Protein–RNA interactions for Protein: P04230

H2-Eb1, H-2 class II histocompatibility antigen, E-B beta chain, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb1P04230 Gpr149-201ENSMUST00000058535 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
H2-Eb1P04230 Mapkbp1-201ENSMUST00000066058 6942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
H2-Eb1P04230 Zbtb43-203ENSMUST00000113156 1828 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
H2-Eb1P04230 Gm16429-202ENSMUST00000201400 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
H2-Eb1P04230 Gm7971-201ENSMUST00000086950 1848 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
H2-Eb1P04230 Pou2f1-204ENSMUST00000111426 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
H2-Eb1P04230 Polh-201ENSMUST00000024749 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
H2-Eb1P04230 Pde2a-201ENSMUST00000163751 4218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
H2-Eb1P04230 Nrf1-208ENSMUST00000115208 2492 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
H2-Eb1P04230 Gm5122-202ENSMUST00000216854 1637 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
H2-Eb1P04230 Tom1l2-203ENSMUST00000093048 4864 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
H2-Eb1P04230 Exoc7-202ENSMUST00000106411 3205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
H2-Eb1P04230 Zfand2a-201ENSMUST00000079996 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
H2-Eb1P04230 Ptcd1-201ENSMUST00000031628 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
H2-Eb1P04230 Gramd1b-212ENSMUST00000165104 3824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
H2-Eb1P04230 Polr1e-203ENSMUST00000107814 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
H2-Eb1P04230 Gm39464-201ENSMUST00000214091 2169 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
H2-Eb1P04230 Gm43274-201ENSMUST00000202545 5000 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
H2-Eb1P04230 Fbxl5-202ENSMUST00000087465 4237 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
H2-Eb1P04230 Ankrd52-201ENSMUST00000014642 6620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
H2-Eb1P04230 Gm37516-201ENSMUST00000192593 1954 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
H2-Eb1P04230 Gm29684-201ENSMUST00000220248 1982 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
H2-Eb1P04230 Ighv5-9-201ENSMUST00000103448 418 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
H2-Eb1P04230 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
H2-Eb1P04230 Gm11411-201ENSMUST00000117951 719 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
H2-Eb1P04230 Sec11a-204ENSMUST00000120285 875 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
H2-Eb1P04230 Rpsa-ps12-201ENSMUST00000120596 892 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
H2-Eb1P04230 Dmrtc1a-204ENSMUST00000121197 1067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
H2-Eb1P04230 Rpl28-ps1-201ENSMUST00000121497 414 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
H2-Eb1P04230 Gm13605-201ENSMUST00000124489 658 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
H2-Eb1P04230 Smim6-201ENSMUST00000132961 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
H2-Eb1P04230 Gm10051-201ENSMUST00000145209 414 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
H2-Eb1P04230 Gm25343-201ENSMUST00000157460 107 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
H2-Eb1P04230 Tbc1d22bos-201ENSMUST00000159875 826 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
H2-Eb1P04230 Gm17115-201ENSMUST00000164075 885 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
H2-Eb1P04230 Psmb6-201ENSMUST00000018430 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
H2-Eb1P04230 Gm29560-201ENSMUST00000191526 881 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
H2-Eb1P04230 Gm37800-202ENSMUST00000193667 553 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
H2-Eb1P04230 Gm37458-201ENSMUST00000194055 410 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
H2-Eb1P04230 Gm43163-201ENSMUST00000196571 442 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
H2-Eb1P04230 Gm44698-201ENSMUST00000207382 384 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
H2-Eb1P04230 Gm8162-201ENSMUST00000213951 665 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
H2-Eb1P04230 BX649293.1-201ENSMUST00000227437 631 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
H2-Eb1P04230 Apc-201ENSMUST00000066133 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
H2-Eb1P04230 Stard4-201ENSMUST00000025236 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
H2-Eb1P04230 Cryz-201ENSMUST00000029850 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
H2-Eb1P04230 Gm15631-201ENSMUST00000142962 2436 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
H2-Eb1P04230 Gm10463-202ENSMUST00000195772 2889 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
H2-Eb1P04230 AC158355.1-201ENSMUST00000215895 1705 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
H2-Eb1P04230 Pck2-201ENSMUST00000048781 3400 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
H2-Eb1P04230 Gm20715-201ENSMUST00000054781 4460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
H2-Eb1P04230 Copz1-201ENSMUST00000100162 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
H2-Eb1P04230 Nfic-201ENSMUST00000020461 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
H2-Eb1P04230 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
H2-Eb1P04230 Gm7168-201ENSMUST00000088809 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
H2-Eb1P04230 Arhgef10-202ENSMUST00000110800 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
H2-Eb1P04230 Phf8-203ENSMUST00000112662 3732 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
H2-Eb1P04230 Gnas-223ENSMUST00000185956 3729 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
H2-Eb1P04230 Gnas-224ENSMUST00000186907 3729 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
H2-Eb1P04230 Zfp114-203ENSMUST00000206547 3154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
H2-Eb1P04230 Gm498-202ENSMUST00000152910 1507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
H2-Eb1P04230 Gm10614-201ENSMUST00000181414 2538 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
H2-Eb1P04230 Aplp2-202ENSMUST00000079758 3504 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
H2-Eb1P04230 Gm29101-201ENSMUST00000188329 1471 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
H2-Eb1P04230 Cyp26b1-205ENSMUST00000205228 4288 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
H2-Eb1P04230 Plrg1-204ENSMUST00000150268 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
H2-Eb1P04230 Wdr60-201ENSMUST00000039349 3721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
H2-Eb1P04230 Bace2-201ENSMUST00000047275 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
H2-Eb1P04230 Zc3h12a-201ENSMUST00000036188 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
H2-Eb1P04230 Plcxd2-201ENSMUST00000130481 7140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
H2-Eb1P04230 Gm6655-201ENSMUST00000201932 1309 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
H2-Eb1P04230 Mrps23-201ENSMUST00000024486 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
H2-Eb1P04230 Gm9387-201ENSMUST00000098624 1320 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
H2-Eb1P04230 Tcaf1-202ENSMUST00000045140 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
H2-Eb1P04230 Gm364-201ENSMUST00000114725 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
H2-Eb1P04230 Platr4-203ENSMUST00000199155 2161 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
H2-Eb1P04230 Gm43372-201ENSMUST00000202662 3016 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
H2-Eb1P04230 Cnr2-202ENSMUST00000097843 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
H2-Eb1P04230 Adcy6-201ENSMUST00000096224 6038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
H2-Eb1P04230 Lrrn4cl-201ENSMUST00000096257 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
H2-Eb1P04230 Rpl23-201ENSMUST00000103146 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
H2-Eb1P04230 Cdc42se1-204ENSMUST00000107201 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
H2-Eb1P04230 Adig-202ENSMUST00000109484 488 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
H2-Eb1P04230 Gm14314-201ENSMUST00000118225 1015 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
H2-Eb1P04230 Gm15554-201ENSMUST00000120406 913 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
H2-Eb1P04230 Gm11952-201ENSMUST00000121172 821 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
H2-Eb1P04230 Gm3828-201ENSMUST00000121817 257 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
H2-Eb1P04230 Bach2it1-201ENSMUST00000133451 481 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
H2-Eb1P04230 Gm17231-202ENSMUST00000165858 663 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
H2-Eb1P04230 Rpain-201ENSMUST00000018593 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
H2-Eb1P04230 Gm35584-201ENSMUST00000191767 641 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
H2-Eb1P04230 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
H2-Eb1P04230 Gm43671-201ENSMUST00000200422 433 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
H2-Eb1P04230 Gm13522-202ENSMUST00000209682 997 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
H2-Eb1P04230 Thyn1-202ENSMUST00000213683 1107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
H2-Eb1P04230 Gm4065-202ENSMUST00000218911 986 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
H2-Eb1P04230 Adig-201ENSMUST00000059889 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
H2-Eb1P04230 Gm25580-201ENSMUST00000083409 327 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
H2-Eb1P04230 Gpr155-204ENSMUST00000112044 4201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
H2-Eb1P04230 Adat1-202ENSMUST00000120457 1677 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59 ms