Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESN2

Trim39, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM39, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim39Q9ESN2 Cdca2-207ENSMUST00000163100 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Trim39Q9ESN2 Gm17134-201ENSMUST00000166593 437 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Trim39Q9ESN2 Gng13-202ENSMUST00000172002 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Trim39Q9ESN2 Gm4791-201ENSMUST00000178065 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Trim39Q9ESN2 Gapdh-ps14-201ENSMUST00000183246 1002 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Trim39Q9ESN2 Gm28375-201ENSMUST00000185304 430 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Trim39Q9ESN2 Gm9540-201ENSMUST00000188230 478 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Trim39Q9ESN2 Gm44760-201ENSMUST00000206375 1173 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Trim39Q9ESN2 Hcst-203ENSMUST00000208740 366 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Trim39Q9ESN2 AC162940.1-201ENSMUST00000224745 1167 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Trim39Q9ESN2 Ginm1-202ENSMUST00000065124 300 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Trim39Q9ESN2 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Trim39Q9ESN2 Olfr955-201ENSMUST00000073946 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Trim39Q9ESN2 Gm7551-201ENSMUST00000089593 1074 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Trim39Q9ESN2 Gm42047-202ENSMUST00000212899 4988 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Trim39Q9ESN2 Igsf6-201ENSMUST00000047194 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Trim39Q9ESN2 Ctnnd1-223ENSMUST00000111697 5294 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Trim39Q9ESN2 Nrp2-202ENSMUST00000063594 6342 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Trim39Q9ESN2 4933404K08Rik-201ENSMUST00000156977 1434 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Trim39Q9ESN2 Gm44190-201ENSMUST00000205083 1401 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Trim39Q9ESN2 Kcnip3-203ENSMUST00000103215 2732 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Trim39Q9ESN2 Kcnip3-201ENSMUST00000028850 2728 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Trim39Q9ESN2 Rbbp6-202ENSMUST00000071590 5728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Trim39Q9ESN2 Rnf123-207ENSMUST00000160249 4426 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Trim39Q9ESN2 Bdh1-203ENSMUST00000115227 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Trim39Q9ESN2 D030028A08Rik-202ENSMUST00000131501 3542 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Trim39Q9ESN2 Olfr764-ps1-201ENSMUST00000204763 2854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Trim39Q9ESN2 Bsnd-201ENSMUST00000054472 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Trim39Q9ESN2 Lin37-202ENSMUST00000108164 1312 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Trim39Q9ESN2 Rps9-202ENSMUST00000108623 1347 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Trim39Q9ESN2 BC049352-203ENSMUST00000171799 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Trim39Q9ESN2 Ly75-201ENSMUST00000028362 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Trim39Q9ESN2 Smarcc2-201ENSMUST00000026433 4533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Trim39Q9ESN2 Marveld2-201ENSMUST00000022137 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Trim39Q9ESN2 Med24-202ENSMUST00000100500 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Trim39Q9ESN2 Platr4-203ENSMUST00000199155 2161 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Trim39Q9ESN2 Gm18806-201ENSMUST00000207607 1775 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Trim39Q9ESN2 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Trim39Q9ESN2 Atxn7l1-204ENSMUST00000125192 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Trim39Q9ESN2 Gm43127-201ENSMUST00000195890 2789 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Trim39Q9ESN2 Dph7-201ENSMUST00000028351 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Trim39Q9ESN2 Syne3-202ENSMUST00000095439 3357 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Trim39Q9ESN2 Krtap4-8-201ENSMUST00000107439 983 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Trim39Q9ESN2 Olfr1258-202ENSMUST00000111516 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Trim39Q9ESN2 Gm12247-201ENSMUST00000117585 670 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Trim39Q9ESN2 Lamr1-ps1-201ENSMUST00000119759 874 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
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Trim39Q9ESN2 E130307A14Rik-204ENSMUST00000139356 701 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Trim39Q9ESN2 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Trim39Q9ESN2 Gm5277-201ENSMUST00000164923 556 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Trim39Q9ESN2 Spdye4c-203ENSMUST00000178601 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Trim39Q9ESN2 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Trim39Q9ESN2 Gm28982-201ENSMUST00000186895 512 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Trim39Q9ESN2 Gm43906-201ENSMUST00000203194 906 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Trim39Q9ESN2 AC159890.1-201ENSMUST00000215382 684 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Trim39Q9ESN2 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
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Trim39Q9ESN2 AC131743.3-201ENSMUST00000222099 662 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
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Trim39Q9ESN2 Ankrd7-201ENSMUST00000031489 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Trim39Q9ESN2 Nme5-201ENSMUST00000079287 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Trim39Q9ESN2 Vwf-203ENSMUST00000112254 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Trim39Q9ESN2 Abcc4-201ENSMUST00000036554 5715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Trim39Q9ESN2 1810053B23Rik-205ENSMUST00000188056 1592 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Trim39Q9ESN2 Zbtb25-202ENSMUST00000176102 2707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
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Trim39Q9ESN2 Gm20757-201ENSMUST00000182870 1604 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
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Trim39Q9ESN2 Aldh1a3-201ENSMUST00000015278 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Trim39Q9ESN2 Greb1l-201ENSMUST00000048977 8414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Trim39Q9ESN2 Ttc16-206ENSMUST00000161430 2874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Trim39Q9ESN2 Wdcp-201ENSMUST00000053034 2892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Trim39Q9ESN2 Ampd2-201ENSMUST00000078912 3368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Trim39Q9ESN2 Mdm1-203ENSMUST00000164077 2922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Trim39Q9ESN2 Myo5a-201ENSMUST00000123128 11702 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Trim39Q9ESN2 Edaradd-201ENSMUST00000179308 6668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Trim39Q9ESN2 Cped1-201ENSMUST00000115382 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Trim39Q9ESN2 2700049A03Rik-203ENSMUST00000149564 5763 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Trim39Q9ESN2 Zfp558-202ENSMUST00000034647 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Trim39Q9ESN2 Gm28042-203ENSMUST00000156805 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Trim39Q9ESN2 Ccdc62-202ENSMUST00000165148 3920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Trim39Q9ESN2 Myo9a-206ENSMUST00000136740 12252 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Trim39Q9ESN2 D630008O14Rik-201ENSMUST00000144260 1568 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Trim39Q9ESN2 Gtf3c6-206ENSMUST00000217537 2526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Trim39Q9ESN2 Gpr146-203ENSMUST00000100514 4264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Trim39Q9ESN2 6030443J06Rik-201ENSMUST00000181209 2380 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Trim39Q9ESN2 Ubr1-201ENSMUST00000028728 7768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Trim39Q9ESN2 Fubp1-202ENSMUST00000166984 6523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Trim39Q9ESN2 Gm5795-201ENSMUST00000100920 984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Trim39Q9ESN2 Inca1-202ENSMUST00000108541 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Trim39Q9ESN2 Inca1-205ENSMUST00000126114 1189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Trim39Q9ESN2 Gm14152-201ENSMUST00000127020 1073 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Trim39Q9ESN2 Dnmt3l-203ENSMUST00000131825 1113 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Trim39Q9ESN2 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Trim39Q9ESN2 Dnmt3l-206ENSMUST00000139539 1279 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
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