Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGC0

Htatsf1, HIV Tat-specific factor 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 757 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htatsf1Q8BGC0 Gm13073-201ENSMUST00000134059 486 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Htatsf1Q8BGC0 Gm15774-201ENSMUST00000141810 2176 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Htatsf1Q8BGC0 5730585A16Rik-201ENSMUST00000193457 1027 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Htatsf1Q8BGC0 Gm37284-201ENSMUST00000193607 539 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Htatsf1Q8BGC0 Gm42588-201ENSMUST00000200538 1297 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Htatsf1Q8BGC0 AU041133-202ENSMUST00000201286 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Htatsf1Q8BGC0 Olfr482-202ENSMUST00000217304 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Htatsf1Q8BGC0 Ntan1-201ENSMUST00000023362 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Htatsf1Q8BGC0 Muc13-201ENSMUST00000023520 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Htatsf1Q8BGC0 Tff2-201ENSMUST00000024826 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Htatsf1Q8BGC0 Uqcc1-201ENSMUST00000006036 808 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Htatsf1Q8BGC0 Ifnab-201ENSMUST00000071378 1058 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Htatsf1Q8BGC0 Acsf2-201ENSMUST00000103164 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Htatsf1Q8BGC0 Ccdc136-208ENSMUST00000180829 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Htatsf1Q8BGC0 Gpi1-201ENSMUST00000038027 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Htatsf1Q8BGC0 Ank3-220ENSMUST00000182439 2586 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Htatsf1Q8BGC0 Atxn1l-202ENSMUST00000212605 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Htatsf1Q8BGC0 Gm11571-201ENSMUST00000136820 2396 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Htatsf1Q8BGC0 Hivep2-204ENSMUST00000187083 9268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Htatsf1Q8BGC0 Abca9-201ENSMUST00000044850 6384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Htatsf1Q8BGC0 Catsper1-201ENSMUST00000043380 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Htatsf1Q8BGC0 Rab2b-201ENSMUST00000022765 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Htatsf1Q8BGC0 Pklr-201ENSMUST00000047111 2787 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Htatsf1Q8BGC0 Col15a1-203ENSMUST00000107730 1755 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Htatsf1Q8BGC0 Cfap54-201ENSMUST00000020200 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Htatsf1Q8BGC0 Hsd17b6-203ENSMUST00000219447 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Htatsf1Q8BGC0 Igsf6-201ENSMUST00000047194 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Htatsf1Q8BGC0 9530059O14Rik-201ENSMUST00000181107 3978 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Htatsf1Q8BGC0 Gm28424-201ENSMUST00000187393 1319 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Htatsf1Q8BGC0 Fga-202ENSMUST00000166581 2587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Htatsf1Q8BGC0 Nfe2l1-203ENSMUST00000107658 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Htatsf1Q8BGC0 Lasp1-201ENSMUST00000043843 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Htatsf1Q8BGC0 Prph2-201ENSMUST00000024773 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Htatsf1Q8BGC0 Plpbp-203ENSMUST00000209525 5767 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Htatsf1Q8BGC0 Meox2-201ENSMUST00000041183 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Htatsf1Q8BGC0 Sparcl1-201ENSMUST00000031249 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Htatsf1Q8BGC0 Gm12198-201ENSMUST00000154068 1809 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Htatsf1Q8BGC0 Ikbkb-201ENSMUST00000033939 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Htatsf1Q8BGC0 Ino80c-203ENSMUST00000141489 2207 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Htatsf1Q8BGC0 Gm23061-201ENSMUST00000102348 116 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Htatsf1Q8BGC0 Gm25076-201ENSMUST00000104098 132 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Htatsf1Q8BGC0 Mrpl55-205ENSMUST00000108787 718 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Htatsf1Q8BGC0 Tcf7l2-206ENSMUST00000111652 1041 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Htatsf1Q8BGC0 Akr1b10-202ENSMUST00000115051 1022 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Htatsf1Q8BGC0 Wdr45-206ENSMUST00000116634 1250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Htatsf1Q8BGC0 Gm16166-201ENSMUST00000118291 787 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Htatsf1Q8BGC0 Gm8302-201ENSMUST00000119217 852 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Htatsf1Q8BGC0 Vmn1r-ps104-201ENSMUST00000120960 771 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Htatsf1Q8BGC0 Gm22846-201ENSMUST00000157706 270 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Htatsf1Q8BGC0 Gm25226-201ENSMUST00000158198 123 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Htatsf1Q8BGC0 Gm6485-201ENSMUST00000160676 439 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Htatsf1Q8BGC0 F12-202ENSMUST00000170921 478 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Htatsf1Q8BGC0 Gm7030-202ENSMUST00000172968 899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Htatsf1Q8BGC0 Apoe-210ENSMUST00000174710 514 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Htatsf1Q8BGC0 9930004E17Rik-201ENSMUST00000180031 498 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Htatsf1Q8BGC0 Gm27003-201ENSMUST00000182590 497 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Htatsf1Q8BGC0 Mir7076-201ENSMUST00000183519 74 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Htatsf1Q8BGC0 Chn2-212ENSMUST00000204115 783 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Htatsf1Q8BGC0 Gm29676-202ENSMUST00000222409 364 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Htatsf1Q8BGC0 AC154461.3-201ENSMUST00000224831 573 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Htatsf1Q8BGC0 Gm9826-201ENSMUST00000029124 1299 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Htatsf1Q8BGC0 Fam92b-201ENSMUST00000048786 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Htatsf1Q8BGC0 Kcng4-201ENSMUST00000061828 3806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Htatsf1Q8BGC0 Olfr354-201ENSMUST00000068475 1084 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Htatsf1Q8BGC0 Olfr1163-201ENSMUST00000099835 1043 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Htatsf1Q8BGC0 Gm44115-201ENSMUST00000203917 2069 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Htatsf1Q8BGC0 4931406C07Rik-201ENSMUST00000034414 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Htatsf1Q8BGC0 Abcg2-202ENSMUST00000114294 2178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Htatsf1Q8BGC0 Usp44-202ENSMUST00000216224 2449 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Htatsf1Q8BGC0 Metap1-203ENSMUST00000197531 3708 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Htatsf1Q8BGC0 Mapkbp1-201ENSMUST00000066058 6942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Htatsf1Q8BGC0 Tiam1-204ENSMUST00000114124 7406 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Htatsf1Q8BGC0 Flna-201ENSMUST00000033699 8312 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Htatsf1Q8BGC0 Bcl9-201ENSMUST00000046521 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Htatsf1Q8BGC0 E2f8-201ENSMUST00000058745 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Htatsf1Q8BGC0 Actn2-201ENSMUST00000064204 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Htatsf1Q8BGC0 Camk2b-210ENSMUST00000109815 3780 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Htatsf1Q8BGC0 4933425D22Rik-201ENSMUST00000201035 1721 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Htatsf1Q8BGC0 Slc5a9-201ENSMUST00000102719 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Htatsf1Q8BGC0 Fyco1-202ENSMUST00000167595 7692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Htatsf1Q8BGC0 Kcnip3-203ENSMUST00000103215 2732 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Htatsf1Q8BGC0 Kcnip3-201ENSMUST00000028850 2728 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Htatsf1Q8BGC0 Pax3-201ENSMUST00000004994 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Htatsf1Q8BGC0 Cacna2d1-204ENSMUST00000115281 3412 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Htatsf1Q8BGC0 Trpc6-202ENSMUST00000214596 2913 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Htatsf1Q8BGC0 9430064I24Rik-201ENSMUST00000206516 2669 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Htatsf1Q8BGC0 3830406C13Rik-209ENSMUST00000224389 2444 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Htatsf1Q8BGC0 Wdr31-202ENSMUST00000107452 1437 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Htatsf1Q8BGC0 Gm42450-201ENSMUST00000199286 2644 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Htatsf1Q8BGC0 Xlr4c-201ENSMUST00000068551 1500 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Htatsf1Q8BGC0 Wdr19-204ENSMUST00000203653 6279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Htatsf1Q8BGC0 Tro-203ENSMUST00000112709 6610 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Htatsf1Q8BGC0 Ifna15-201ENSMUST00000102809 573 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Htatsf1Q8BGC0 Gm13166-201ENSMUST00000123828 940 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Htatsf1Q8BGC0 Gm13236-201ENSMUST00000153010 940 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Htatsf1Q8BGC0 Fhit-204ENSMUST00000161302 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Htatsf1Q8BGC0 Tro-208ENSMUST00000164071 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Htatsf1Q8BGC0 Higd1c-202ENSMUST00000177211 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Htatsf1Q8BGC0 Gm6408-201ENSMUST00000179032 1171 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Htatsf1Q8BGC0 Dleu2-205ENSMUST00000182325 463 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms