Protein–RNA interactions for Protein: P80206

Otx2, Homeobox protein OTX2, mousemouse

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Length 289 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otx2P80206 Os9-202ENSMUST00000164259 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Otx2P80206 Gm42815-201ENSMUST00000198787 1470 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Otx2P80206 AC153380.1-201ENSMUST00000214959 2364 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Otx2P80206 Snx13-202ENSMUST00000163677 3681 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Otx2P80206 Dusp10-201ENSMUST00000048655 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Otx2P80206 Trappc11-201ENSMUST00000039061 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Otx2P80206 Anxa11-202ENSMUST00000112364 1625 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Otx2P80206 Snx29-201ENSMUST00000096273 1622 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Otx2P80206 Srcap-201ENSMUST00000066582 4545 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Otx2P80206 Mob4-205ENSMUST00000162364 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Otx2P80206 Mcm2-201ENSMUST00000058011 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Otx2P80206 Gm19680-201ENSMUST00000095050 1513 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Otx2P80206 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Otx2P80206 Gm17141-201ENSMUST00000167578 3148 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Otx2P80206 Zfp423-203ENSMUST00000165770 4334 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Otx2P80206 Rplp2-202ENSMUST00000106003 449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Otx2P80206 Ccl19-ps1-201ENSMUST00000119621 327 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Otx2P80206 Gm5555-201ENSMUST00000120352 1111 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Otx2P80206 Gm25288-201ENSMUST00000122800 265 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Otx2P80206 Gm11981-201ENSMUST00000139769 664 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Otx2P80206 Gm12052-201ENSMUST00000142151 933 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Otx2P80206 Cdhr4-208ENSMUST00000176373 492 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Otx2P80206 Mir6387-201ENSMUST00000184042 108 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Otx2P80206 Nme6-214ENSMUST00000200468 865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Otx2P80206 Gm6352-201ENSMUST00000203583 1134 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Otx2P80206 Calca-207ENSMUST00000206853 720 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Otx2P80206 Gm18001-201ENSMUST00000212023 688 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Otx2P80206 CT030195.2-201ENSMUST00000226074 1286 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Otx2P80206 Gm26782-203ENSMUST00000227103 751 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Otx2P80206 Psca-201ENSMUST00000023265 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Otx2P80206 Lsm3-201ENSMUST00000040607 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Otx2P80206 Olfr435-201ENSMUST00000058118 942 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Otx2P80206 Gm25514-201ENSMUST00000083860 135 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Otx2P80206 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Otx2P80206 Atp9b-201ENSMUST00000091790 5357 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Otx2P80206 Asap1-202ENSMUST00000110114 4409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Otx2P80206 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Otx2P80206 Palld-202ENSMUST00000121200 4193 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Otx2P80206 Foxp1-201ENSMUST00000074346 2118 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Otx2P80206 Madd-202ENSMUST00000066473 5974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Otx2P80206 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Otx2P80206 AC129336.1-201ENSMUST00000220224 2277 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Otx2P80206 5730405O15Rik-201ENSMUST00000127521 1749 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Otx2P80206 Limk2-201ENSMUST00000101638 3514 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Otx2P80206 Serhl-205ENSMUST00000166427 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Otx2P80206 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Otx2P80206 Olfr434-203ENSMUST00000216562 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Otx2P80206 Ebf3-202ENSMUST00000106118 3736 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Otx2P80206 Gm37058-201ENSMUST00000193393 1644 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Otx2P80206 Camta2-201ENSMUST00000036299 4495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Otx2P80206 Rcor3-202ENSMUST00000110849 3791 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Otx2P80206 Fggy-201ENSMUST00000043335 1910 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Otx2P80206 Abcb8-201ENSMUST00000073076 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Otx2P80206 Dglucy-202ENSMUST00000110069 3058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Otx2P80206 Ufd1-202ENSMUST00000115578 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Otx2P80206 Nanog-201ENSMUST00000012540 2211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Otx2P80206 Crocc2-201ENSMUST00000138595 7132 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Otx2P80206 Gm42970-201ENSMUST00000196407 1352 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Otx2P80206 Myo18a-201ENSMUST00000000645 7307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Otx2P80206 Myo18a-203ENSMUST00000092887 7304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Otx2P80206 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Otx2P80206 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Otx2P80206 Dclk2-209ENSMUST00000195561 3486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Otx2P80206 Acad9-201ENSMUST00000011492 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Otx2P80206 Rsc1a1-201ENSMUST00000105782 1749 ntAPPRIS P1 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Otx2P80206 Surf6-202ENSMUST00000114043 894 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Otx2P80206 Gm15625-201ENSMUST00000117617 1093 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Otx2P80206 4930579F01Rik-201ENSMUST00000012186 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Otx2P80206 Gm13027-201ENSMUST00000135858 241 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Otx2P80206 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Otx2P80206 Gm26368-201ENSMUST00000157826 118 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Otx2P80206 Fcgr2b-204ENSMUST00000159969 1578 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Otx2P80206 U2af1l4-218ENSMUST00000166960 747 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Otx2P80206 2610016A17Rik-201ENSMUST00000185211 474 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Otx2P80206 Gm8684-201ENSMUST00000195078 1564 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
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Otx2P80206 Gm44498-201ENSMUST00000199509 111 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Otx2P80206 Gm44507-201ENSMUST00000206249 343 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Otx2P80206 Gm45094-201ENSMUST00000207013 617 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Otx2P80206 Psmc1-201ENSMUST00000021595 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Otx2P80206 Gm19792-201ENSMUST00000222522 2021 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Otx2P80206 Rnasek-201ENSMUST00000040428 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Otx2P80206 E330021D16Rik-201ENSMUST00000058713 1116 ntAPPRIS P1 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Otx2P80206 Gm10580-201ENSMUST00000097985 396 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Otx2P80206 Gm10582-201ENSMUST00000097987 396 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Otx2P80206 Gm10583-201ENSMUST00000097988 396 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Otx2P80206 Herc6-201ENSMUST00000031817 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Otx2P80206 Furin-201ENSMUST00000107362 4166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Otx2P80206 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Otx2P80206 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Otx2P80206 Sez6l-205ENSMUST00000212480 5857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Otx2P80206 Ndufa11-201ENSMUST00000002452 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Otx2P80206 Gcnt7-201ENSMUST00000099060 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Otx2P80206 Slc10a3-203ENSMUST00000114146 1902 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Otx2P80206 CT030159.3-201ENSMUST00000222936 1481 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Otx2P80206 Gfra2-203ENSMUST00000227697 1323 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Otx2P80206 Nono-201ENSMUST00000033673 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Otx2P80206 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Otx2P80206 Slco2a1-201ENSMUST00000035148 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Otx2P80206 Gm13684-201ENSMUST00000152569 2264 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
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