Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSS2

Ube2q1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 Q1, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2q1Q7TSS2 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ube2q1Q7TSS2 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ube2q1Q7TSS2 Jaml-201ENSMUST00000050020 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ube2q1Q7TSS2 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ube2q1Q7TSS2 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ube2q1Q7TSS2 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ube2q1Q7TSS2 Rdh11-201ENSMUST00000085254 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ube2q1Q7TSS2 Btg2-201ENSMUST00000020692 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ube2q1Q7TSS2 CK137956-201ENSMUST00000030614 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ube2q1Q7TSS2 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ube2q1Q7TSS2 Ppil2-202ENSMUST00000115719 838 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ube2q1Q7TSS2 Gm13002-201ENSMUST00000119286 682 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Ube2q1Q7TSS2 Gm15702-201ENSMUST00000119680 444 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Ube2q1Q7TSS2 Gm11365-201ENSMUST00000144277 774 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ube2q1Q7TSS2 Gm15419-201ENSMUST00000148654 743 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ube2q1Q7TSS2 Gm26208-201ENSMUST00000158677 124 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Ube2q1Q7TSS2 Gm5766-202ENSMUST00000161633 799 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Ube2q1Q7TSS2 Fam47e-205ENSMUST00000175974 1016 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ube2q1Q7TSS2 Vmn2r-ps125-201ENSMUST00000176234 931 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Ube2q1Q7TSS2 Gm28032-201ENSMUST00000184104 96 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Ube2q1Q7TSS2 Gm5845-201ENSMUST00000195812 796 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Ube2q1Q7TSS2 Gm44460-201ENSMUST00000196179 129 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Ube2q1Q7TSS2 Gm19798-201ENSMUST00000201502 457 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Ube2q1Q7TSS2 0610033M10Rik-202ENSMUST00000205236 1102 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ube2q1Q7TSS2 AC160929.1-201ENSMUST00000221247 415 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Ube2q1Q7TSS2 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ube2q1Q7TSS2 Hbb-y-201ENSMUST00000033229 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ube2q1Q7TSS2 Scgb2b2-201ENSMUST00000038835 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ube2q1Q7TSS2 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ube2q1Q7TSS2 Gm43127-201ENSMUST00000195890 2789 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Ube2q1Q7TSS2 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ube2q1Q7TSS2 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ube2q1Q7TSS2 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ube2q1Q7TSS2 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ube2q1Q7TSS2 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ube2q1Q7TSS2 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ube2q1Q7TSS2 Slc36a1-203ENSMUST00000108872 5264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ube2q1Q7TSS2 Ptpn11-201ENSMUST00000054547 5535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ube2q1Q7TSS2 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ube2q1Q7TSS2 Gpr161-201ENSMUST00000111450 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ube2q1Q7TSS2 Rimbp2-204ENSMUST00000198941 6446 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ube2q1Q7TSS2 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ube2q1Q7TSS2 Ighg2b-202ENSMUST00000192188 2566 ntAPPRIS P5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ube2q1Q7TSS2 Slitrk4-202ENSMUST00000114679 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ube2q1Q7TSS2 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ube2q1Q7TSS2 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ube2q1Q7TSS2 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ube2q1Q7TSS2 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ube2q1Q7TSS2 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ube2q1Q7TSS2 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ube2q1Q7TSS2 Olfr464-205ENSMUST00000217112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ube2q1Q7TSS2 Igsf9-202ENSMUST00000111235 4205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ube2q1Q7TSS2 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ube2q1Q7TSS2 St14-201ENSMUST00000034478 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ube2q1Q7TSS2 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ube2q1Q7TSS2 Serpina1b-202ENSMUST00000164454 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ube2q1Q7TSS2 Rplp2-202ENSMUST00000106003 449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ube2q1Q7TSS2 Mrps33-202ENSMUST00000114797 500 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ube2q1Q7TSS2 Gm13215-201ENSMUST00000117559 472 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Ube2q1Q7TSS2 Gm11235-201ENSMUST00000117763 333 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Ube2q1Q7TSS2 Epp13-201ENSMUST00000121024 957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ube2q1Q7TSS2 1700028K03Rik-202ENSMUST00000159902 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ube2q1Q7TSS2 Gm17147-201ENSMUST00000164176 432 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Ube2q1Q7TSS2 Muc2-202ENSMUST00000167366 711 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ube2q1Q7TSS2 Actb-207ENSMUST00000167721 1242 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ube2q1Q7TSS2 Gm22876-201ENSMUST00000175450 298 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
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Ube2q1Q7TSS2 Gm28391-201ENSMUST00000185202 379 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
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Ube2q1Q7TSS2 Gm42617-201ENSMUST00000197640 1229 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Ube2q1Q7TSS2 9230114K14Rik-202ENSMUST00000198720 837 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ube2q1Q7TSS2 Gm3635-201ENSMUST00000212314 354 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Ube2q1Q7TSS2 3110083C13Rik-202ENSMUST00000224786 907 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Ube2q1Q7TSS2 AC166061.1-201ENSMUST00000225163 1138 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Ube2q1Q7TSS2 CT571271.1-201ENSMUST00000227071 670 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Ube2q1Q7TSS2 AC114585.2-201ENSMUST00000227693 486 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Ube2q1Q7TSS2 Calm4-201ENSMUST00000042219 917 ntAPPRIS P1 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ube2q1Q7TSS2 Gm10254-201ENSMUST00000052888 867 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Ube2q1Q7TSS2 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ube2q1Q7TSS2 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ube2q1Q7TSS2 Gsdmc2-202ENSMUST00000188404 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ube2q1Q7TSS2 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ube2q1Q7TSS2 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Ube2q1Q7TSS2 2310043M15Rik-201ENSMUST00000180967 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ube2q1Q7TSS2 Ak8-201ENSMUST00000074156 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ube2q1Q7TSS2 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ube2q1Q7TSS2 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ube2q1Q7TSS2 4930447F24Rik-201ENSMUST00000194140 1341 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ube2q1Q7TSS2 AC154537.1-201ENSMUST00000226101 1304 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Ube2q1Q7TSS2 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ube2q1Q7TSS2 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ube2q1Q7TSS2 Hnrnph2-203ENSMUST00000074950 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ube2q1Q7TSS2 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ube2q1Q7TSS2 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ube2q1Q7TSS2 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ube2q1Q7TSS2 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ube2q1Q7TSS2 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ube2q1Q7TSS2 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms