Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU5

Rnf6, E3 ubiquitin-protein ligase RNF6, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf6Q9DBU5 Gm26642-201ENSMUST00000180981 2782 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rnf6Q9DBU5 Gm45140-202ENSMUST00000204419 5061 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rnf6Q9DBU5 Matn2-205ENSMUST00000227759 3569 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rnf6Q9DBU5 Morf4l2-213ENSMUST00000166478 1720 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rnf6Q9DBU5 Pak7-201ENSMUST00000035264 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rnf6Q9DBU5 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rnf6Q9DBU5 Gm21142-201ENSMUST00000179999 2604 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Rnf6Q9DBU5 Hdc-201ENSMUST00000028838 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rnf6Q9DBU5 Ahnak2-201ENSMUST00000101010 2821 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rnf6Q9DBU5 Stk38-201ENSMUST00000009138 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rnf6Q9DBU5 St5-201ENSMUST00000077909 4612 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rnf6Q9DBU5 Chmp1b-202ENSMUST00000210564 2490 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rnf6Q9DBU5 Inpp5j-201ENSMUST00000044507 3370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rnf6Q9DBU5 Jaml-201ENSMUST00000050020 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rnf6Q9DBU5 Zfp235-201ENSMUST00000056549 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rnf6Q9DBU5 Olfr1428-203ENSMUST00000214103 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rnf6Q9DBU5 Myh1-203ENSMUST00000124516 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rnf6Q9DBU5 Ccr6-205ENSMUST00000177568 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rnf6Q9DBU5 Tnip1-203ENSMUST00000102731 2973 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rnf6Q9DBU5 Impa1-202ENSMUST00000118410 2988 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rnf6Q9DBU5 Arrb2-201ENSMUST00000079056 1443 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rnf6Q9DBU5 Gm10646-201ENSMUST00000213227 3293 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rnf6Q9DBU5 Gm20649-201ENSMUST00000160950 2740 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rnf6Q9DBU5 Triml2-202ENSMUST00000209200 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rnf6Q9DBU5 Nos3-201ENSMUST00000030834 4132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rnf6Q9DBU5 Gm43052-201ENSMUST00000201451 1628 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Rnf6Q9DBU5 Srpx2-201ENSMUST00000033606 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rnf6Q9DBU5 Lman1-201ENSMUST00000048260 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rnf6Q9DBU5 9030624J02Rik-202ENSMUST00000059390 5097 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rnf6Q9DBU5 Pigb-206ENSMUST00000184035 3221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rnf6Q9DBU5 D2hgdh-201ENSMUST00000097633 3232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rnf6Q9DBU5 Axin2-202ENSMUST00000106711 2551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rnf6Q9DBU5 Zswim9-201ENSMUST00000108532 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rnf6Q9DBU5 Scyl2-204ENSMUST00000174252 4817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rnf6Q9DBU5 Fdft1-201ENSMUST00000054963 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rnf6Q9DBU5 4930412O13Rik-202ENSMUST00000114919 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rnf6Q9DBU5 C1qtnf7-202ENSMUST00000121872 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rnf6Q9DBU5 Rbm18-202ENSMUST00000122456 781 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rnf6Q9DBU5 Gm11772-201ENSMUST00000136542 532 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rnf6Q9DBU5 Gm37988-201ENSMUST00000155020 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rnf6Q9DBU5 Gm20392-201ENSMUST00000173047 701 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Rnf6Q9DBU5 Gm18776-201ENSMUST00000188833 654 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Rnf6Q9DBU5 Gm44155-201ENSMUST00000203923 412 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Rnf6Q9DBU5 Rpl15-ps5-201ENSMUST00000205636 605 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Rnf6Q9DBU5 Gm36028-202ENSMUST00000205931 1161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rnf6Q9DBU5 Gm45717-201ENSMUST00000211129 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rnf6Q9DBU5 AC153887.1-201ENSMUST00000219154 1253 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rnf6Q9DBU5 Gm5178-201ENSMUST00000219380 898 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Rnf6Q9DBU5 1700011B04Rik-204ENSMUST00000220859 422 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rnf6Q9DBU5 Cinp-204ENSMUST00000221102 536 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rnf6Q9DBU5 AC164429.1-201ENSMUST00000224210 518 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Rnf6Q9DBU5 Plp2-201ENSMUST00000033486 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rnf6Q9DBU5 Crot-201ENSMUST00000003720 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rnf6Q9DBU5 Commd4-201ENSMUST00000065358 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rnf6Q9DBU5 Mphosph10-201ENSMUST00000032735 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rnf6Q9DBU5 Gm26794-201ENSMUST00000180810 4312 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rnf6Q9DBU5 Mpp1-202ENSMUST00000114091 1558 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rnf6Q9DBU5 Gm8684-201ENSMUST00000195078 1564 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Rnf6Q9DBU5 AC113282.5-201ENSMUST00000224330 1679 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rnf6Q9DBU5 4930402K13Rik-201ENSMUST00000059967 1781 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rnf6Q9DBU5 Slit2-216ENSMUST00000174313 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rnf6Q9DBU5 AC154528.2-201ENSMUST00000228432 3023 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Rnf6Q9DBU5 Clip1-204ENSMUST00000111564 5609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rnf6Q9DBU5 Gpm6b-209ENSMUST00000112235 4480 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rnf6Q9DBU5 Gm38357-201ENSMUST00000195382 2464 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Rnf6Q9DBU5 Gm43375-201ENSMUST00000196705 2480 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Rnf6Q9DBU5 Pml-202ENSMUST00000114136 4343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rnf6Q9DBU5 Rims1-204ENSMUST00000097810 6362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rnf6Q9DBU5 Gm44617-202ENSMUST00000209122 2763 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rnf6Q9DBU5 Samd4-206ENSMUST00000137543 6874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rnf6Q9DBU5 Ablim2-204ENSMUST00000114204 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rnf6Q9DBU5 Col6a4-201ENSMUST00000121963 7371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rnf6Q9DBU5 Gm12097-201ENSMUST00000121523 1414 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Rnf6Q9DBU5 Sgca-205ENSMUST00000166320 1428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rnf6Q9DBU5 Pcdhga1-201ENSMUST00000194190 4692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rnf6Q9DBU5 Gm31718-201ENSMUST00000212406 1646 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rnf6Q9DBU5 Prkcd-205ENSMUST00000112207 2139 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rnf6Q9DBU5 Gm8378-202ENSMUST00000167777 2624 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rnf6Q9DBU5 Gm37580-201ENSMUST00000192408 2800 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Rnf6Q9DBU5 Fam90a1b-201ENSMUST00000044989 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rnf6Q9DBU5 Per1-202ENSMUST00000101004 3507 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rnf6Q9DBU5 Nfx1-203ENSMUST00000098143 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rnf6Q9DBU5 Clvs2-204ENSMUST00000161692 4283 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rnf6Q9DBU5 Rnf20-201ENSMUST00000029989 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rnf6Q9DBU5 Tax1bp1-201ENSMUST00000080723 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rnf6Q9DBU5 Prss57-201ENSMUST00000020573 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rnf6Q9DBU5 Sgk1-203ENSMUST00000100036 2476 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rnf6Q9DBU5 Hmg20a-206ENSMUST00000217518 2468 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rnf6Q9DBU5 Pced1b-204ENSMUST00000228521 1790 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rnf6Q9DBU5 Gatsl2-201ENSMUST00000016088 7367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rnf6Q9DBU5 1810019N24Rik-201ENSMUST00000181128 1474 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rnf6Q9DBU5 Kyat1-202ENSMUST00000113659 1367 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rnf6Q9DBU5 Gm25562-201ENSMUST00000104608 133 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Rnf6Q9DBU5 Gm25063-201ENSMUST00000104666 94 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Rnf6Q9DBU5 Gm14807-201ENSMUST00000116640 983 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Rnf6Q9DBU5 Gm12337-201ENSMUST00000119634 400 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Rnf6Q9DBU5 Mir1905-201ENSMUST00000122779 82 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Rnf6Q9DBU5 4930589P08Rik-201ENSMUST00000129097 1084 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rnf6Q9DBU5 Gm14291-201ENSMUST00000143645 804 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rnf6Q9DBU5 Dleu2-205ENSMUST00000182325 463 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms