Protein–RNA interactions for Protein: P35123

Usp4, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 4, mousemouse

Predictions only

Length 962 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp4P35123 Gm22920-201ENSMUST00000102175 109 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Usp4P35123 Gm14193-201ENSMUST00000105067 153 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Usp4P35123 Krtap4-16-201ENSMUST00000107437 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Usp4P35123 Serf2-202ENSMUST00000110615 876 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Usp4P35123 Eapp-202ENSMUST00000110713 886 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Usp4P35123 Tatdn3-203ENSMUST00000110891 1214 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Usp4P35123 Tatdn3-204ENSMUST00000110893 1242 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Usp4P35123 Gm15264-201ENSMUST00000118050 502 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Usp4P35123 Gm15725-201ENSMUST00000119947 1090 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Usp4P35123 Sgcg-202ENSMUST00000121148 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Usp4P35123 Gm13182-201ENSMUST00000122241 312 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Usp4P35123 Gm15943-201ENSMUST00000147638 3821 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Usp4P35123 Gm16312-201ENSMUST00000156285 362 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Usp4P35123 Gm22442-201ENSMUST00000157256 144 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Usp4P35123 Rsph14-206ENSMUST00000166088 1203 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Usp4P35123 Coa3-202ENSMUST00000168089 291 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Usp4P35123 F12-202ENSMUST00000170921 478 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Usp4P35123 Rsph14-207ENSMUST00000179546 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Usp4P35123 1700088E04Rik-203ENSMUST00000186053 535 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Usp4P35123 BC026585-203ENSMUST00000193791 778 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Usp4P35123 Ccdc12-201ENSMUST00000019803 834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Usp4P35123 Dnajb6-212ENSMUST00000198694 505 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Usp4P35123 Crcp-204ENSMUST00000202163 931 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Usp4P35123 Gm44980-201ENSMUST00000205826 314 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Usp4P35123 CT025551.1-201ENSMUST00000223996 692 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Usp4P35123 AC129219.2-201ENSMUST00000224324 701 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Usp4P35123 CT025602.2-201ENSMUST00000226553 772 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Usp4P35123 Pvalb-201ENSMUST00000005860 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Usp4P35123 Hist1h1b-201ENSMUST00000080511 743 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Usp4P35123 Rsph14-201ENSMUST00000009214 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Usp4P35123 Brsk1-204ENSMUST00000205666 1398 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Usp4P35123 Slc45a4-202ENSMUST00000076224 4240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Usp4P35123 Asb1-201ENSMUST00000027538 5826 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Usp4P35123 Pla2g4a-201ENSMUST00000070200 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Usp4P35123 Gm7357-201ENSMUST00000195361 2991 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Usp4P35123 Gm26686-201ENSMUST00000181951 3467 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Usp4P35123 Abca2-201ENSMUST00000102919 8033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Usp4P35123 Prdm1-202ENSMUST00000105490 4025 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Usp4P35123 Ilf3-202ENSMUST00000115414 3606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Usp4P35123 Gm13857-203ENSMUST00000150561 2337 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Usp4P35123 Gm32219-201ENSMUST00000221234 1819 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Usp4P35123 Tmem181b-ps-201ENSMUST00000167717 1413 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Usp4P35123 Suclg2-204ENSMUST00000204224 3367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Usp4P35123 Il6st-201ENSMUST00000070731 5207 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Usp4P35123 Csf1r-202ENSMUST00000115268 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Usp4P35123 AI606181-201ENSMUST00000099454 2796 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Usp4P35123 Zfp873-203ENSMUST00000209622 2284 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Usp4P35123 Ly9-203ENSMUST00000111277 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Usp4P35123 Olfr1349-206ENSMUST00000213656 4492 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Usp4P35123 Fam84a-201ENSMUST00000020926 4164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Usp4P35123 Bcl2-202ENSMUST00000189999 2841 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Usp4P35123 Ass1-201ENSMUST00000102840 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Usp4P35123 Ampd2-203ENSMUST00000102638 3650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Usp4P35123 Lrp12-201ENSMUST00000022916 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Usp4P35123 Gm9915-201ENSMUST00000066196 1383 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Usp4P35123 Ccdc136-208ENSMUST00000180829 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Usp4P35123 Manea-201ENSMUST00000041374 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Usp4P35123 Pax3-201ENSMUST00000004994 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Usp4P35123 Krtap4-6-201ENSMUST00000100476 918 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Usp4P35123 Ccdc163-202ENSMUST00000106462 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Usp4P35123 Rps9-203ENSMUST00000108624 478 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Usp4P35123 Tnfrsf9-205ENSMUST00000116257 2115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Usp4P35123 Gm8111-201ENSMUST00000117659 987 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Usp4P35123 Gm8731-201ENSMUST00000118088 412 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Usp4P35123 Gm1848-201ENSMUST00000120711 789 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Usp4P35123 Tmem190-201ENSMUST00000013235 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Usp4P35123 Tmem204-202ENSMUST00000153745 902 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Usp4P35123 Prss36-208ENSMUST00000156152 1132 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Usp4P35123 Gm15523-201ENSMUST00000160463 439 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Usp4P35123 Gm3150-201ENSMUST00000166418 204 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Usp4P35123 Slc22a14-204ENSMUST00000170400 2110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Usp4P35123 H2-M2-202ENSMUST00000171139 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Usp4P35123 Gm23153-201ENSMUST00000175323 313 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Usp4P35123 Gm21778-201ENSMUST00000178779 471 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Usp4P35123 Gm26838-201ENSMUST00000180485 911 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Usp4P35123 Gm29067-201ENSMUST00000190821 470 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Usp4P35123 Ighv5-11-201ENSMUST00000193354 371 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Usp4P35123 Gm43852-201ENSMUST00000202098 917 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Usp4P35123 Gm44421-201ENSMUST00000205064 1221 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Usp4P35123 AC159462.1-201ENSMUST00000214822 687 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Usp4P35123 5830428M24Rik-204ENSMUST00000223143 1034 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Usp4P35123 Odf3-201ENSMUST00000026555 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Usp4P35123 Apoc4-201ENSMUST00000003071 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Usp4P35123 Tbca-201ENSMUST00000046644 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Usp4P35123 Hcst-201ENSMUST00000075062 442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Usp4P35123 Arl16-201ENSMUST00000076921 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Usp4P35123 Gm5879-201ENSMUST00000089501 1209 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Usp4P35123 Vmn1r212-201ENSMUST00000095960 1164 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Usp4P35123 Tpp2-201ENSMUST00000087933 4649 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Usp4P35123 Hist2h4-201ENSMUST00000171473 1630 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Usp4P35123 Pigc-205ENSMUST00000193784 4207 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Usp4P35123 Gm26737-201ENSMUST00000181106 2151 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Usp4P35123 Mecom-202ENSMUST00000108270 5692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Usp4P35123 Gm37242-201ENSMUST00000191873 2085 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Usp4P35123 Arfgap3-201ENSMUST00000067215 2619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Usp4P35123 4930488L21Rik-202ENSMUST00000212638 3164 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Usp4P35123 C2cd5-201ENSMUST00000087485 4265 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Usp4P35123 Abcb8-203ENSMUST00000115077 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Usp4P35123 Imp4-201ENSMUST00000027303 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Usp4P35123 Sema4g-201ENSMUST00000026225 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.1 ms