Protein–RNA interactions for Protein: B2RPU8

Zbed5, MCG130675, mousemouse

Predictions only

Length 756 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed5B2RPU8 Gm43972-201ENSMUST00000181398 1467 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Zbed5B2RPU8 A530053M12Rik-201ENSMUST00000187918 1467 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Zbed5B2RPU8 Cd276-201ENSMUST00000039788 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Zbed5B2RPU8 Dclk1-204ENSMUST00000196745 7962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Zbed5B2RPU8 Zswim9-201ENSMUST00000108532 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Zbed5B2RPU8 Tex13c1-201ENSMUST00000105113 2074 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Zbed5B2RPU8 Acsm2-202ENSMUST00000098084 2099 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Zbed5B2RPU8 Ano10-203ENSMUST00000214409 2384 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Zbed5B2RPU8 Hspa5-201ENSMUST00000028222 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Zbed5B2RPU8 Tmem130-201ENSMUST00000061446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Zbed5B2RPU8 Gm18210-201ENSMUST00000209001 1524 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Zbed5B2RPU8 Kcnh3-201ENSMUST00000041415 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Zbed5B2RPU8 Gm10848-201ENSMUST00000192361 1811 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Zbed5B2RPU8 Mybph-201ENSMUST00000038445 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Zbed5B2RPU8 Hsh2d-201ENSMUST00000072097 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Zbed5B2RPU8 Vwa5b2-207ENSMUST00000159780 4042 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Zbed5B2RPU8 Sptbn5-204ENSMUST00000156159 3625 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Zbed5B2RPU8 Ostm1-202ENSMUST00000105497 770 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Zbed5B2RPU8 Cisd3-203ENSMUST00000107585 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Zbed5B2RPU8 Cdk5rap1-202ENSMUST00000109730 1227 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Zbed5B2RPU8 Rbfox1-202ENSMUST00000115841 1191 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Zbed5B2RPU8 Gm6322-201ENSMUST00000118789 1004 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Zbed5B2RPU8 Gm9673-201ENSMUST00000119287 781 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Zbed5B2RPU8 Gm15620-201ENSMUST00000122949 270 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Zbed5B2RPU8 4930502E09Rik-201ENSMUST00000126016 755 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Zbed5B2RPU8 Gm14718-201ENSMUST00000138082 752 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Zbed5B2RPU8 Nudt12os-201ENSMUST00000145848 939 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Zbed5B2RPU8 Prr33-202ENSMUST00000151580 399 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Zbed5B2RPU8 Gstt3-203ENSMUST00000173537 687 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Zbed5B2RPU8 Gm9507-202ENSMUST00000180157 654 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Zbed5B2RPU8 Gm17597-201ENSMUST00000181220 1115 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Zbed5B2RPU8 Gm27003-201ENSMUST00000182590 497 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Zbed5B2RPU8 Calm5-202ENSMUST00000184271 423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Zbed5B2RPU8 Gm29067-201ENSMUST00000190821 470 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Zbed5B2RPU8 Mrpl30-207ENSMUST00000195373 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Zbed5B2RPU8 Adipoq-201ENSMUST00000023593 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Zbed5B2RPU8 Crygb-201ENSMUST00000027090 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Zbed5B2RPU8 Ncdn-201ENSMUST00000030637 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Zbed5B2RPU8 Scamp2-201ENSMUST00000045791 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Zbed5B2RPU8 Uqcc3-201ENSMUST00000096253 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Zbed5B2RPU8 Rcbtb2-223ENSMUST00000170677 3573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Zbed5B2RPU8 Tfip11-201ENSMUST00000031288 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Zbed5B2RPU8 Exosc10-202ENSMUST00000076022 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Zbed5B2RPU8 Lcorl-205ENSMUST00000121573 2378 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Zbed5B2RPU8 Riox2-202ENSMUST00000120667 2200 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Zbed5B2RPU8 Azin1-203ENSMUST00000110329 4217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Zbed5B2RPU8 Spesp1-201ENSMUST00000056949 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Zbed5B2RPU8 Myh13-203ENSMUST00000180845 5991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Zbed5B2RPU8 Gm5434-202ENSMUST00000222384 1451 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Zbed5B2RPU8 Gm5434-201ENSMUST00000071825 1451 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Zbed5B2RPU8 Fdft1-201ENSMUST00000054963 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Zbed5B2RPU8 Ncf1-202ENSMUST00000111275 2721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Zbed5B2RPU8 Bmp5-201ENSMUST00000012281 3822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Zbed5B2RPU8 Unc79-202ENSMUST00000101099 8874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Zbed5B2RPU8 Gpr101-201ENSMUST00000057645 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Zbed5B2RPU8 Cep250-204ENSMUST00000109619 7977 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Zbed5B2RPU8 Cep250-201ENSMUST00000039994 7979 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Zbed5B2RPU8 Gm30648-202ENSMUST00000200648 1957 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Zbed5B2RPU8 Gabarapl2-201ENSMUST00000034428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Zbed5B2RPU8 AC174678.2-201ENSMUST00000156420 3275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Zbed5B2RPU8 3425401B19Rik-201ENSMUST00000096038 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Zbed5B2RPU8 Gm10750-201ENSMUST00000099266 1506 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Zbed5B2RPU8 Llgl1-202ENSMUST00000108719 4268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Zbed5B2RPU8 Col6a6-203ENSMUST00000166431 7098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Zbed5B2RPU8 Synpo2l-201ENSMUST00000057090 4394 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Zbed5B2RPU8 Nop14-201ENSMUST00000041364 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Zbed5B2RPU8 Gm15674-201ENSMUST00000143266 2438 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Zbed5B2RPU8 Ces3b-202ENSMUST00000093221 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Zbed5B2RPU8 Camk2a-203ENSMUST00000102888 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Zbed5B2RPU8 Hectd4-201ENSMUST00000042614 15482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Zbed5B2RPU8 Mir671-201ENSMUST00000102432 98 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Zbed5B2RPU8 Trav11-201ENSMUST00000103585 343 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Zbed5B2RPU8 Trav11d-201ENSMUST00000103648 342 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Zbed5B2RPU8 Tomm5-202ENSMUST00000107808 679 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Zbed5B2RPU8 Gm5909-201ENSMUST00000119768 1281 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Zbed5B2RPU8 Gm14222-201ENSMUST00000128681 575 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Zbed5B2RPU8 Gm13008-201ENSMUST00000142289 507 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Zbed5B2RPU8 Gm25492-201ENSMUST00000157383 129 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Zbed5B2RPU8 Gm16030-201ENSMUST00000159098 603 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Zbed5B2RPU8 Gm16167-201ENSMUST00000160428 1065 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Zbed5B2RPU8 Gm20414-201ENSMUST00000172918 646 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Zbed5B2RPU8 Gm26555-201ENSMUST00000180452 1037 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Zbed5B2RPU8 Gm4895-201ENSMUST00000181646 1137 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Zbed5B2RPU8 Gm18801-201ENSMUST00000186616 536 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Zbed5B2RPU8 1700017M07Rik-201ENSMUST00000198307 940 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Zbed5B2RPU8 Trav11n-201ENSMUST00000200113 343 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Zbed5B2RPU8 Gm5302-201ENSMUST00000202130 796 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Zbed5B2RPU8 1700086D15Rik-201ENSMUST00000020855 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Zbed5B2RPU8 Gm44953-201ENSMUST00000208745 1286 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Zbed5B2RPU8 Gm45613-201ENSMUST00000210718 443 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Zbed5B2RPU8 9430078K24Rik-203ENSMUST00000220293 638 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Zbed5B2RPU8 Tspo2-201ENSMUST00000024794 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Zbed5B2RPU8 Pla2g1b-201ENSMUST00000031495 557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Zbed5B2RPU8 Fkbpl-201ENSMUST00000036720 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Zbed5B2RPU8 Spag6-201ENSMUST00000095132 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Zbed5B2RPU8 Stx1b-201ENSMUST00000106267 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Zbed5B2RPU8 Gm5766-201ENSMUST00000160520 1977 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Zbed5B2RPU8 Gm12333-201ENSMUST00000155508 2669 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Zbed5B2RPU8 Ttll13-201ENSMUST00000058266 3010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Zbed5B2RPU8 Ror2-202ENSMUST00000130235 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms