Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGG7

Ubash3b, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein B, mousemouse

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Length 638 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubash3bQ8BGG7 1700088E04Rik-206ENSMUST00000187550 1168 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ubash3bQ8BGG7 Gm28516-201ENSMUST00000190257 663 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ubash3bQ8BGG7 8030442B05Rik-201ENSMUST00000192626 1035 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ubash3bQ8BGG7 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ubash3bQ8BGG7 Igkv2-116-201ENSMUST00000199327 362 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Ubash3bQ8BGG7 Sox2ot-217ENSMUST00000200414 710 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ubash3bQ8BGG7 Gm8615-202ENSMUST00000201946 737 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ubash3bQ8BGG7 Gm9445-201ENSMUST00000207454 1285 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Ubash3bQ8BGG7 Gm40639-201ENSMUST00000214642 625 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ubash3bQ8BGG7 AC164105.2-201ENSMUST00000215484 524 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ubash3bQ8BGG7 Gm10318-202ENSMUST00000217996 639 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ubash3bQ8BGG7 AC132881.2-201ENSMUST00000225474 709 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Ubash3bQ8BGG7 CT025602.2-201ENSMUST00000226553 772 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Ubash3bQ8BGG7 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ubash3bQ8BGG7 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ubash3bQ8BGG7 Rnf212-201ENSMUST00000068946 288 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ubash3bQ8BGG7 Olfr1350-201ENSMUST00000070985 927 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ubash3bQ8BGG7 Gm5965-201ENSMUST00000009191 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ubash3bQ8BGG7 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ubash3bQ8BGG7 4833411C07Rik-202ENSMUST00000207914 1568 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ubash3bQ8BGG7 Acsl6-208ENSMUST00000108899 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ubash3bQ8BGG7 Acot9-201ENSMUST00000026324 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ubash3bQ8BGG7 Gm15774-201ENSMUST00000141810 2176 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ubash3bQ8BGG7 D130019J16Rik-201ENSMUST00000193261 2158 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Ubash3bQ8BGG7 Gm35507-201ENSMUST00000197932 2761 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ubash3bQ8BGG7 Spaar-201ENSMUST00000131248 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ubash3bQ8BGG7 Uhrf1-202ENSMUST00000113035 3402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ubash3bQ8BGG7 Mamdc2-201ENSMUST00000036069 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ubash3bQ8BGG7 Fastkd5-201ENSMUST00000110262 3015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ubash3bQ8BGG7 Immt-205ENSMUST00000166938 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ubash3bQ8BGG7 Cct3-204ENSMUST00000164166 1804 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ubash3bQ8BGG7 1700017B05Rik-201ENSMUST00000034846 4152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ubash3bQ8BGG7 C130021I20Rik-201ENSMUST00000147294 3693 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ubash3bQ8BGG7 Lrrc61-201ENSMUST00000101436 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ubash3bQ8BGG7 Olfr77-202ENSMUST00000217347 5980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ubash3bQ8BGG7 Csnk1g1-214ENSMUST00000206594 2482 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ubash3bQ8BGG7 Col9a1-201ENSMUST00000054588 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ubash3bQ8BGG7 Zfp68-201ENSMUST00000063262 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ubash3bQ8BGG7 Ctnnd1-223ENSMUST00000111697 5294 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ubash3bQ8BGG7 Rad50-201ENSMUST00000020649 5153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ubash3bQ8BGG7 Zfp606-202ENSMUST00000123589 3509 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ubash3bQ8BGG7 Arhgap24-203ENSMUST00000094559 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ubash3bQ8BGG7 C030037D09Rik-203ENSMUST00000138007 3220 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ubash3bQ8BGG7 Sema4g-203ENSMUST00000179305 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ubash3bQ8BGG7 Mlc1-202ENSMUST00000109368 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ubash3bQ8BGG7 Rfesd-201ENSMUST00000050997 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ubash3bQ8BGG7 Ribc2-201ENSMUST00000023067 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ubash3bQ8BGG7 Tti2-201ENSMUST00000098842 5039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ubash3bQ8BGG7 Sgk3-203ENSMUST00000168907 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ubash3bQ8BGG7 Reps1-210ENSMUST00000164556 2537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ubash3bQ8BGG7 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ubash3bQ8BGG7 Duxf3-201ENSMUST00000174056 1486 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ubash3bQ8BGG7 Gm43972-201ENSMUST00000181398 1467 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Ubash3bQ8BGG7 Inca1-202ENSMUST00000108541 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ubash3bQ8BGG7 Gm15352-201ENSMUST00000118696 270 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Ubash3bQ8BGG7 Inca1-205ENSMUST00000126114 1189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ubash3bQ8BGG7 Cfap100-204ENSMUST00000134224 849 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ubash3bQ8BGG7 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ubash3bQ8BGG7 Gm23699-201ENSMUST00000158835 135 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Ubash3bQ8BGG7 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ubash3bQ8BGG7 Gm4214-201ENSMUST00000174451 960 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ubash3bQ8BGG7 Mir7051-201ENSMUST00000184167 73 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Ubash3bQ8BGG7 Gm28375-201ENSMUST00000185304 430 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ubash3bQ8BGG7 1700088E04Rik-211ENSMUST00000190730 691 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ubash3bQ8BGG7 Gm43667-201ENSMUST00000198616 1095 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
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Ubash3bQ8BGG7 Gm35549-202ENSMUST00000203656 1009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
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Ubash3bQ8BGG7 Abhd11os-203ENSMUST00000222613 363 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Ubash3bQ8BGG7 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ubash3bQ8BGG7 Inca1-201ENSMUST00000073625 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ubash3bQ8BGG7 Zfp92-201ENSMUST00000033740 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ubash3bQ8BGG7 A230077H06Rik-202ENSMUST00000189574 2477 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ubash3bQ8BGG7 Prpf40b-202ENSMUST00000118287 3129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ubash3bQ8BGG7 Gm18798-201ENSMUST00000187264 1700 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Ubash3bQ8BGG7 Uba1y-ps1-201ENSMUST00000188314 1708 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Ubash3bQ8BGG7 1700123L14Rik-201ENSMUST00000090061 1747 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ubash3bQ8BGG7 Gpat4-201ENSMUST00000167004 5518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ubash3bQ8BGG7 Cuzd1-201ENSMUST00000046611 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ubash3bQ8BGG7 Zmym6-201ENSMUST00000046751 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ubash3bQ8BGG7 Bace1-202ENSMUST00000078111 4041 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ubash3bQ8BGG7 Tbcel-206ENSMUST00000138506 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ubash3bQ8BGG7 Bora-201ENSMUST00000022656 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ubash3bQ8BGG7 Mobp-202ENSMUST00000093773 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ubash3bQ8BGG7 AC169511.2-201ENSMUST00000226674 2063 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Ubash3bQ8BGG7 Hmgcll1-201ENSMUST00000008052 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ubash3bQ8BGG7 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ubash3bQ8BGG7 Tead3-207ENSMUST00000219703 1320 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ubash3bQ8BGG7 Rabl2-202ENSMUST00000094056 1322 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ubash3bQ8BGG7 Angptl2-201ENSMUST00000004208 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ubash3bQ8BGG7 Mthfd1l-203ENSMUST00000120585 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ubash3bQ8BGG7 Ldb3-202ENSMUST00000022328 2468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ubash3bQ8BGG7 AW549877-201ENSMUST00000046633 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ubash3bQ8BGG7 Olfr1113-202ENSMUST00000215611 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ubash3bQ8BGG7 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Ubash3bQ8BGG7 Slc4a9-201ENSMUST00000074298 2714 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ubash3bQ8BGG7 Dzip1l-204ENSMUST00000112886 3970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ubash3bQ8BGG7 Slitrk4-202ENSMUST00000114679 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ubash3bQ8BGG7 Il9r-205ENSMUST00000145401 4482 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ubash3bQ8BGG7 Rims2-204ENSMUST00000226410 3685 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.3 ms