Protein–RNA interactions for Protein: P81068

Irx1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, mousemouse

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Length 480 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx1P81068 Gphn-201ENSMUST00000052472 3570 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Irx1P81068 Magt1-204ENSMUST00000151689 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Irx1P81068 Gm13561-201ENSMUST00000136879 1826 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Irx1P81068 Dis3l2-202ENSMUST00000168237 3154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Irx1P81068 Arfgef3-201ENSMUST00000019999 5606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Irx1P81068 Cfap43-202ENSMUST00000095998 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Irx1P81068 Ccin-201ENSMUST00000095107 1941 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Irx1P81068 Gm45889-202ENSMUST00000211255 2358 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Irx1P81068 Gon4l-203ENSMUST00000107498 7537 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Irx1P81068 Trgv2-201ENSMUST00000103563 491 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Irx1P81068 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Irx1P81068 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Irx1P81068 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Irx1P81068 Gm8111-201ENSMUST00000117659 987 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Irx1P81068 Gm8731-201ENSMUST00000118088 412 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Irx1P81068 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Irx1P81068 Gm14740-201ENSMUST00000118538 1150 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Irx1P81068 Cryzl1-204ENSMUST00000122254 845 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Irx1P81068 Gm11985-201ENSMUST00000122910 1007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Irx1P81068 Optc-201ENSMUST00000124051 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Irx1P81068 Cdpf1-205ENSMUST00000150995 566 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Irx1P81068 Ctc1-211ENSMUST00000161455 3989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Irx1P81068 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Irx1P81068 Hspb9-202ENSMUST00000169833 726 ntAPPRIS P2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Irx1P81068 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Irx1P81068 Spdye4c-203ENSMUST00000178601 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Irx1P81068 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Irx1P81068 Net1-206ENSMUST00000222504 447 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Irx1P81068 CT009713.8-202ENSMUST00000224732 385 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Irx1P81068 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Irx1P81068 Olfr889-201ENSMUST00000072290 945 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Irx1P81068 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Irx1P81068 Gm21986-201ENSMUST00000113671 5560 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Irx1P81068 B3galt5-201ENSMUST00000099497 5147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Irx1P81068 5730455P16Rik-204ENSMUST00000179332 4536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Irx1P81068 Gm9244-201ENSMUST00000056767 2129 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Irx1P81068 Cit-212ENSMUST00000141101 6794 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Irx1P81068 Myadm-201ENSMUST00000096744 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Irx1P81068 Apobr-201ENSMUST00000039522 3685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Irx1P81068 Suclg2-204ENSMUST00000204224 3367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Irx1P81068 Rtl1-201ENSMUST00000149046 6358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Irx1P81068 Ralgps2-202ENSMUST00000063199 2947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Irx1P81068 St5-201ENSMUST00000077909 4612 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Irx1P81068 Slc23a1-201ENSMUST00000025212 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Irx1P81068 Duxf3-201ENSMUST00000174056 1486 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Irx1P81068 Ube2c-201ENSMUST00000001439 2191 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Irx1P81068 Traf1-207ENSMUST00000172159 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Irx1P81068 Adgb-201ENSMUST00000045328 1893 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Irx1P81068 Csrnp3-208ENSMUST00000176109 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Irx1P81068 Pard3-201ENSMUST00000026921 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Irx1P81068 4933425D22Rik-201ENSMUST00000201035 1721 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Irx1P81068 Sp100-201ENSMUST00000054279 1978 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Irx1P81068 Mical1-203ENSMUST00000119962 3565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Irx1P81068 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Irx1P81068 Gm15515-201ENSMUST00000117827 822 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Irx1P81068 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Irx1P81068 Gm20426-201ENSMUST00000173657 440 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Irx1P81068 Ccl19-ps3-201ENSMUST00000179634 324 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Irx1P81068 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Irx1P81068 Gm12407-201ENSMUST00000180219 324 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Irx1P81068 Gm29499-201ENSMUST00000189151 486 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Irx1P81068 Gm28329-201ENSMUST00000191208 689 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Irx1P81068 Gm29171-201ENSMUST00000191397 486 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Irx1P81068 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Irx1P81068 Gm29707-202ENSMUST00000198744 659 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Irx1P81068 Sox2ot-217ENSMUST00000200414 710 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Irx1P81068 Gm43947-201ENSMUST00000203019 959 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Irx1P81068 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Irx1P81068 5830428M24Rik-201ENSMUST00000221805 825 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Irx1P81068 Tsga8-201ENSMUST00000049420 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Irx1P81068 Gm21811-201ENSMUST00000096485 930 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Irx1P81068 Atxn1l-201ENSMUST00000093162 7526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Irx1P81068 Ss18l2-206ENSMUST00000215966 2316 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Irx1P81068 Gm21874-202ENSMUST00000190315 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Irx1P81068 Apol9a-202ENSMUST00000089452 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Irx1P81068 Amph-201ENSMUST00000003345 3367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Irx1P81068 Tcp10a-203ENSMUST00000129709 1778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Irx1P81068 Madd-202ENSMUST00000066473 5974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Irx1P81068 Fam47e-203ENSMUST00000146417 1357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Irx1P81068 Cass4-201ENSMUST00000099061 3731 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Irx1P81068 Gin1-203ENSMUST00000112844 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Irx1P81068 Optc-205ENSMUST00000153617 1615 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Irx1P81068 Gm33366-201ENSMUST00000195583 3827 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Irx1P81068 Gm10748-202ENSMUST00000194396 2379 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Irx1P81068 Gpm6b-201ENSMUST00000060210 2858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Irx1P81068 Ptpre-205ENSMUST00000210833 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Irx1P81068 Mthfsd-201ENSMUST00000047282 8312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Irx1P81068 Adcy8-202ENSMUST00000228014 6900 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Irx1P81068 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Irx1P81068 Dgkh-201ENSMUST00000074729 3967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Irx1P81068 Clec14a-201ENSMUST00000062254 4571 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Irx1P81068 Fut10-201ENSMUST00000066173 3183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Irx1P81068 Rab2b-201ENSMUST00000022765 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Irx1P81068 Slc14a2-202ENSMUST00000163367 1428 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Irx1P81068 Actn2-201ENSMUST00000064204 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Irx1P81068 Taf8-201ENSMUST00000067103 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Irx1P81068 Gm9220-201ENSMUST00000190721 2544 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Irx1P81068 Acot11-202ENSMUST00000102762 5689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Irx1P81068 Tacc2-208ENSMUST00000207549 3492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Irx1P81068 Ifitm10-203ENSMUST00000105988 824 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
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