Protein–RNA interactions for Protein: Q61361

Bcan, Brevican core protein, mousemouse

Predictions only

Length 883 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BcanQ61361 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
BcanQ61361 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
BcanQ61361 Ebf3-202ENSMUST00000106118 3736 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
BcanQ61361 Zcwpw2-202ENSMUST00000187329 1469 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
BcanQ61361 Gm38192-201ENSMUST00000194364 1847 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
BcanQ61361 4930594M22Rik-202ENSMUST00000161599 3595 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
BcanQ61361 Arhgef15-203ENSMUST00000108671 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
BcanQ61361 Eef1b2-204ENSMUST00000129339 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
BcanQ61361 Psmc1-201ENSMUST00000021595 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
BcanQ61361 Tnk2-204ENSMUST00000115123 4225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
BcanQ61361 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
BcanQ61361 Stk17b-201ENSMUST00000027263 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
BcanQ61361 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
BcanQ61361 Lrrc55-201ENSMUST00000099930 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
BcanQ61361 Plekha7-206ENSMUST00000182487 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
BcanQ61361 Slc38a5-201ENSMUST00000033512 1868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
BcanQ61361 C4b-201ENSMUST00000069507 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
BcanQ61361 Smg6-201ENSMUST00000045281 5848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
BcanQ61361 Gabra1-201ENSMUST00000020707 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
BcanQ61361 Armc9-201ENSMUST00000027434 5127 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
BcanQ61361 Cfi-201ENSMUST00000077918 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
BcanQ61361 Pigu-205ENSMUST00000165234 1626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
BcanQ61361 Gm7168-201ENSMUST00000088809 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
BcanQ61361 Trim23-203ENSMUST00000069187 3546 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
BcanQ61361 Prdm5-204ENSMUST00000172638 1714 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
BcanQ61361 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
BcanQ61361 B2m-201ENSMUST00000102476 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
BcanQ61361 4930502E09Rik-201ENSMUST00000126016 755 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
BcanQ61361 Mocs2-201ENSMUST00000015680 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
BcanQ61361 Gm25604-201ENSMUST00000158359 133 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
BcanQ61361 Gm37197-201ENSMUST00000195607 401 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
BcanQ61361 Gm43244-201ENSMUST00000196994 1285 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
BcanQ61361 Gm8234-201ENSMUST00000198523 1107 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
BcanQ61361 Gm6794-201ENSMUST00000203829 457 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
BcanQ61361 1700086D15Rik-201ENSMUST00000020855 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
BcanQ61361 Cenpx-201ENSMUST00000026137 692 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
BcanQ61361 Nt5dc1-202ENSMUST00000099973 761 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
BcanQ61361 Scn5a-202ENSMUST00000117911 8453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
BcanQ61361 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
BcanQ61361 Helq-201ENSMUST00000044684 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
BcanQ61361 Gpr173-201ENSMUST00000070316 4855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
BcanQ61361 Tcn2-207ENSMUST00000109993 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
BcanQ61361 Qsox1-201ENSMUST00000035325 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
BcanQ61361 Clcn4-201ENSMUST00000000619 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
BcanQ61361 Riox2-202ENSMUST00000120667 2200 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
BcanQ61361 A930006I01Rik-201ENSMUST00000139065 2229 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
BcanQ61361 Scn5a-203ENSMUST00000120420 7536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
BcanQ61361 Nin-201ENSMUST00000021468 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
BcanQ61361 Ces2a-201ENSMUST00000034346 1960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
BcanQ61361 Mir9-3hg-202ENSMUST00000181511 3412 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
BcanQ61361 Stx7-205ENSMUST00000220041 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
BcanQ61361 Acvrl1-201ENSMUST00000000542 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
BcanQ61361 Fut8-203ENSMUST00000177595 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
BcanQ61361 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
BcanQ61361 Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 5407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
BcanQ61361 Ric8a-201ENSMUST00000026558 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
BcanQ61361 Gm5764-201ENSMUST00000118817 885 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
BcanQ61361 Ccl19-ps1-201ENSMUST00000119621 327 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
BcanQ61361 Aamdc-209ENSMUST00000144858 380 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
BcanQ61361 Mir432-201ENSMUST00000157230 75 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
BcanQ61361 Has2os-202ENSMUST00000163314 633 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
BcanQ61361 Gm43097-201ENSMUST00000196867 151 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
BcanQ61361 Gm44498-201ENSMUST00000199509 111 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
BcanQ61361 Gm44953-201ENSMUST00000208745 1286 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
BcanQ61361 Gm7183-201ENSMUST00000213870 1005 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
BcanQ61361 AC154461.3-201ENSMUST00000224831 573 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
BcanQ61361 Lsm3-201ENSMUST00000040607 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
BcanQ61361 Olfr435-201ENSMUST00000058118 942 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
BcanQ61361 Gm10580-201ENSMUST00000097985 396 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
BcanQ61361 Gm10582-201ENSMUST00000097987 396 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
BcanQ61361 Gm10583-201ENSMUST00000097988 396 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
BcanQ61361 Trappc11-201ENSMUST00000039061 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
BcanQ61361 B3galt5-201ENSMUST00000099497 5147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
BcanQ61361 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
BcanQ61361 Trim46-203ENSMUST00000107464 3252 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
BcanQ61361 Git1-202ENSMUST00000100812 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
BcanQ61361 Fosb-201ENSMUST00000003640 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
BcanQ61361 Dzip1l-201ENSMUST00000078367 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
BcanQ61361 Ank3-204ENSMUST00000092432 5832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
BcanQ61361 Kifc5b-201ENSMUST00000078961 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
BcanQ61361 Platr6-201ENSMUST00000180731 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
BcanQ61361 Gm26908-201ENSMUST00000181856 1637 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
BcanQ61361 AC151836.1-201ENSMUST00000228730 1637 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
BcanQ61361 Clec12b-201ENSMUST00000032261 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
BcanQ61361 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
BcanQ61361 Gm15411-201ENSMUST00000133243 3488 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
BcanQ61361 Pde4c-207ENSMUST00000224874 3099 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
BcanQ61361 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
BcanQ61361 Vmn1r45-201ENSMUST00000054202 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
BcanQ61361 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
BcanQ61361 Atp6v0e2-201ENSMUST00000040361 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
BcanQ61361 Gm5159-201ENSMUST00000212733 1652 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
BcanQ61361 Fcgr2b-204ENSMUST00000159969 1578 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
BcanQ61361 Gm11470-201ENSMUST00000118868 1475 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
BcanQ61361 AW549877-201ENSMUST00000046633 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
BcanQ61361 Meltf-201ENSMUST00000023464 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
BcanQ61361 Kat6b-201ENSMUST00000069648 7649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
BcanQ61361 Unkl-204ENSMUST00000160896 4787 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
BcanQ61361 Smim8-204ENSMUST00000108133 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
BcanQ61361 Lemd1-201ENSMUST00000112357 964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.6 ms