Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Acvrl1-201ENSMUST00000000542 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Col5a3Q9JLI2 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Col5a3Q9JLI2 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Col5a3Q9JLI2 Lyrm1-204ENSMUST00000106518 875 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Col5a3Q9JLI2 Gm13002-201ENSMUST00000119286 682 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Col5a3Q9JLI2 Cyp2j15-ps-201ENSMUST00000122267 686 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Col5a3Q9JLI2 Gm13201-201ENSMUST00000144031 600 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Col5a3Q9JLI2 Gm26483-201ENSMUST00000158016 104 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Col5a3Q9JLI2 Etv1-204ENSMUST00000160701 1578 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Col5a3Q9JLI2 Gm16581-201ENSMUST00000160730 991 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Col5a3Q9JLI2 Gm38220-201ENSMUST00000195774 1447 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Col5a3Q9JLI2 Gm19121-201ENSMUST00000215720 1022 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Col5a3Q9JLI2 AC134439.3-201ENSMUST00000223486 851 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Col5a3Q9JLI2 AC154766.1-201ENSMUST00000226550 936 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r212-201ENSMUST00000095960 1164 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Col5a3Q9JLI2 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Col5a3Q9JLI2 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Col5a3Q9JLI2 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Col5a3Q9JLI2 Fbxo40-202ENSMUST00000114806 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Col5a3Q9JLI2 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Col5a3Q9JLI2 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Col5a3Q9JLI2 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Col5a3Q9JLI2 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Col5a3Q9JLI2 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Col5a3Q9JLI2 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Col5a3Q9JLI2 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Col5a3Q9JLI2 Cd55-201ENSMUST00000027650 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Col5a3Q9JLI2 Flad1-204ENSMUST00000129308 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Col5a3Q9JLI2 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Col5a3Q9JLI2 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Col5a3Q9JLI2 Rab38-201ENSMUST00000107256 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Col5a3Q9JLI2 Supt20-ps-201ENSMUST00000117999 1560 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Col5a3Q9JLI2 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Col5a3Q9JLI2 Fam109b-203ENSMUST00000161178 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Col5a3Q9JLI2 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Col5a3Q9JLI2 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Col5a3Q9JLI2 Gm15353-201ENSMUST00000110860 702 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Col5a3Q9JLI2 Gm15208-201ENSMUST00000134448 493 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Col5a3Q9JLI2 Gm7847-201ENSMUST00000151645 777 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Col5a3Q9JLI2 2410124H12Rik-201ENSMUST00000160494 706 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Col5a3Q9JLI2 Vmn2r-ps125-201ENSMUST00000176234 931 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Col5a3Q9JLI2 Gm28381-201ENSMUST00000188403 193 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Col5a3Q9JLI2 Gm5960-201ENSMUST00000188483 406 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Col5a3Q9JLI2 Gm18299-201ENSMUST00000192026 636 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Col5a3Q9JLI2 A430073D23Rik-201ENSMUST00000196262 665 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Col5a3Q9JLI2 Gm43761-201ENSMUST00000202132 991 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Col5a3Q9JLI2 4930500F04Rik-203ENSMUST00000202177 576 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Col5a3Q9JLI2 A930033M14Rik-201ENSMUST00000217206 400 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Col5a3Q9JLI2 2210039B01Rik-201ENSMUST00000222490 1044 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Col5a3Q9JLI2 Fxyd1-201ENSMUST00000039909 620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Col5a3Q9JLI2 Grxcr2-201ENSMUST00000097591 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Col5a3Q9JLI2 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Col5a3Q9JLI2 Gp2-201ENSMUST00000033255 1993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Col5a3Q9JLI2 Gm42962-201ENSMUST00000201966 2325 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Col5a3Q9JLI2 Add1-202ENSMUST00000052836 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Col5a3Q9JLI2 Kcnk18-201ENSMUST00000065204 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Col5a3Q9JLI2 Lpin3-204ENSMUST00000109457 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Col5a3Q9JLI2 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Col5a3Q9JLI2 Agpat3-211ENSMUST00000166360 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Col5a3Q9JLI2 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Col5a3Q9JLI2 Gm5310-201ENSMUST00000197861 1511 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Col5a3Q9JLI2 Ribc1-201ENSMUST00000026288 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Col5a3Q9JLI2 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Col5a3Q9JLI2 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
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Col5a3Q9JLI2 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Col5a3Q9JLI2 Gm26510-201ENSMUST00000180468 1796 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Col5a3Q9JLI2 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Col5a3Q9JLI2 Slc38a5-202ENSMUST00000115590 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Col5a3Q9JLI2 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Col5a3Q9JLI2 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Col5a3Q9JLI2 Sdhc-202ENSMUST00000111336 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Col5a3Q9JLI2 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Col5a3Q9JLI2 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Col5a3Q9JLI2 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Col5a3Q9JLI2 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Col5a3Q9JLI2 Gm8661-201ENSMUST00000118688 992 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Col5a3Q9JLI2 Gm4996-201ENSMUST00000122042 784 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Col5a3Q9JLI2 Gm13372-201ENSMUST00000123129 688 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Col5a3Q9JLI2 Wdr17-204ENSMUST00000129132 1043 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Col5a3Q9JLI2 Gm43103-201ENSMUST00000199021 802 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Col5a3Q9JLI2 Gm43851-201ENSMUST00000200726 327 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Col5a3Q9JLI2 Ift172-206ENSMUST00000201809 405 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Col5a3Q9JLI2 Gm44131-201ENSMUST00000203036 394 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Col5a3Q9JLI2 Gm34868-201ENSMUST00000218341 530 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Col5a3Q9JLI2 AC140426.1-201ENSMUST00000227933 459 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Col5a3Q9JLI2 AC116390.1-201ENSMUST00000227975 670 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Col5a3Q9JLI2 Opn1mw-201ENSMUST00000033771 1227 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Col5a3Q9JLI2 Tceal9-201ENSMUST00000048687 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Col5a3Q9JLI2 n-R5s25-201ENSMUST00000082923 119 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Col5a3Q9JLI2 Cyp2d9-201ENSMUST00000089129 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Col5a3Q9JLI2 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Col5a3Q9JLI2 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Col5a3Q9JLI2 Sp6-201ENSMUST00000047997 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Col5a3Q9JLI2 Pabpc4-201ENSMUST00000078734 2700 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Col5a3Q9JLI2 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Col5a3Q9JLI2 Cpvl-201ENSMUST00000166545 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Col5a3Q9JLI2 Myc-207ENSMUST00000188482 1365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Col5a3Q9JLI2 Serpina1b-201ENSMUST00000095450 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Col5a3Q9JLI2 Gm43362-201ENSMUST00000198192 2470 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.7 ms