Protein–RNA interactions for Protein: P49813

Tmod1, Tropomodulin-1, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod1P49813 Slc20a1-201ENSMUST00000028880 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Tmod1P49813 Nr1i3-201ENSMUST00000005820 1414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Tmod1P49813 Arhgef2-231ENSMUST00000177498 3966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Tmod1P49813 Ackr2-202ENSMUST00000214340 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Tmod1P49813 Cnot8-202ENSMUST00000108843 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Tmod1P49813 Acsm2-202ENSMUST00000098084 2099 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Tmod1P49813 Dscaml1-201ENSMUST00000034592 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Tmod1P49813 Gm21103-202ENSMUST00000170923 1761 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Tmod1P49813 2610028H24Rik-202ENSMUST00000105415 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Tmod1P49813 Plin4-202ENSMUST00000190703 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Tmod1P49813 Gm19178-201ENSMUST00000217524 1819 ntBASIC12.02□□□□□ -0.48
Tmod1P49813 Tmod2-201ENSMUST00000064433 9884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Tmod1P49813 Tcof1-204ENSMUST00000176630 4529 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Tmod1P49813 Madd-208ENSMUST00000111370 5879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Tmod1P49813 Madd-214ENSMUST00000111381 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Tmod1P49813 Baiap3-206ENSMUST00000182825 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Tmod1P49813 Zw10-201ENSMUST00000034803 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Tmod1P49813 Gm18210-201ENSMUST00000209001 1524 ntBASIC12.02□□□□□ -0.48
Tmod1P49813 Kat6b-201ENSMUST00000069648 7649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Tmod1P49813 Megf11-203ENSMUST00000118485 3944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Tmod1P49813 Myo18a-224ENSMUST00000172303 6339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Tmod1P49813 Arhgap33-204ENSMUST00000207860 4396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Tmod1P49813 C730027H18Rik-201ENSMUST00000218381 2300 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Tmod1P49813 Lrba-202ENSMUST00000192145 8843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Tmod1P49813 Recql-202ENSMUST00000100832 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Tmod1P49813 Igkv3-12-201ENSMUST00000103396 359 ntAPPRIS P1 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Tmod1P49813 Pfn1-202ENSMUST00000108549 608 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
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Tmod1P49813 Gm13783-201ENSMUST00000131634 732 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Tmod1P49813 4933417D19Rik-201ENSMUST00000181432 1229 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Tmod1P49813 Gm5210-201ENSMUST00000182150 1010 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Tmod1P49813 Nmbr-206ENSMUST00000190114 662 ntTSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Tmod1P49813 Gm20781-201ENSMUST00000193154 693 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Tmod1P49813 Gm21736-201ENSMUST00000195399 693 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Tmod1P49813 Gm5302-201ENSMUST00000202130 796 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Tmod1P49813 Fcer2a-206ENSMUST00000208438 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Tmod1P49813 Fcer2a-208ENSMUST00000208603 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Tmod1P49813 Gm45388-201ENSMUST00000209922 1132 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Tmod1P49813 Bpifa1-201ENSMUST00000028985 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Tmod1P49813 Cxcl1-201ENSMUST00000031327 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Tmod1P49813 Aven-202ENSMUST00000099588 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Tmod1P49813 Txlna-201ENSMUST00000046425 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
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Tmod1P49813 Cpne9-201ENSMUST00000041203 2777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Tmod1P49813 Zfp612-201ENSMUST00000058804 3180 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Tmod1P49813 Emc1-201ENSMUST00000042096 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Tmod1P49813 Arid2-201ENSMUST00000096250 8507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
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Tmod1P49813 Spata5-201ENSMUST00000029277 2890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Tmod1P49813 Prkd2-202ENSMUST00000168093 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Tmod1P49813 Reps1-210ENSMUST00000164556 2537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Tmod1P49813 Tmem109-201ENSMUST00000038128 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Tmod1P49813 Hcn1-201ENSMUST00000006991 14141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Tmod1P49813 Clu-201ENSMUST00000022616 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Tmod1P49813 Tubb1-201ENSMUST00000016399 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
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Tmod1P49813 Zfp809-201ENSMUST00000072465 1425 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Tmod1P49813 Igsf3-202ENSMUST00000195164 3876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Tmod1P49813 Limch1-201ENSMUST00000038188 5903 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
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Tmod1P49813 Dzip1l-203ENSMUST00000112885 4350 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Tmod1P49813 Pde3a-201ENSMUST00000043259 12302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Tmod1P49813 Rufy2-202ENSMUST00000119567 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Tmod1P49813 Schip1-202ENSMUST00000169909 1517 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Tmod1P49813 Htr1f-201ENSMUST00000063076 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Tmod1P49813 Prr30-202ENSMUST00000187304 2104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
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Tmod1P49813 Banf2-202ENSMUST00000110032 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
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Tmod1P49813 Rbm3os-201ENSMUST00000124018 839 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Tmod1P49813 Gm12069-201ENSMUST00000145127 806 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Tmod1P49813 Uckl1os-207ENSMUST00000152365 442 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Tmod1P49813 U2af1l4-218ENSMUST00000166960 747 ntTSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
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Tmod1P49813 1700063K16Rik-201ENSMUST00000190306 369 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Tmod1P49813 Gm19918-201ENSMUST00000194858 400 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Tmod1P49813 Myo1h-206ENSMUST00000196467 1208 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Tmod1P49813 Gm44753-202ENSMUST00000208297 562 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Tmod1P49813 Gm9758-201ENSMUST00000035980 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Tmod1P49813 Banf2-201ENSMUST00000037722 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Tmod1P49813 Rpl10-ps3-201ENSMUST00000076364 768 ntAPPRIS P1 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Tmod1P49813 Acyp1-201ENSMUST00000008966 648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Tmod1P49813 4930572O03Rik-201ENSMUST00000092696 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Tmod1P49813 Pnpla6-201ENSMUST00000004681 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Tmod1P49813 Gm20755-201ENSMUST00000196893 1827 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Tmod1P49813 Hsd3b6-201ENSMUST00000029463 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Tmod1P49813 Dnmt3aos-201ENSMUST00000144896 1385 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Tmod1P49813 Slc38a5-202ENSMUST00000115590 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Tmod1P49813 Ces2f-203ENSMUST00000212926 1430 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Tmod1P49813 Gm13583-202ENSMUST00000151931 1476 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Tmod1P49813 Thoc6-202ENSMUST00000095579 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
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