Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGF8

Slc35d3, Solute carrier family 35 member D3, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc35d3Q8BGF8 Tiam1-204ENSMUST00000114124 7406 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Slc35d3Q8BGF8 Nup50-201ENSMUST00000165443 4741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Slc35d3Q8BGF8 Optc-205ENSMUST00000153617 1615 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Slc35d3Q8BGF8 Eif2s3y-201ENSMUST00000091197 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Slc35d3Q8BGF8 Usp44-202ENSMUST00000216224 2449 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Slc35d3Q8BGF8 Robo4-201ENSMUST00000102895 3226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Slc35d3Q8BGF8 Tbc1d17-201ENSMUST00000047085 8750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Slc35d3Q8BGF8 Cd300lg-201ENSMUST00000017453 2353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Slc35d3Q8BGF8 Pnma2-201ENSMUST00000089236 5518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Slc35d3Q8BGF8 Llgl1-202ENSMUST00000108719 4268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Slc35d3Q8BGF8 Pigm-201ENSMUST00000052455 7554 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Slc35d3Q8BGF8 1110051M20Rik-201ENSMUST00000064652 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Slc35d3Q8BGF8 Agrn-203ENSMUST00000105575 7262 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Slc35d3Q8BGF8 Exosc10-202ENSMUST00000076022 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Slc35d3Q8BGF8 Lrp2bp-201ENSMUST00000066451 1525 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Slc35d3Q8BGF8 Ccdc63-201ENSMUST00000058960 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Slc35d3Q8BGF8 Dysf-202ENSMUST00000089595 6613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Slc35d3Q8BGF8 4833420G17Rik-204ENSMUST00000225186 2627 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Slc35d3Q8BGF8 Slc20a1-201ENSMUST00000028880 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Slc35d3Q8BGF8 Polm-201ENSMUST00000020767 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Slc35d3Q8BGF8 Zbtb43-203ENSMUST00000113156 1828 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Slc35d3Q8BGF8 Eapp-202ENSMUST00000110713 886 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Slc35d3Q8BGF8 Rbm3-205ENSMUST00000115619 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Slc35d3Q8BGF8 Apoc3-202ENSMUST00000118649 453 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Slc35d3Q8BGF8 Rhox3d-ps-201ENSMUST00000119181 825 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Slc35d3Q8BGF8 Nop16-202ENSMUST00000148222 790 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Slc35d3Q8BGF8 6820431F20Rik-201ENSMUST00000150051 936 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Slc35d3Q8BGF8 Gm20822-201ENSMUST00000165756 687 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Slc35d3Q8BGF8 Gm17192-201ENSMUST00000169031 511 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Slc35d3Q8BGF8 Gm20828-201ENSMUST00000170889 687 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Slc35d3Q8BGF8 Gm17798-201ENSMUST00000182282 1035 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Slc35d3Q8BGF8 Gm8492-201ENSMUST00000182375 987 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Slc35d3Q8BGF8 Gm26918-201ENSMUST00000182496 728 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Slc35d3Q8BGF8 Gm18014-201ENSMUST00000183369 817 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Slc35d3Q8BGF8 1700084F23Rik-202ENSMUST00000188461 747 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Slc35d3Q8BGF8 Gm38313-201ENSMUST00000191953 1266 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Slc35d3Q8BGF8 Gm43001-201ENSMUST00000198925 603 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Slc35d3Q8BGF8 Gm44216-201ENSMUST00000203942 157 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Slc35d3Q8BGF8 Gm45670-201ENSMUST00000211382 711 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Slc35d3Q8BGF8 Gm31557-201ENSMUST00000213825 973 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Slc35d3Q8BGF8 Gm31557-202ENSMUST00000213995 722 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Slc35d3Q8BGF8 Gm18514-201ENSMUST00000218980 436 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Slc35d3Q8BGF8 Pcgf5-204ENSMUST00000224772 1266 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Slc35d3Q8BGF8 Gsto1-201ENSMUST00000026050 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Slc35d3Q8BGF8 Ush1c-201ENSMUST00000009667 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Slc35d3Q8BGF8 Carns1-201ENSMUST00000167055 3968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Slc35d3Q8BGF8 Ccdc189-201ENSMUST00000072155 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Slc35d3Q8BGF8 Ftsj1-201ENSMUST00000033513 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Slc35d3Q8BGF8 Gm14820-201ENSMUST00000126286 1449 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Slc35d3Q8BGF8 4930402K13Rik-201ENSMUST00000059967 1781 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Slc35d3Q8BGF8 Thbs4-201ENSMUST00000022213 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Slc35d3Q8BGF8 Igsf3-202ENSMUST00000195164 3876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Slc35d3Q8BGF8 D930020B18Rik-201ENSMUST00000120642 3335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Slc35d3Q8BGF8 Patz1-207ENSMUST00000134089 1904 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Slc35d3Q8BGF8 Gpcpd1-202ENSMUST00000060955 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Slc35d3Q8BGF8 4732491K20Rik-201ENSMUST00000181774 3142 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Slc35d3Q8BGF8 C130083M11Rik-201ENSMUST00000197171 2072 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Slc35d3Q8BGF8 EU599041-202ENSMUST00000205291 1386 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Slc35d3Q8BGF8 Adam20-201ENSMUST00000056331 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Slc35d3Q8BGF8 Spata33-207ENSMUST00000212760 4074 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Slc35d3Q8BGF8 Cyp2d41-ps-201ENSMUST00000180453 1503 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Slc35d3Q8BGF8 Mcf2l-222ENSMUST00000173099 6081 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Slc35d3Q8BGF8 Fastkd5-201ENSMUST00000110262 3015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Slc35d3Q8BGF8 Dip2c-202ENSMUST00000169960 4801 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Slc35d3Q8BGF8 Gm19951-201ENSMUST00000222616 1328 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Slc35d3Q8BGF8 Gps2-202ENSMUST00000072581 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Slc35d3Q8BGF8 Acox3-203ENSMUST00000114237 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Slc35d3Q8BGF8 Pip5k1a-206ENSMUST00000107236 3618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Slc35d3Q8BGF8 Lig3-210ENSMUST00000173347 3631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Slc35d3Q8BGF8 Ptpn4-201ENSMUST00000064091 10874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Slc35d3Q8BGF8 Elavl2-207ENSMUST00000107118 3797 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Slc35d3Q8BGF8 Grin1-208ENSMUST00000114318 3920 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Slc35d3Q8BGF8 Wwp2-204ENSMUST00000212205 2758 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Slc35d3Q8BGF8 Baiap3-206ENSMUST00000182825 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Slc35d3Q8BGF8 Nfe2l1-212ENSMUST00000169828 3530 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Slc35d3Q8BGF8 Scn5a-203ENSMUST00000120420 7536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Slc35d3Q8BGF8 Ighv10-3-201ENSMUST00000103495 377 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Slc35d3Q8BGF8 Gm13351-201ENSMUST00000118087 414 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Slc35d3Q8BGF8 Gm14497-201ENSMUST00000119537 580 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Slc35d3Q8BGF8 Cntrobos-201ENSMUST00000132834 383 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Slc35d3Q8BGF8 Gm14235-201ENSMUST00000142445 366 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Slc35d3Q8BGF8 Gm24248-201ENSMUST00000157321 322 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Slc35d3Q8BGF8 Pax5-212ENSMUST00000173733 885 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Slc35d3Q8BGF8 Gm24809-201ENSMUST00000175318 271 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Slc35d3Q8BGF8 Rbp2-202ENSMUST00000187905 611 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Slc35d3Q8BGF8 4930402C01Rik-201ENSMUST00000192586 663 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Slc35d3Q8BGF8 Olfr1358-201ENSMUST00000204477 1064 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Slc35d3Q8BGF8 4930486N12Rik-201ENSMUST00000206668 632 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Slc35d3Q8BGF8 Lsm3-205ENSMUST00000206947 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Slc35d3Q8BGF8 Eny2-204ENSMUST00000226827 558 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Slc35d3Q8BGF8 4930449E01Rik-201ENSMUST00000022711 595 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Slc35d3Q8BGF8 Fam3b-201ENSMUST00000049721 853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Slc35d3Q8BGF8 Ifitm2-201ENSMUST00000081649 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Slc35d3Q8BGF8 Vmn1r212-201ENSMUST00000095960 1164 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Slc35d3Q8BGF8 Gm26631-201ENSMUST00000181462 2505 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Slc35d3Q8BGF8 Clip1-202ENSMUST00000063905 4589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Slc35d3Q8BGF8 Helz-202ENSMUST00000100305 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Slc35d3Q8BGF8 Zeb2-203ENSMUST00000076836 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Slc35d3Q8BGF8 Pcdhb2-201ENSMUST00000056522 2813 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Slc35d3Q8BGF8 Slc17a8-202ENSMUST00000105295 1863 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms