Protein–RNA interactions for Protein: P28033

Cebpb, CCAAT/enhancer-binding protein beta, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CebpbP28033 Nell2-202ENSMUST00000166170 3366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
CebpbP28033 Phf24-202ENSMUST00000107975 6494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
CebpbP28033 Gm13990-201ENSMUST00000151391 2701 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
CebpbP28033 Foxp1-221ENSMUST00000176632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
CebpbP28033 Foxp1-222ENSMUST00000176850 2339 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
CebpbP28033 4930579F01Rik-201ENSMUST00000012186 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CebpbP28033 Fhitos-201ENSMUST00000160149 1511 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CebpbP28033 Rps9-202ENSMUST00000108623 1347 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CebpbP28033 Gm38901-201ENSMUST00000202448 3008 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CebpbP28033 Kcnk10-201ENSMUST00000110113 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CebpbP28033 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CebpbP28033 Tanc1-201ENSMUST00000037526 7873 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
CebpbP28033 Cklf-202ENSMUST00000098464 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CebpbP28033 Cttnbp2nl-201ENSMUST00000077548 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CebpbP28033 Ighv1-81-201ENSMUST00000103548 351 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
CebpbP28033 Lime1-202ENSMUST00000108804 960 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
CebpbP28033 Ccl19-ps1-201ENSMUST00000119621 327 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
CebpbP28033 Gm11736-201ENSMUST00000121468 505 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
CebpbP28033 Mup-ps29-201ENSMUST00000122281 202 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
CebpbP28033 Pradc1-204ENSMUST00000126805 953 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
CebpbP28033 3010001F23Rik-201ENSMUST00000130625 876 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CebpbP28033 Gm13817-201ENSMUST00000142249 604 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
CebpbP28033 Gm28671-201ENSMUST00000187036 692 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
CebpbP28033 Gm8643-201ENSMUST00000195228 625 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
CebpbP28033 Gm42867-201ENSMUST00000202995 469 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
CebpbP28033 Mt1-203ENSMUST00000212291 633 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
CebpbP28033 Olfr1335-202ENSMUST00000219094 1148 ntAPPRIS P2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
CebpbP28033 AC101205.2-201ENSMUST00000226206 715 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
CebpbP28033 4930553M12Rik-201ENSMUST00000057837 498 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
CebpbP28033 Rpl9-201ENSMUST00000057885 738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CebpbP28033 Olfr1335-201ENSMUST00000084313 1148 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
CebpbP28033 Gm10228-201ENSMUST00000089105 532 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
CebpbP28033 Tm9sf1-202ENSMUST00000120041 2164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
CebpbP28033 Gm3836-201ENSMUST00000211377 1613 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
CebpbP28033 Tex45-201ENSMUST00000047265 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
CebpbP28033 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CebpbP28033 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CebpbP28033 Gm26615-201ENSMUST00000181522 3201 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
CebpbP28033 Lclat1-201ENSMUST00000067545 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CebpbP28033 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CebpbP28033 Pif1-203ENSMUST00000134538 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CebpbP28033 Zfp85os-202ENSMUST00000143812 1784 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CebpbP28033 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CebpbP28033 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CebpbP28033 Ccm2-202ENSMUST00000109721 1551 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
CebpbP28033 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CebpbP28033 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CebpbP28033 Far2-201ENSMUST00000032443 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CebpbP28033 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CebpbP28033 Dis3l-201ENSMUST00000068367 3605 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CebpbP28033 Gm5739-201ENSMUST00000208601 1703 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
CebpbP28033 Shoc2-201ENSMUST00000025932 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CebpbP28033 Ttll10-206ENSMUST00000184348 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
CebpbP28033 Add2-204ENSMUST00000203366 3407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
CebpbP28033 Ifnar1-201ENSMUST00000023689 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CebpbP28033 Epha6-201ENSMUST00000068860 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CebpbP28033 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CebpbP28033 Cyp2d41-ps-201ENSMUST00000180453 1503 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
CebpbP28033 Supt3-201ENSMUST00000050630 1508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
CebpbP28033 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
CebpbP28033 Bpifb1-202ENSMUST00000081816 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
CebpbP28033 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
CebpbP28033 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
CebpbP28033 Crispld2-202ENSMUST00000108972 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
CebpbP28033 Gm20498-203ENSMUST00000166664 2284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
CebpbP28033 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
CebpbP28033 Gphb5-201ENSMUST00000051079 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
CebpbP28033 Ophn1-201ENSMUST00000033560 7170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
CebpbP28033 Bglap3-203ENSMUST00000107543 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
CebpbP28033 Ncbp2-202ENSMUST00000115178 515 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
CebpbP28033 Itpa-ps1-201ENSMUST00000117207 597 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
CebpbP28033 Gm15976-201ENSMUST00000129701 429 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
CebpbP28033 Tcl1-203ENSMUST00000175652 535 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
CebpbP28033 1110020A21Rik-201ENSMUST00000181147 853 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
CebpbP28033 1700088E04Rik-207ENSMUST00000188562 631 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
CebpbP28033 Gm38233-201ENSMUST00000194259 807 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
CebpbP28033 Gm44939-201ENSMUST00000206939 814 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
CebpbP28033 3930402G23Rik-202ENSMUST00000208615 581 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
CebpbP28033 Gm9644-201ENSMUST00000212828 1183 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
CebpbP28033 Gm32872-201ENSMUST00000220037 205 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
CebpbP28033 CT030035.1-201ENSMUST00000223964 935 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
CebpbP28033 Sectm1b-202ENSMUST00000081499 1222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
CebpbP28033 Gm25514-201ENSMUST00000083860 135 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
CebpbP28033 Ccdc30-203ENSMUST00000084307 989 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
CebpbP28033 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
CebpbP28033 Gm44153-201ENSMUST00000204162 1580 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
CebpbP28033 Gm12333-201ENSMUST00000155508 2669 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
CebpbP28033 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
CebpbP28033 Csde1-207ENSMUST00000197827 2671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
CebpbP28033 Phka2-203ENSMUST00000112377 3947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
CebpbP28033 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
CebpbP28033 Pigb-202ENSMUST00000098566 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
CebpbP28033 Hottip-201ENSMUST00000141300 2346 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
CebpbP28033 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
CebpbP28033 Gm45124-201ENSMUST00000206723 2755 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
CebpbP28033 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
CebpbP28033 Kirrel3-209ENSMUST00000190549 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
CebpbP28033 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
CebpbP28033 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
CebpbP28033 Aldh16a1-206ENSMUST00000209963 3537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms