2Q149F1 Rfesd-201ENSMUST00000050997 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rpusd2Q149F1 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rpusd2Q149F1 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rpusd2Q149F1 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rpusd2Q149F1 BC052040-201ENSMUST00000110918 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rpusd2Q149F1 Ncf1-202ENSMUST00000111275 2721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rpusd2Q149F1 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rpusd2Q149F1 Sox9-201ENSMUST00000000579 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rpusd2Q149F1 Pou2f3-201ENSMUST00000034513 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rpusd2Q149F1 Kifc5b-201ENSMUST00000078961 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rpusd2Q149F1 Tmem237-205ENSMUST00000186794 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rpusd2Q149F1 Ddx55-201ENSMUST00000071057 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rpusd2Q149F1 Gm26686-201ENSMUST00000181951 3467 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rpusd2Q149F1 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rpusd2Q149F1 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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Rpusd2Q149F1 Fam107b-202ENSMUST00000115052 861 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
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Rpusd2Q149F1 1700121L03Rik-201ENSMUST00000187796 704 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rpusd2Q149F1 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rpusd2Q149F1 Gm37468-201ENSMUST00000194767 854 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rpusd2Q149F1 D8Ertd738e-201ENSMUST00000019506 616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
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Rpusd2Q149F1 Gm43778-201ENSMUST00000199438 199 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Rpusd2Q149F1 Gm43460-201ENSMUST00000202491 1057 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Rpusd2Q149F1 Gm6590-201ENSMUST00000203343 687 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Rpusd2Q149F1 Hmgb1-ps11-201ENSMUST00000221749 621 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Rpusd2Q149F1 AC173482.2-201ENSMUST00000224044 750 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Rpusd2Q149F1 Vmn1r16-201ENSMUST00000227168 912 ntAPPRIS P2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rpusd2Q149F1 Clec4a2-201ENSMUST00000032248 1261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rpusd2Q149F1 Gpr87-201ENSMUST00000056898 1080 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Rpusd2Q149F1 Olfr488-201ENSMUST00000072968 945 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rpusd2Q149F1 Olfr115-201ENSMUST00000076936 939 ntAPPRIS P2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rpusd2Q149F1 Vmn1r195-201ENSMUST00000091736 1088 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rpusd2Q149F1 Wfdc6a-201ENSMUST00000099096 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rpusd2Q149F1 Nono-201ENSMUST00000033673 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rpusd2Q149F1 4930579F01Rik-202ENSMUST00000199293 1598 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rpusd2Q149F1 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rpusd2Q149F1 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rpusd2Q149F1 Pcgf2-206ENSMUST00000169807 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rpusd2Q149F1 Os9-202ENSMUST00000164259 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rpusd2Q149F1 Fnip1-201ENSMUST00000046835 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rpusd2Q149F1 Pde4c-207ENSMUST00000224874 3099 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rpusd2Q149F1 Ubap2l-215ENSMUST00000198322 3385 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rpusd2Q149F1 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rpusd2Q149F1 Milr1-201ENSMUST00000086353 1348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rpusd2Q149F1 Ctdspl2-203ENSMUST00000110574 1616 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rpusd2Q149F1 Gm37058-201ENSMUST00000193393 1644 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Rpusd2Q149F1 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rpusd2Q149F1 Ebf3-202ENSMUST00000106118 3736 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
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Rpusd2Q149F1 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
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Rpusd2Q149F1 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rpusd2Q149F1 B4galnt2-201ENSMUST00000038343 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rpusd2Q149F1 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
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Rpusd2Q149F1 Gm29642-201ENSMUST00000186170 921 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rpusd2Q149F1 Gm20812-202ENSMUST00000189550 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rpusd2Q149F1 Ighv5-8-202ENSMUST00000191967 337 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Rpusd2Q149F1 Znhit6-206ENSMUST00000199033 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rpusd2Q149F1 Fgfbp1-203ENSMUST00000199894 1228 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
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Rpusd2Q149F1 Mrpl42-202ENSMUST00000217777 455 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rpusd2Q149F1 BC106175-202ENSMUST00000219344 1213 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Rpusd2Q149F1 AC158986.2-201ENSMUST00000227487 618 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Rpusd2Q149F1 Crygf-201ENSMUST00000027082 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rpusd2Q149F1 Tcl1b5-201ENSMUST00000000717 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rpusd2Q149F1 Obp1b-201ENSMUST00000088198 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rpusd2Q149F1 Gm15958-202ENSMUST00000153479 2087 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rpusd2Q149F1 Ndrg4-203ENSMUST00000080666 2738 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rpusd2Q149F1 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rpusd2Q149F1 Spag16-202ENSMUST00000113940 3559 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rpusd2Q149F1 Gm38376-201ENSMUST00000195493 2253 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Rpusd2Q149F1 Gm33677-201ENSMUST00000220074 2765 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rpusd2Q149F1 Epha7-204ENSMUST00000108194 2323 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rpusd2Q149F1 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rpusd2Q149F1 Lrit3-201ENSMUST00000179187 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rpusd2Q149F1 Olfr1495-202ENSMUST00000215930 2025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rpusd2Q149F1 Slc12a8-203ENSMUST00000119173 2382 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rpusd2Q149F1 Metap2-201ENSMUST00000047910 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rpusd2Q149F1 Hbs1l-209ENSMUST00000219915 2733 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
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