Protein–RNA interactions for Protein: F8VQC1

Srp72, Signal recognition particle subunit SRP72, mousemouse

Predictions only

Length 671 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp72F8VQC1 Gm10051-201ENSMUST00000145209 414 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Srp72F8VQC1 Gm16275-201ENSMUST00000147774 712 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Srp72F8VQC1 Gm15764-201ENSMUST00000150389 672 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Srp72F8VQC1 Mrgpra2a-201ENSMUST00000159004 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Srp72F8VQC1 Hmgn3-201ENSMUST00000161796 862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Srp72F8VQC1 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Srp72F8VQC1 Wdr53-204ENSMUST00000178573 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Srp72F8VQC1 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Srp72F8VQC1 Qdpr-209ENSMUST00000198258 1172 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Srp72F8VQC1 Gm30946-201ENSMUST00000198288 724 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Srp72F8VQC1 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Srp72F8VQC1 Polr1d-204ENSMUST00000200993 1167 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Srp72F8VQC1 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Srp72F8VQC1 CT485606.1-201ENSMUST00000213187 878 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Srp72F8VQC1 CT010506.1-201ENSMUST00000223673 349 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Srp72F8VQC1 AC154589.2-201ENSMUST00000228847 251 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Srp72F8VQC1 Capn8-201ENSMUST00000048941 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Srp72F8VQC1 Spg20-203ENSMUST00000117341 2957 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Srp72F8VQC1 Rtn4ip1-201ENSMUST00000054418 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Srp72F8VQC1 Clasp1-208ENSMUST00000187713 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Srp72F8VQC1 Nek4-207ENSMUST00000228328 4245 ntAPPRIS P2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Srp72F8VQC1 2410004P03Rik-201ENSMUST00000095823 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Srp72F8VQC1 Srpx2-201ENSMUST00000033606 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Srp72F8VQC1 Nol8-209ENSMUST00000223467 4765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Srp72F8VQC1 Cenpj-203ENSMUST00000225951 4756 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Srp72F8VQC1 Phf21a-202ENSMUST00000068702 6023 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Srp72F8VQC1 Pabpc4-201ENSMUST00000078734 2700 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Srp72F8VQC1 Pcdh11x-202ENSMUST00000113358 8607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Srp72F8VQC1 Eya2-201ENSMUST00000063433 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Srp72F8VQC1 Qrfpr-203ENSMUST00000197447 1690 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Srp72F8VQC1 Ano1-202ENSMUST00000118556 4566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Srp72F8VQC1 Sall2-201ENSMUST00000058326 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Srp72F8VQC1 Lrrc8a-201ENSMUST00000095078 4301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Srp72F8VQC1 Glb1l-201ENSMUST00000113623 2339 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Srp72F8VQC1 Gfra2-203ENSMUST00000227697 1323 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Srp72F8VQC1 Pld5-203ENSMUST00000111167 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Srp72F8VQC1 Smco1-201ENSMUST00000093183 1408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Srp72F8VQC1 Gm32511-202ENSMUST00000217021 2069 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Srp72F8VQC1 Slc6a5-203ENSMUST00000207753 6966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Srp72F8VQC1 Ern2-201ENSMUST00000033153 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Srp72F8VQC1 Ap1m2-201ENSMUST00000003397 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Srp72F8VQC1 Nrf1-208ENSMUST00000115208 2492 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Srp72F8VQC1 Elmo2-201ENSMUST00000071699 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Srp72F8VQC1 Atp6v0a4-202ENSMUST00000114908 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Srp72F8VQC1 Gm15264-201ENSMUST00000118050 502 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Srp72F8VQC1 Gm16166-201ENSMUST00000118291 787 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Srp72F8VQC1 Sgcg-202ENSMUST00000121148 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Srp72F8VQC1 Olfr647-ps1-201ENSMUST00000121599 960 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Srp72F8VQC1 Nhp2-202ENSMUST00000127405 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Srp72F8VQC1 4930571N24Rik-202ENSMUST00000142914 598 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Srp72F8VQC1 Gm12951-201ENSMUST00000150216 434 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Srp72F8VQC1 Gm17709-201ENSMUST00000174536 1096 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Srp72F8VQC1 Apoe-210ENSMUST00000174710 514 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Srp72F8VQC1 Ly6e-203ENSMUST00000185861 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Srp72F8VQC1 Gm28287-201ENSMUST00000186612 546 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Srp72F8VQC1 Gm7271-202ENSMUST00000191515 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Srp72F8VQC1 Gm37826-201ENSMUST00000195329 322 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Srp72F8VQC1 4933408A14Rik-201ENSMUST00000199037 729 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Srp72F8VQC1 Gm21057-202ENSMUST00000206111 512 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Srp72F8VQC1 Ticam1-201ENSMUST00000058136 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Srp72F8VQC1 Apc-201ENSMUST00000066133 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Srp72F8VQC1 Mok-203ENSMUST00000084974 1132 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Srp72F8VQC1 Olfr1250-201ENSMUST00000099768 1139 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Srp72F8VQC1 Arih2-201ENSMUST00000013338 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Srp72F8VQC1 Ptcd1-201ENSMUST00000031628 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Srp72F8VQC1 A930006I01Rik-201ENSMUST00000139065 2229 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Srp72F8VQC1 4921513H07Rik-201ENSMUST00000201403 2238 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Srp72F8VQC1 Hsdl1-204ENSMUST00000212517 2215 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Srp72F8VQC1 Polr3b-201ENSMUST00000077175 4975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Srp72F8VQC1 Pstpip2-201ENSMUST00000114741 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Srp72F8VQC1 Prkaca-202ENSMUST00000211558 1399 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Srp72F8VQC1 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Srp72F8VQC1 Thoc6-202ENSMUST00000095579 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Srp72F8VQC1 Pgf-201ENSMUST00000004913 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Srp72F8VQC1 Krt33b-201ENSMUST00000073890 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Srp72F8VQC1 Rdh11-201ENSMUST00000085254 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Srp72F8VQC1 Gm5124-202ENSMUST00000132683 2083 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Srp72F8VQC1 Abcg1-201ENSMUST00000024829 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Srp72F8VQC1 Il17rd-201ENSMUST00000035336 8280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Srp72F8VQC1 Gm13694-201ENSMUST00000178533 2493 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Srp72F8VQC1 Gm13693-201ENSMUST00000178960 2493 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Srp72F8VQC1 Gm13698-202ENSMUST00000179192 2493 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Srp72F8VQC1 Gm13696-202ENSMUST00000180347 2493 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Srp72F8VQC1 Gm13691-201ENSMUST00000099947 2493 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Srp72F8VQC1 Gm13697-201ENSMUST00000099948 2493 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Srp72F8VQC1 Gm13695-201ENSMUST00000099951 2493 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Srp72F8VQC1 Rbbp5-201ENSMUST00000027700 3385 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Srp72F8VQC1 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.71
Srp72F8VQC1 Foxh1-201ENSMUST00000037824 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.71
Srp72F8VQC1 Setbp1-201ENSMUST00000025430 9953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Srp72F8VQC1 E330034L11Rik-201ENSMUST00000200640 1742 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Srp72F8VQC1 Gfi1b-204ENSMUST00000164290 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Srp72F8VQC1 Mmp19-203ENSMUST00000219404 2236 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Srp72F8VQC1 Gm28693-201ENSMUST00000189622 2638 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Srp72F8VQC1 Prkx-201ENSMUST00000036333 4146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Srp72F8VQC1 Znrf1-202ENSMUST00000166859 3650 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Srp72F8VQC1 Cep112-201ENSMUST00000061287 3485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Srp72F8VQC1 Sox13-203ENSMUST00000144386 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Srp72F8VQC1 March10-204ENSMUST00000138977 2979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Srp72F8VQC1 Grip1-216ENSMUST00000154238 2482 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms