Protein–RNA interactions for Protein: P35123

Usp4, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 4, mousemouse

Predictions only

Length 962 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp4P35123 Gm13822-201ENSMUST00000127563 346 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Usp4P35123 4931406G06Rik-201ENSMUST00000147848 1252 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Usp4P35123 Agtpbp1-216ENSMUST00000168821 721 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Usp4P35123 Gm19246-201ENSMUST00000173599 255 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Usp4P35123 Gm19412-201ENSMUST00000185388 436 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Usp4P35123 Gm29283-201ENSMUST00000187394 288 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Usp4P35123 Gm9645-201ENSMUST00000197131 792 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Usp4P35123 Gm44270-201ENSMUST00000203084 1234 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Usp4P35123 Gm12216-207ENSMUST00000220191 1073 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Usp4P35123 AC122350.1-201ENSMUST00000228135 533 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Usp4P35123 Cmtm2a-201ENSMUST00000034344 1081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Usp4P35123 Phxr2-201ENSMUST00000060761 1159 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Usp4P35123 Nrp1-201ENSMUST00000026917 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Usp4P35123 Rnf40-201ENSMUST00000033088 3906 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Usp4P35123 Synpo2l-203ENSMUST00000119483 3696 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Usp4P35123 Col24a1-201ENSMUST00000029848 7143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Usp4P35123 Fam47e-203ENSMUST00000146417 1357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Usp4P35123 AC158355.1-201ENSMUST00000215895 1705 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Usp4P35123 Gramd1b-213ENSMUST00000211853 2659 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Usp4P35123 Prom2-202ENSMUST00000103214 4190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Usp4P35123 Eif3d-201ENSMUST00000100484 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Usp4P35123 Wipf1-203ENSMUST00000102680 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Usp4P35123 Capn5-201ENSMUST00000040971 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Usp4P35123 Glt1d1-201ENSMUST00000118139 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Usp4P35123 Traip-201ENSMUST00000049348 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Usp4P35123 Qars-203ENSMUST00000134939 2374 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Usp4P35123 Anxa4-202ENSMUST00000113675 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Usp4P35123 Lrit3-201ENSMUST00000179187 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Usp4P35123 4921507G05Rik-201ENSMUST00000181348 1653 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Usp4P35123 Mamld1-201ENSMUST00000082088 4796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Usp4P35123 Eml5-201ENSMUST00000065716 9482 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Usp4P35123 Mypn-201ENSMUST00000095580 5246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Usp4P35123 Zfp940-202ENSMUST00000108223 2560 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Usp4P35123 Ccdc136-207ENSMUST00000154619 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Usp4P35123 Rnf20-201ENSMUST00000029989 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Usp4P35123 Gm30648-202ENSMUST00000200648 1957 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Usp4P35123 Zmym3-209ENSMUST00000121520 5564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Usp4P35123 4930432L08Rik-201ENSMUST00000132154 1608 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Usp4P35123 Slc6a5-201ENSMUST00000056442 7065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Usp4P35123 Elmo3-201ENSMUST00000109375 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Usp4P35123 Eif2ak4-203ENSMUST00000110869 1715 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Usp4P35123 Zbtb25-202ENSMUST00000176102 2707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Usp4P35123 Gm4294-201ENSMUST00000105169 614 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Usp4P35123 Gm13605-201ENSMUST00000124489 658 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Usp4P35123 4930589P08Rik-201ENSMUST00000129097 1084 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Usp4P35123 Nudt6-207ENSMUST00000141438 899 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Usp4P35123 Gm12951-201ENSMUST00000150216 434 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Usp4P35123 Gm11642-201ENSMUST00000150442 440 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Usp4P35123 Gm15978-201ENSMUST00000161043 738 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Usp4P35123 Gm17058-201ENSMUST00000168951 928 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Usp4P35123 Ppy-201ENSMUST00000017460 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Usp4P35123 Trub2-210ENSMUST00000177467 744 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Usp4P35123 Gm6408-201ENSMUST00000179032 1171 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Usp4P35123 Mir99ahg-209ENSMUST00000182820 835 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Usp4P35123 Gm5542-201ENSMUST00000195485 1089 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Usp4P35123 Gm34023-201ENSMUST00000195539 217 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Usp4P35123 Gm42518-201ENSMUST00000196277 938 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Usp4P35123 Gm43186-201ENSMUST00000198130 824 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Usp4P35123 5830411K02Rik-201ENSMUST00000200000 997 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Usp4P35123 Gm35549-201ENSMUST00000203176 735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Usp4P35123 Gm7972-202ENSMUST00000208453 505 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Usp4P35123 CT485606.1-201ENSMUST00000213187 878 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Usp4P35123 Gm9111-201ENSMUST00000219394 709 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Usp4P35123 Gm6430-201ENSMUST00000054664 1248 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Usp4P35123 Rpl15-201ENSMUST00000079419 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Usp4P35123 Snora73b-201ENSMUST00000083419 205 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Usp4P35123 Mirlet7i-201ENSMUST00000083472 85 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Usp4P35123 Olfr553-201ENSMUST00000098222 981 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Usp4P35123 Olfr1199-201ENSMUST00000099813 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Usp4P35123 1700036A12Rik-202ENSMUST00000190053 1828 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Usp4P35123 Patz1-207ENSMUST00000134089 1904 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Usp4P35123 4833422M21Rik-203ENSMUST00000181747 1365 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Usp4P35123 Gm6170-201ENSMUST00000187672 1388 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Usp4P35123 Hmg20a-206ENSMUST00000217518 2468 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Usp4P35123 Gm43720-201ENSMUST00000159067 6411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Usp4P35123 Zcwpw2-202ENSMUST00000187329 1469 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Usp4P35123 C330027C09Rik-202ENSMUST00000117994 3977 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Usp4P35123 Snhg17-203ENSMUST00000141809 1553 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Usp4P35123 Gm18198-201ENSMUST00000204986 1551 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Usp4P35123 Hyou1-206ENSMUST00000161318 4489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Usp4P35123 Tfdp1-204ENSMUST00000209885 2511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Usp4P35123 Nudcd1-201ENSMUST00000038719 2600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Usp4P35123 Prg4-201ENSMUST00000006171 1869 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Usp4P35123 Zfp286-202ENSMUST00000108705 1979 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Usp4P35123 Fnbp1l-201ENSMUST00000162409 5198 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Usp4P35123 Ccdc85a-206ENSMUST00000146385 3798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Usp4P35123 Hrh1-201ENSMUST00000088987 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Usp4P35123 Tardbp-206ENSMUST00000105702 6425 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Usp4P35123 Mcm3-201ENSMUST00000053266 3031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Usp4P35123 Mrps23-201ENSMUST00000024486 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Usp4P35123 Ptgfr-201ENSMUST00000029670 6624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Usp4P35123 Myo7a-201ENSMUST00000084979 6849 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Usp4P35123 Oprm1-203ENSMUST00000056385 1440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Usp4P35123 9430064I24Rik-201ENSMUST00000206516 2669 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Usp4P35123 Gm15832-201ENSMUST00000146314 1832 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Usp4P35123 Dnm3-202ENSMUST00000086074 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Usp4P35123 Riok3-201ENSMUST00000025270 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Usp4P35123 2810032G03Rik-202ENSMUST00000163627 2514 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Usp4P35123 Smarca2-209ENSMUST00000176030 5862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Usp4P35123 Phf8-203ENSMUST00000112662 3732 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms