Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 Gm37301-201ENSMUST00000195412 568 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
VdrP48281 Gm43316-201ENSMUST00000197252 1295 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
VdrP48281 Gm44840-201ENSMUST00000208983 1168 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
VdrP48281 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
VdrP48281 Pbld1-204ENSMUST00000219045 602 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
VdrP48281 Tex35-201ENSMUST00000027884 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
VdrP48281 Atp6v1g1-201ENSMUST00000035301 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
VdrP48281 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
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VdrP48281 G630064G18Rik-201ENSMUST00000209814 1795 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
VdrP48281 Vmn2r18-201ENSMUST00000165928 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
VdrP48281 Gm26822-201ENSMUST00000181732 3374 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
VdrP48281 Gm37953-201ENSMUST00000195293 1884 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
VdrP48281 Slc18a1-201ENSMUST00000037478 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
VdrP48281 Fmod-201ENSMUST00000048183 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
VdrP48281 Cstf1-201ENSMUST00000116375 3451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
VdrP48281 Smg6-201ENSMUST00000045281 5848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
VdrP48281 Acsm5-205ENSMUST00000207440 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
VdrP48281 Myo18a-208ENSMUST00000108375 7513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
VdrP48281 Slx1b-203ENSMUST00000144897 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
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VdrP48281 Dip2c-202ENSMUST00000169960 4801 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
VdrP48281 Ptk2b-203ENSMUST00000111121 3365 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
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VdrP48281 Enpp5-201ENSMUST00000024756 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
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VdrP48281 D630029K05Rik-201ENSMUST00000033651 2133 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
VdrP48281 Slc7a1-201ENSMUST00000048116 7179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
VdrP48281 A830010M20Rik-208ENSMUST00000211896 5256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
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VdrP48281 Tyw1-202ENSMUST00000044204 4698 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
VdrP48281 Arhgap36-202ENSMUST00000114904 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
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VdrP48281 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
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VdrP48281 Gm11985-201ENSMUST00000122910 1007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
VdrP48281 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
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VdrP48281 Trub2-210ENSMUST00000177467 744 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
VdrP48281 Gm27441-201ENSMUST00000185000 105 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
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VdrP48281 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
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VdrP48281 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
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VdrP48281 Gm13561-201ENSMUST00000136879 1826 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
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VdrP48281 Tcn2-206ENSMUST00000109992 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
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VdrP48281 Sertm1-202ENSMUST00000162201 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
VdrP48281 Ms4a7-203ENSMUST00000067532 1334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
VdrP48281 B630019A10Rik-201ENSMUST00000149488 2407 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
VdrP48281 Tmprss2-201ENSMUST00000000395 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
VdrP48281 Nrp2-202ENSMUST00000063594 6342 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
VdrP48281 Pcdha6-201ENSMUST00000193389 4653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
VdrP48281 Dnajc14-202ENSMUST00000217745 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
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VdrP48281 Hmg20a-205ENSMUST00000215269 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
VdrP48281 Mefv-202ENSMUST00000100222 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
VdrP48281 C330027C09Rik-201ENSMUST00000048374 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
VdrP48281 Svil-204ENSMUST00000127297 6243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
VdrP48281 Hhip-201ENSMUST00000079038 9074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
VdrP48281 Gm14435-201ENSMUST00000108995 643 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
VdrP48281 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
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VdrP48281 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
VdrP48281 Gm8199-201ENSMUST00000121323 823 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
VdrP48281 Gm12176-201ENSMUST00000121420 875 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
VdrP48281 Gm5834-201ENSMUST00000126680 1026 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
VdrP48281 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
VdrP48281 Gm14662-201ENSMUST00000145552 734 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
VdrP48281 Gm26871-204ENSMUST00000181310 523 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
VdrP48281 Gm28746-201ENSMUST00000187453 380 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms