Protein–RNA interactions for Protein: Q07968

F13b, Coagulation factor XIII B chain, mousemouse

Predictions only

Length 669 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F13bQ07968 Atp9b-201ENSMUST00000091790 5357 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
F13bQ07968 Nxpe5-201ENSMUST00000110929 2312 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
F13bQ07968 Col20a1-202ENSMUST00000149179 3867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
F13bQ07968 Grik1-201ENSMUST00000023652 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
F13bQ07968 Ephx1-201ENSMUST00000036928 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
F13bQ07968 Gm26672-201ENSMUST00000180922 2685 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
F13bQ07968 Mgat5-201ENSMUST00000038361 8436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
F13bQ07968 Bahcc1-203ENSMUST00000122148 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
F13bQ07968 Nrg1-212ENSMUST00000208598 1778 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
F13bQ07968 Ptprg-201ENSMUST00000022264 9213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
F13bQ07968 Scn8a-201ENSMUST00000082209 11293 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
F13bQ07968 Ltbp1-203ENSMUST00000112516 5140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
F13bQ07968 Rufy4-202ENSMUST00000127134 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
F13bQ07968 Cct3-204ENSMUST00000164166 1804 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
F13bQ07968 Scyl2-204ENSMUST00000174252 4817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
F13bQ07968 Abcf1-201ENSMUST00000043757 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
F13bQ07968 Rab11fip4os1-201ENSMUST00000145652 2187 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
F13bQ07968 Pcdh11x-202ENSMUST00000113358 8607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
F13bQ07968 Slfn1-201ENSMUST00000037994 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
F13bQ07968 Dnmbp-206ENSMUST00000212592 3901 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
F13bQ07968 Zeb2-203ENSMUST00000076836 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
F13bQ07968 Ppip5k1-205ENSMUST00000110628 5404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
F13bQ07968 D630008O14Rik-201ENSMUST00000144260 1568 ntTSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
F13bQ07968 Ppp1r26-205ENSMUST00000189694 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
F13bQ07968 Ppp1r26-201ENSMUST00000040324 5466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
F13bQ07968 Prpf6-203ENSMUST00000136481 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
F13bQ07968 6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 1970 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
F13bQ07968 Gm6793-201ENSMUST00000071732 1604 ntAPPRIS P1 BASIC9.47□□□□□ -0.89
F13bQ07968 Gm2000-201ENSMUST00000102782 445 ntAPPRIS P1 BASIC9.47□□□□□ -0.89
F13bQ07968 Spdye4c-203ENSMUST00000178601 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
F13bQ07968 Gm26982-201ENSMUST00000182250 1151 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
F13bQ07968 Gm7719-201ENSMUST00000182374 975 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
F13bQ07968 Nmbr-206ENSMUST00000190114 662 ntTSL 3 BASIC9.47□□□□□ -0.89
F13bQ07968 Gm37826-201ENSMUST00000195329 322 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
F13bQ07968 Gm6423-201ENSMUST00000204315 934 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
F13bQ07968 Gm4065-202ENSMUST00000218911 986 ntTSL 3 BASIC9.47□□□□□ -0.89
F13bQ07968 BC106175-202ENSMUST00000219344 1213 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
F13bQ07968 Bloc1s1-201ENSMUST00000026405 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
F13bQ07968 4930555K19Rik-201ENSMUST00000060066 171 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
F13bQ07968 Gm43143-201ENSMUST00000196083 2023 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
F13bQ07968 Rbm14-202ENSMUST00000113793 3508 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
F13bQ07968 Gm45218-201ENSMUST00000205533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
F13bQ07968 Matn2-205ENSMUST00000227759 3569 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
F13bQ07968 Colq-201ENSMUST00000112027 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
F13bQ07968 Unc79-202ENSMUST00000101099 8874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
F13bQ07968 6430562O15Rik-201ENSMUST00000180491 2488 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
F13bQ07968 Prkd2-202ENSMUST00000168093 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
F13bQ07968 Gm12153-201ENSMUST00000148504 2509 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
F13bQ07968 Ncam1-203ENSMUST00000192584 2525 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
F13bQ07968 Enpp5-201ENSMUST00000024756 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
F13bQ07968 Ccar2-201ENSMUST00000035612 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
F13bQ07968 Bace2-201ENSMUST00000047275 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
F13bQ07968 Gm28581-201ENSMUST00000186086 2177 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
F13bQ07968 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
F13bQ07968 Gm10827-201ENSMUST00000181897 2586 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
F13bQ07968 Kcnk5-201ENSMUST00000024011 3392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
F13bQ07968 Slc25a44-203ENSMUST00000193433 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
F13bQ07968 Gm19178-201ENSMUST00000217524 1819 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
F13bQ07968 Alas2-202ENSMUST00000112715 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
F13bQ07968 Arhgef2-231ENSMUST00000177498 3966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
F13bQ07968 Gm6714-201ENSMUST00000218677 2330 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
F13bQ07968 Hyou1-206ENSMUST00000161318 4489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.89
F13bQ07968 4930555B11Rik-201ENSMUST00000123210 1533 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
F13bQ07968 Gm18986-201ENSMUST00000216029 1986 ntBASIC9.46□□□□□ -0.89
F13bQ07968 Fdft1-201ENSMUST00000054963 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
F13bQ07968 Zmynd11-206ENSMUST00000110637 3770 ntTSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.89
F13bQ07968 B3galt5-201ENSMUST00000099497 5147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
F13bQ07968 Myo5a-206ENSMUST00000136731 6480 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.89
F13bQ07968 Oprm1-230ENSMUST00000154906 2039 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
F13bQ07968 Fam186a-202ENSMUST00000100209 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.89
F13bQ07968 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
F13bQ07968 Slc23a2-201ENSMUST00000028815 6364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
F13bQ07968 Gpr68-201ENSMUST00000053668 3099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.46□□□□□ -0.89
F13bQ07968 Syt15-201ENSMUST00000035351 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
F13bQ07968 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
F13bQ07968 Slc17a5-201ENSMUST00000052441 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
F13bQ07968 Stk38-201ENSMUST00000009138 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
F13bQ07968 Ppp4r1l-ps-202ENSMUST00000132669 2767 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
F13bQ07968 Btnl4-201ENSMUST00000065841 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
F13bQ07968 Tcl1-202ENSMUST00000101071 1299 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
F13bQ07968 Gm12712-201ENSMUST00000120676 801 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
F13bQ07968 Gm14993-201ENSMUST00000121180 164 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
F13bQ07968 Snrnp25-202ENSMUST00000121182 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.46□□□□□ -0.9
F13bQ07968 Gm11244-201ENSMUST00000121243 237 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
F13bQ07968 Txnrd2-205ENSMUST00000126778 491 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
F13bQ07968 1700123M08Rik-202ENSMUST00000146154 770 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
F13bQ07968 Gm14266-202ENSMUST00000146542 1067 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
F13bQ07968 Gm13449-201ENSMUST00000153559 1231 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
F13bQ07968 Gzmc-201ENSMUST00000015585 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
F13bQ07968 Fcgr2b-203ENSMUST00000159688 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
F13bQ07968 Gm15524-201ENSMUST00000159874 463 ntTSL 3 BASIC9.46□□□□□ -0.9
F13bQ07968 Gm15954-201ENSMUST00000160746 466 ntTSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
F13bQ07968 6530401F13Rik-201ENSMUST00000166971 1090 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
F13bQ07968 Gm17070-201ENSMUST00000170463 784 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
F13bQ07968 Gm20400-201ENSMUST00000173695 665 ntTSL 3 BASIC9.46□□□□□ -0.9
F13bQ07968 Tcl1-204ENSMUST00000176579 760 ntTSL 2 BASIC9.46□□□□□ -0.9
F13bQ07968 Uba52-ps-201ENSMUST00000183770 379 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
F13bQ07968 1700065I16Rik-201ENSMUST00000185277 512 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
F13bQ07968 Gm28833-201ENSMUST00000189671 559 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
F13bQ07968 Gm7271-202ENSMUST00000191515 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65 ms