Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 Atp5h-208ENSMUST00000180072 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PtprmP28828 Gstp3-202ENSMUST00000189808 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PtprmP28828 Msra-204ENSMUST00000210363 1042 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PtprmP28828 Tex47-201ENSMUST00000088796 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PtprmP28828 Sh2d6-201ENSMUST00000089687 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PtprmP28828 Gm10250-201ENSMUST00000090488 482 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PtprmP28828 Gm42521-201ENSMUST00000199190 2040 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PtprmP28828 Nfe2l1-212ENSMUST00000169828 3530 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PtprmP28828 Cct3-208ENSMUST00000168062 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PtprmP28828 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PtprmP28828 Platr6-201ENSMUST00000180731 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PtprmP28828 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PtprmP28828 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PtprmP28828 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PtprmP28828 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PtprmP28828 Stxbp5l-204ENSMUST00000114781 3544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PtprmP28828 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PtprmP28828 Spag6l-201ENSMUST00000023468 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PtprmP28828 Lrrc61-201ENSMUST00000101436 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PtprmP28828 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PtprmP28828 Rad52-212ENSMUST00000162461 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PtprmP28828 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PtprmP28828 Hacl1-212ENSMUST00000167066 1566 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PtprmP28828 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PtprmP28828 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PtprmP28828 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PtprmP28828 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PtprmP28828 Fcrla-203ENSMUST00000159171 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PtprmP28828 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PtprmP28828 Mir683-2-201ENSMUST00000102099 109 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
PtprmP28828 Lypla1-202ENSMUST00000115529 930 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PtprmP28828 Gm13542-201ENSMUST00000118484 637 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
PtprmP28828 Gm13551-201ENSMUST00000121286 430 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
PtprmP28828 Gm12338-201ENSMUST00000122170 192 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
PtprmP28828 Gm17019-201ENSMUST00000167908 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PtprmP28828 Mir683-1-201ENSMUST00000179371 109 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
PtprmP28828 Gm26609-201ENSMUST00000181302 852 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PtprmP28828 Zfp572-201ENSMUST00000183674 1098 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PtprmP28828 Gm5543-201ENSMUST00000193329 1091 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
PtprmP28828 Gm31363-201ENSMUST00000199362 541 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PtprmP28828 Gm7424-201ENSMUST00000206919 902 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
PtprmP28828 AC123692.1-201ENSMUST00000227514 730 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
PtprmP28828 Gm4883-201ENSMUST00000085702 528 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
PtprmP28828 Gm4925-201ENSMUST00000092231 397 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
PtprmP28828 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PtprmP28828 1700061G19Rik-201ENSMUST00000025048 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PtprmP28828 Irf9-202ENSMUST00000130697 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PtprmP28828 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PtprmP28828 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PtprmP28828 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PtprmP28828 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PtprmP28828 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PtprmP28828 Rufy2-202ENSMUST00000119567 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PtprmP28828 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PtprmP28828 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PtprmP28828 Kyat1-201ENSMUST00000044038 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PtprmP28828 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PtprmP28828 Cdc42ep4-201ENSMUST00000053536 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PtprmP28828 Tab1-201ENSMUST00000023050 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PtprmP28828 Fuom-202ENSMUST00000120034 680 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
PtprmP28828 Gm16131-201ENSMUST00000131007 659 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
PtprmP28828 Gzmn-201ENSMUST00000015587 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PtprmP28828 Gnb2-214ENSMUST00000168746 802 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PtprmP28828 Gm38153-201ENSMUST00000195484 472 ntBASIC15.08■□□□□ 0
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PtprmP28828 Olfr1419-201ENSMUST00000087857 1160 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
PtprmP28828 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PtprmP28828 Abcf3-201ENSMUST00000003319 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PtprmP28828 Bcl2-202ENSMUST00000189999 2841 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PtprmP28828 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PtprmP28828 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PtprmP28828 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PtprmP28828 F730016J06Rik-201ENSMUST00000126140 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PtprmP28828 H2-T3-201ENSMUST00000025312 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PtprmP28828 C5ar1-202ENSMUST00000168818 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PtprmP28828 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PtprmP28828 Lin54-210ENSMUST00000154921 3734 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PtprmP28828 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PtprmP28828 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PtprmP28828 Prrxl1-204ENSMUST00000189022 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PtprmP28828 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PtprmP28828 Gm42962-201ENSMUST00000201966 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PtprmP28828 Cfi-201ENSMUST00000077918 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PtprmP28828 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PtprmP28828 Ccdc191-201ENSMUST00000122014 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PtprmP28828 Gm44629-201ENSMUST00000206951 1840 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PtprmP28828 Dnaja1-201ENSMUST00000030118 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PtprmP28828 Phyhd1-203ENSMUST00000113643 1195 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PtprmP28828 Gm11520-201ENSMUST00000122837 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PtprmP28828 1700019E08Rik-201ENSMUST00000134308 424 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PtprmP28828 Gm13405-201ENSMUST00000146769 708 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
PtprmP28828 Gm26483-201ENSMUST00000158016 104 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PtprmP28828 Gm24074-201ENSMUST00000158178 260 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PtprmP28828 Gm27241-201ENSMUST00000183517 622 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
PtprmP28828 4930568A12Rik-201ENSMUST00000186117 498 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
PtprmP28828 5031425E22Rik-203ENSMUST00000188328 828 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PtprmP28828 Tmem265-202ENSMUST00000190278 587 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
PtprmP28828 Gm5150-202ENSMUST00000194367 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PtprmP28828 Ucma-205ENSMUST00000195688 554 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PtprmP28828 Gm21149-201ENSMUST00000197995 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
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