Protein–RNA interactions for Protein: Q00977

Gjb2, Gap junction beta-2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb2Q00977 Zfp605-202ENSMUST00000112528 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gjb2Q00977 Gm15554-201ENSMUST00000120406 913 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Gjb2Q00977 Gm15856-201ENSMUST00000124853 1162 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gjb2Q00977 Tnk2os-201ENSMUST00000141256 1392 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gjb2Q00977 Gm24398-201ENSMUST00000157870 109 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Gjb2Q00977 Tubb1-201ENSMUST00000016399 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gjb2Q00977 Ndufs1-203ENSMUST00000168099 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gjb2Q00977 Gm20420-201ENSMUST00000173178 639 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gjb2Q00977 Gm18294-201ENSMUST00000176980 1748 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Gjb2Q00977 Lrit3-201ENSMUST00000179187 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gjb2Q00977 Ly6c1-202ENSMUST00000179762 838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gjb2Q00977 Gm26918-201ENSMUST00000182496 728 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gjb2Q00977 Mir7076-201ENSMUST00000183519 74 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Gjb2Q00977 Gm6124-201ENSMUST00000188240 2580 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Gjb2Q00977 Eef1b2-209ENSMUST00000188524 681 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gjb2Q00977 Gm29431-201ENSMUST00000189848 449 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gjb2Q00977 Gm17877-201ENSMUST00000192578 814 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Gjb2Q00977 Gm43695-201ENSMUST00000196545 196 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gjb2Q00977 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gjb2Q00977 Bcl2l12-205ENSMUST00000207755 605 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gjb2Q00977 Gm45592-201ENSMUST00000209605 1043 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Gjb2Q00977 Gm8959-201ENSMUST00000213150 571 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Gjb2Q00977 Gm8162-201ENSMUST00000213951 665 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Gjb2Q00977 Myl6-203ENSMUST00000217776 562 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gjb2Q00977 AC153152.3-201ENSMUST00000222188 1135 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Gjb2Q00977 AC102368.1-201ENSMUST00000227161 892 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Gjb2Q00977 3100002H09Rik-201ENSMUST00000053604 873 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gjb2Q00977 Catsperz-201ENSMUST00000057716 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gjb2Q00977 Ticam1-201ENSMUST00000058136 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gjb2Q00977 Kcnj9-201ENSMUST00000062387 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gjb2Q00977 Oprm1-204ENSMUST00000063036 1427 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gjb2Q00977 Olfr354-201ENSMUST00000068475 1084 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gjb2Q00977 Tubgcp6-201ENSMUST00000041656 5357 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gjb2Q00977 Zmynd8-205ENSMUST00000109266 5072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gjb2Q00977 Atxn1l-201ENSMUST00000093162 7526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gjb2Q00977 Irf9-202ENSMUST00000130697 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gjb2Q00977 AC164099.2-201ENSMUST00000227795 2005 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gjb2Q00977 Dhx34-204ENSMUST00000121123 3880 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gjb2Q00977 Txlng-201ENSMUST00000041370 3862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gjb2Q00977 Olfr272-202ENSMUST00000107667 1936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gjb2Q00977 Grin2b-202ENSMUST00000111905 7484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gjb2Q00977 2410004P03Rik-201ENSMUST00000095823 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gjb2Q00977 Gm37058-201ENSMUST00000193393 1644 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Gjb2Q00977 Ddx52-201ENSMUST00000049257 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gjb2Q00977 Bcl7a-202ENSMUST00000117971 4642 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gjb2Q00977 Gm35363-201ENSMUST00000209330 1317 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gjb2Q00977 Gm16982-201ENSMUST00000181275 2620 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gjb2Q00977 Ehd2-201ENSMUST00000098799 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gjb2Q00977 Adig-202ENSMUST00000109484 488 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gjb2Q00977 Gm11411-201ENSMUST00000117951 719 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Gjb2Q00977 Gm11417-201ENSMUST00000150536 920 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gjb2Q00977 Mir1943-201ENSMUST00000158276 73 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Gjb2Q00977 Gm17168-201ENSMUST00000169146 345 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gjb2Q00977 Gm10100-201ENSMUST00000179726 363 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gjb2Q00977 Gm27232-201ENSMUST00000184373 597 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gjb2Q00977 Gm28388-201ENSMUST00000186262 437 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Gjb2Q00977 Nme6-206ENSMUST00000197627 905 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gjb2Q00977 Gm7880-201ENSMUST00000203748 871 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Gjb2Q00977 Fam168a-204ENSMUST00000207564 1083 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gjb2Q00977 Gm45770-201ENSMUST00000212105 616 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Gjb2Q00977 Adig-201ENSMUST00000059889 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gjb2Q00977 Gm2174-201ENSMUST00000079663 402 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gjb2Q00977 Gm6040-201ENSMUST00000095430 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gjb2Q00977 Megf8-201ENSMUST00000128119 10040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gjb2Q00977 Acadsb-202ENSMUST00000117518 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gjb2Q00977 Gm44103-201ENSMUST00000204364 3662 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Gjb2Q00977 Triobp-204ENSMUST00000109690 7023 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gjb2Q00977 Ptpre-205ENSMUST00000210833 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gjb2Q00977 Poc5-201ENSMUST00000099295 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gjb2Q00977 Zfp236-202ENSMUST00000182122 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gjb2Q00977 Alox12-201ENSMUST00000000329 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gjb2Q00977 Trp53inp2-201ENSMUST00000043237 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gjb2Q00977 Nphs1-203ENSMUST00000126297 3877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gjb2Q00977 Dlgap1-214ENSMUST00000155016 4712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gjb2Q00977 Ybey-201ENSMUST00000049185 4522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gjb2Q00977 Tmod2-201ENSMUST00000064433 9884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gjb2Q00977 Slc35b3-202ENSMUST00000167513 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gjb2Q00977 B4galnt2-201ENSMUST00000038343 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gjb2Q00977 Rxfp2-201ENSMUST00000065745 2539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gjb2Q00977 Tgoln1-201ENSMUST00000070524 5013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gjb2Q00977 Cops3-201ENSMUST00000019517 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gjb2Q00977 Gm45397-201ENSMUST00000209816 1600 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gjb2Q00977 Gm11735-201ENSMUST00000106377 1581 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Gjb2Q00977 Oprm1-208ENSMUST00000092734 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gjb2Q00977 Mphosph10-201ENSMUST00000032735 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gjb2Q00977 CT030159.3-201ENSMUST00000222936 1481 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gjb2Q00977 Ptgfr-201ENSMUST00000029670 6624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gjb2Q00977 Socs6-202ENSMUST00000123826 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gjb2Q00977 Dnmt3aos-201ENSMUST00000144896 1385 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gjb2Q00977 Zfp608-201ENSMUST00000064763 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gjb2Q00977 Pax6-207ENSMUST00000111087 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gjb2Q00977 Tcn2-206ENSMUST00000109992 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gjb2Q00977 Gm26013-201ENSMUST00000104404 119 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Gjb2Q00977 Fam129a-203ENSMUST00000111875 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gjb2Q00977 Wdr45-206ENSMUST00000116634 1250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gjb2Q00977 Gm13019-201ENSMUST00000120000 276 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Gjb2Q00977 Gm12029-201ENSMUST00000120073 832 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Gjb2Q00977 A230006K03Rik-202ENSMUST00000154958 901 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gjb2Q00977 Gm37988-201ENSMUST00000155020 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gjb2Q00977 Gm7030-202ENSMUST00000172968 899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms