Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2Y5

Snx20, Sorting nexin-20, mousemouse

Predictions only

Length 313 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx20Q9D2Y5 Gsg1-203ENSMUST00000111910 1384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Snx20Q9D2Y5 Arih2-201ENSMUST00000013338 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Snx20Q9D2Y5 Gbp3-201ENSMUST00000029935 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Snx20Q9D2Y5 Spty2d1-201ENSMUST00000061639 5223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Snx20Q9D2Y5 Gm15631-201ENSMUST00000142962 2436 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Snx20Q9D2Y5 AC144938.1-201ENSMUST00000223994 2167 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Snx20Q9D2Y5 Gm5159-201ENSMUST00000212733 1652 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Snx20Q9D2Y5 Fanca-202ENSMUST00000118395 3274 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Snx20Q9D2Y5 Gm26690-201ENSMUST00000181457 1997 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Snx20Q9D2Y5 9530026P05Rik-204ENSMUST00000204449 1740 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Snx20Q9D2Y5 2810032G03Rik-202ENSMUST00000163627 2514 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Snx20Q9D2Y5 Elf5-206ENSMUST00000164172 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Snx20Q9D2Y5 Vipas39-202ENSMUST00000072744 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Snx20Q9D2Y5 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Snx20Q9D2Y5 2700049A03Rik-203ENSMUST00000149564 5763 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Snx20Q9D2Y5 Gm26822-201ENSMUST00000181732 3374 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Snx20Q9D2Y5 Nudcd1-201ENSMUST00000038719 2600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Snx20Q9D2Y5 Olfr77-202ENSMUST00000217347 5980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Snx20Q9D2Y5 Trim9-205ENSMUST00000221041 3767 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Snx20Q9D2Y5 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Snx20Q9D2Y5 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Snx20Q9D2Y5 Sfxn5-204ENSMUST00000113788 514 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Snx20Q9D2Y5 Gm13091-201ENSMUST00000128800 469 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Snx20Q9D2Y5 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Snx20Q9D2Y5 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Snx20Q9D2Y5 0610040B10Rik-202ENSMUST00000162890 600 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
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Snx20Q9D2Y5 1700021P04Rik-201ENSMUST00000178667 659 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Snx20Q9D2Y5 Gm10774-201ENSMUST00000188689 204 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Snx20Q9D2Y5 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Snx20Q9D2Y5 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Snx20Q9D2Y5 Sdf2-201ENSMUST00000002133 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Snx20Q9D2Y5 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Snx20Q9D2Y5 Phxr2-201ENSMUST00000060761 1159 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Snx20Q9D2Y5 Gm29773-201ENSMUST00000212751 1895 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Snx20Q9D2Y5 Ttpal-207ENSMUST00000171696 4522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Snx20Q9D2Y5 Gpat4-201ENSMUST00000167004 5518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Snx20Q9D2Y5 Ccdc136-208ENSMUST00000180829 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Snx20Q9D2Y5 Lrit3-201ENSMUST00000179187 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Snx20Q9D2Y5 Wnk1-204ENSMUST00000088646 8364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Snx20Q9D2Y5 Tro-201ENSMUST00000087253 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Snx20Q9D2Y5 Nr1h4-203ENSMUST00000105297 2013 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Snx20Q9D2Y5 Morf4l2-213ENSMUST00000166478 1720 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
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Snx20Q9D2Y5 Htr1d-203ENSMUST00000121571 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Snx20Q9D2Y5 Wdr60-201ENSMUST00000039349 3721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Snx20Q9D2Y5 Gm45124-201ENSMUST00000206723 2755 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Snx20Q9D2Y5 Cpvl-202ENSMUST00000203101 1488 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Snx20Q9D2Y5 Ahrr-201ENSMUST00000022059 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Snx20Q9D2Y5 Gm37697-201ENSMUST00000195680 1844 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Snx20Q9D2Y5 Qrfpr-201ENSMUST00000091227 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Snx20Q9D2Y5 Sema4g-201ENSMUST00000026225 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Snx20Q9D2Y5 Capn3-206ENSMUST00000110721 2898 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
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Snx20Q9D2Y5 Zfp940-202ENSMUST00000108223 2560 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Snx20Q9D2Y5 Ilf3-202ENSMUST00000115414 3606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Snx20Q9D2Y5 Mlxipl-201ENSMUST00000005507 3622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Snx20Q9D2Y5 Synpo2l-203ENSMUST00000119483 3696 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
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Snx20Q9D2Y5 Omt2a-203ENSMUST00000166056 1167 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Snx20Q9D2Y5 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Snx20Q9D2Y5 Gm5294-201ENSMUST00000179205 651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Snx20Q9D2Y5 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Snx20Q9D2Y5 Gm37852-201ENSMUST00000193027 350 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
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Snx20Q9D2Y5 Gm44315-201ENSMUST00000203041 219 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Snx20Q9D2Y5 Gm19091-201ENSMUST00000208120 978 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Snx20Q9D2Y5 Ddo-207ENSMUST00000216830 806 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Snx20Q9D2Y5 Olfr225-201ENSMUST00000055276 1260 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Snx20Q9D2Y5 Ginm1-202ENSMUST00000065124 300 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Snx20Q9D2Y5 Rpl9-ps4-201ENSMUST00000075549 579 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Snx20Q9D2Y5 Tmem220-202ENSMUST00000079077 1147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Snx20Q9D2Y5 Gm5451-201ENSMUST00000080545 579 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Snx20Q9D2Y5 Gm5965-201ENSMUST00000009191 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Snx20Q9D2Y5 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Snx20Q9D2Y5 5730403I07Rik-201ENSMUST00000183878 2033 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Snx20Q9D2Y5 Anapc15-213ENSMUST00000178851 2797 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Snx20Q9D2Y5 Lasp1-201ENSMUST00000043843 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Snx20Q9D2Y5 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Snx20Q9D2Y5 AC154220.1-201ENSMUST00000225033 1705 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Snx20Q9D2Y5 Fyn-205ENSMUST00000135242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Snx20Q9D2Y5 Plec-206ENSMUST00000074834 14855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Snx20Q9D2Y5 Prss47-202ENSMUST00000203968 1353 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Snx20Q9D2Y5 Vamp5-203ENSMUST00000206154 2619 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.5 ms