Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPX6

Atg3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg3Q9CPX6 Gm17936-201ENSMUST00000199413 988 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Atg3Q9CPX6 Gm42803-201ENSMUST00000201051 451 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Atg3Q9CPX6 Map7-203ENSMUST00000213312 795 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Atg3Q9CPX6 AC133496.1-201ENSMUST00000223891 743 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Atg3Q9CPX6 Atf7-201ENSMUST00000096143 390 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Atg3Q9CPX6 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Atg3Q9CPX6 Dcaf8-201ENSMUST00000074144 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Atg3Q9CPX6 Gm21939-201ENSMUST00000221137 2773 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Atg3Q9CPX6 Ddx55-201ENSMUST00000071057 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Atg3Q9CPX6 Gfm2-202ENSMUST00000042084 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Atg3Q9CPX6 Ermard-202ENSMUST00000061688 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Atg3Q9CPX6 Etfrf1-201ENSMUST00000039729 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Atg3Q9CPX6 Ap2b1-206ENSMUST00000176523 2742 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Atg3Q9CPX6 Mab21l2-201ENSMUST00000077524 2703 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Atg3Q9CPX6 Aars2-201ENSMUST00000024733 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Atg3Q9CPX6 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Atg3Q9CPX6 Fip1l1-204ENSMUST00000113536 4769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Atg3Q9CPX6 Babam2-204ENSMUST00000114515 1497 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Atg3Q9CPX6 Tcl1b4-202ENSMUST00000222867 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Atg3Q9CPX6 Ccdc130-201ENSMUST00000005120 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Atg3Q9CPX6 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Atg3Q9CPX6 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Atg3Q9CPX6 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Atg3Q9CPX6 Itpa-201ENSMUST00000103193 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Atg3Q9CPX6 Gm26818-201ENSMUST00000181367 1360 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Atg3Q9CPX6 BC052040-201ENSMUST00000110918 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Atg3Q9CPX6 Phc1-204ENSMUST00000159252 3744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Atg3Q9CPX6 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Atg3Q9CPX6 Slfn3-201ENSMUST00000019130 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Atg3Q9CPX6 Top3a-204ENSMUST00000120417 2318 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Atg3Q9CPX6 1500012K07Rik-201ENSMUST00000181846 2345 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Atg3Q9CPX6 Ighv1-5-201ENSMUST00000103494 294 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Atg3Q9CPX6 1700037C06Rik-201ENSMUST00000132824 874 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Atg3Q9CPX6 Gm4775-201ENSMUST00000169588 402 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Atg3Q9CPX6 Rab26-204ENSMUST00000176533 965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Atg3Q9CPX6 Cpsf4l-201ENSMUST00000018871 1235 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Atg3Q9CPX6 4930444A19Rik-202ENSMUST00000190007 633 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Atg3Q9CPX6 Ccdc114-205ENSMUST00000211367 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Atg3Q9CPX6 Ifne-201ENSMUST00000056014 664 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Atg3Q9CPX6 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Atg3Q9CPX6 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Atg3Q9CPX6 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Atg3Q9CPX6 Ccnk-202ENSMUST00000221167 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Atg3Q9CPX6 Stom-201ENSMUST00000028241 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Atg3Q9CPX6 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Atg3Q9CPX6 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Atg3Q9CPX6 Agpat3-211ENSMUST00000166360 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Atg3Q9CPX6 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Atg3Q9CPX6 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Atg3Q9CPX6 Nox4-201ENSMUST00000032781 3753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Atg3Q9CPX6 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Atg3Q9CPX6 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Atg3Q9CPX6 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Atg3Q9CPX6 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Atg3Q9CPX6 Mettl8-201ENSMUST00000090849 1842 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Atg3Q9CPX6 Gm15541-201ENSMUST00000147449 2713 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Atg3Q9CPX6 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Atg3Q9CPX6 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Atg3Q9CPX6 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Atg3Q9CPX6 Dnajb6-201ENSMUST00000008733 2918 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Atg3Q9CPX6 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Atg3Q9CPX6 Ahsa2-202ENSMUST00000109539 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Atg3Q9CPX6 Prss57-201ENSMUST00000020573 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Atg3Q9CPX6 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Atg3Q9CPX6 Pced1b-204ENSMUST00000228521 1790 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Atg3Q9CPX6 Ppid-201ENSMUST00000029382 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Atg3Q9CPX6 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Atg3Q9CPX6 Tex2-202ENSMUST00000103070 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Atg3Q9CPX6 Rbm47-209ENSMUST00000201544 5211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Atg3Q9CPX6 Pabpc1-201ENSMUST00000001809 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Atg3Q9CPX6 Rnf13-210ENSMUST00000200497 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Atg3Q9CPX6 Syt14-201ENSMUST00000016344 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Atg3Q9CPX6 Gm15636-201ENSMUST00000119205 668 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Atg3Q9CPX6 6430531B16Rik-202ENSMUST00000121412 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Atg3Q9CPX6 Bola3-203ENSMUST00000122216 554 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Atg3Q9CPX6 Platr20-202ENSMUST00000143209 937 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Atg3Q9CPX6 Gm16587-201ENSMUST00000161943 863 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Atg3Q9CPX6 Madcam1-202ENSMUST00000217748 944 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Atg3Q9CPX6 AC132384.2-201ENSMUST00000218018 526 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Atg3Q9CPX6 Gm12216-207ENSMUST00000220191 1073 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Atg3Q9CPX6 Gm7242-201ENSMUST00000221134 705 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Atg3Q9CPX6 Psmb7-201ENSMUST00000028083 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Atg3Q9CPX6 Gzmk-201ENSMUST00000038212 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Atg3Q9CPX6 Mcpt4-201ENSMUST00000043249 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Atg3Q9CPX6 Brsk2-216ENSMUST00000174499 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Atg3Q9CPX6 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Atg3Q9CPX6 Anxa6-201ENSMUST00000102727 2471 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Atg3Q9CPX6 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Atg3Q9CPX6 Zfp862-ps-201ENSMUST00000203457 3282 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
Atg3Q9CPX6 Gm15446-201ENSMUST00000112544 2417 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Atg3Q9CPX6 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Atg3Q9CPX6 Dip2c-201ENSMUST00000166299 4822 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Atg3Q9CPX6 Ccdc136-207ENSMUST00000154619 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Atg3Q9CPX6 Olfr1344-202ENSMUST00000218906 2590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Atg3Q9CPX6 Klk1b5-201ENSMUST00000074359 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Atg3Q9CPX6 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Atg3Q9CPX6 Zmynd8-203ENSMUST00000099084 5232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Atg3Q9CPX6 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Atg3Q9CPX6 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Atg3Q9CPX6 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.1 ms