Protein–RNA interactions for Protein: B2RU80

Ptprb, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,998 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprbB2RU80 Gm8122-201ENSMUST00000165988 1404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
PtprbB2RU80 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
PtprbB2RU80 Ptp4a3-203ENSMUST00000165541 3539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
PtprbB2RU80 Atp5s-204ENSMUST00000220916 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
PtprbB2RU80 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
PtprbB2RU80 Bsnd-201ENSMUST00000054472 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
PtprbB2RU80 Slc25a42-202ENSMUST00000110127 3196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
PtprbB2RU80 Tmc7-201ENSMUST00000044195 4546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
PtprbB2RU80 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
PtprbB2RU80 Kyat1-201ENSMUST00000044038 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
PtprbB2RU80 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
PtprbB2RU80 Rcbtb2-219ENSMUST00000169513 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
PtprbB2RU80 Gm12829-201ENSMUST00000146346 2434 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
PtprbB2RU80 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
PtprbB2RU80 Pde1b-205ENSMUST00000227955 3258 ntAPPRIS ALT1 BASIC9.61□□□□□ -0.87
PtprbB2RU80 Krt75-201ENSMUST00000042957 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
PtprbB2RU80 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
PtprbB2RU80 Csf1-201ENSMUST00000014743 4176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
PtprbB2RU80 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
PtprbB2RU80 AC160060.1-201ENSMUST00000217840 1813 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
PtprbB2RU80 Slc25a48-201ENSMUST00000021971 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
PtprbB2RU80 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
PtprbB2RU80 Ltc4s-201ENSMUST00000101265 480 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
PtprbB2RU80 Gm12028-201ENSMUST00000118065 436 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
PtprbB2RU80 Gm14997-201ENSMUST00000119232 636 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
PtprbB2RU80 2410152P15Rik-201ENSMUST00000137405 871 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
PtprbB2RU80 Gm15258-201ENSMUST00000153801 741 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
PtprbB2RU80 Gm6686-201ENSMUST00000178455 258 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
PtprbB2RU80 Mir133a-1hg-201ENSMUST00000179771 395 ntTSL 3 BASIC9.61□□□□□ -0.87
PtprbB2RU80 BB187690-201ENSMUST00000198619 1176 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
PtprbB2RU80 Gm45875-201ENSMUST00000212178 781 ntTSL 3 BASIC9.61□□□□□ -0.87
PtprbB2RU80 Elfn1-201ENSMUST00000050519 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
PtprbB2RU80 Zfp868-201ENSMUST00000074982 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
PtprbB2RU80 Pgk1-rs7-201ENSMUST00000085735 1255 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
PtprbB2RU80 Tasp1-203ENSMUST00000110079 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
PtprbB2RU80 Gm20696-201ENSMUST00000155466 3560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.61□□□□□ -0.87
PtprbB2RU80 Nr4a2-201ENSMUST00000028166 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
PtprbB2RU80 4930555A03Rik-201ENSMUST00000196052 1556 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
PtprbB2RU80 Dcun1d2-201ENSMUST00000045366 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
PtprbB2RU80 Nmrk2-201ENSMUST00000005069 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
PtprbB2RU80 Poldip3-202ENSMUST00000100375 3157 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
PtprbB2RU80 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
PtprbB2RU80 Tube1-201ENSMUST00000019991 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
PtprbB2RU80 Mmel1-202ENSMUST00000080559 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
PtprbB2RU80 Atf3-203ENSMUST00000195117 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
PtprbB2RU80 Pphln1-201ENSMUST00000049122 4023 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
PtprbB2RU80 Atp1a2-202ENSMUST00000097464 3186 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
PtprbB2RU80 4930566F21Rik-201ENSMUST00000201177 1535 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
PtprbB2RU80 Axl-201ENSMUST00000002677 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
PtprbB2RU80 Pomt1-201ENSMUST00000036473 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
PtprbB2RU80 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
PtprbB2RU80 Herc4-201ENSMUST00000020258 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
PtprbB2RU80 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
PtprbB2RU80 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
PtprbB2RU80 C920021L13Rik-201ENSMUST00000120398 1723 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
PtprbB2RU80 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
PtprbB2RU80 Gtf3c6-206ENSMUST00000217537 2526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
PtprbB2RU80 Qsox1-201ENSMUST00000035325 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
PtprbB2RU80 Plpp3-201ENSMUST00000064139 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
PtprbB2RU80 Gm20425-201ENSMUST00000166836 3028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
PtprbB2RU80 Gm7861-201ENSMUST00000110749 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
PtprbB2RU80 Gm7849-201ENSMUST00000110752 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
PtprbB2RU80 Gm15636-201ENSMUST00000119205 668 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
PtprbB2RU80 Gm14176-201ENSMUST00000121302 477 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
PtprbB2RU80 Gm13842-202ENSMUST00000156331 865 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
PtprbB2RU80 Bud31-203ENSMUST00000160075 928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
PtprbB2RU80 Gm26725-201ENSMUST00000180652 1113 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
PtprbB2RU80 Gm29543-201ENSMUST00000188138 967 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
PtprbB2RU80 Gm44196-203ENSMUST00000204359 1190 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
PtprbB2RU80 Gm32939-201ENSMUST00000222336 843 ntTSL 3 BASIC9.6□□□□□ -0.87
PtprbB2RU80 AC116797.2-202ENSMUST00000223587 1017 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
PtprbB2RU80 AC103672.1-201ENSMUST00000227502 365 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
PtprbB2RU80 AC141884.2-201ENSMUST00000228811 775 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
PtprbB2RU80 Mageb4-202ENSMUST00000113969 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
PtprbB2RU80 Gm42833-201ENSMUST00000196019 2124 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
PtprbB2RU80 Mcemp1-201ENSMUST00000014118 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
PtprbB2RU80 Jaml-201ENSMUST00000050020 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
PtprbB2RU80 Gm19951-201ENSMUST00000222616 1328 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
PtprbB2RU80 Ahnak2-201ENSMUST00000101010 2821 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
PtprbB2RU80 Vasn-201ENSMUST00000038770 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
PtprbB2RU80 Pde6c-202ENSMUST00000112329 2895 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
PtprbB2RU80 Tmprss5-202ENSMUST00000165088 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
PtprbB2RU80 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
PtprbB2RU80 Rcor3-202ENSMUST00000110849 3791 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
PtprbB2RU80 Hmg20a-205ENSMUST00000215269 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
PtprbB2RU80 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
PtprbB2RU80 Prox1-203ENSMUST00000177288 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
PtprbB2RU80 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
PtprbB2RU80 Atp6v1a-201ENSMUST00000063661 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
PtprbB2RU80 Srsf6-203ENSMUST00000130411 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
PtprbB2RU80 Pced1b-204ENSMUST00000228521 1790 ntAPPRIS P1 BASIC9.59□□□□□ -0.87
PtprbB2RU80 Trav13-2-201ENSMUST00000103658 390 ntAPPRIS P1 BASIC9.59□□□□□ -0.87
PtprbB2RU80 1700071K01Rik-201ENSMUST00000117522 819 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
PtprbB2RU80 Gm15815-201ENSMUST00000120569 255 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
PtprbB2RU80 Mir1896-201ENSMUST00000122641 81 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
PtprbB2RU80 Gm829-201ENSMUST00000123741 465 ntTSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
PtprbB2RU80 Gm45716-201ENSMUST00000124877 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
PtprbB2RU80 Gm14717-201ENSMUST00000140450 649 ntTSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
PtprbB2RU80 2010204K13Rik-203ENSMUST00000150671 885 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
PtprbB2RU80 Gm22388-201ENSMUST00000158194 248 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms