Protein–RNA interactions for Protein: P23336

Ggta1, N-acetyllactosaminide alpha-1,3-galactosyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggta1P23336 Greb1l-201ENSMUST00000048977 8414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ggta1P23336 Pfkfb3-202ENSMUST00000049849 2076 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ggta1P23336 Nmt2-201ENSMUST00000081932 4461 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ggta1P23336 Gm28042-203ENSMUST00000156805 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ggta1P23336 Pls3-201ENSMUST00000033547 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ggta1P23336 Slc38a3-202ENSMUST00000167868 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ggta1P23336 Ss18l2-206ENSMUST00000215966 2316 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ggta1P23336 Magee2-201ENSMUST00000033575 2316 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ggta1P23336 Myt1l-201ENSMUST00000021009 5027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ggta1P23336 Kalrn-202ENSMUST00000089655 6506 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ggta1P23336 Tarm1-203ENSMUST00000203821 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ggta1P23336 Tmem161a-201ENSMUST00000002413 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ggta1P23336 Hhip-201ENSMUST00000079038 9074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
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Ggta1P23336 AC149588.2-201ENSMUST00000228182 1859 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Ggta1P23336 Tyro3-202ENSMUST00000110783 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ggta1P23336 Acox3-203ENSMUST00000114237 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ggta1P23336 Kcnh5-201ENSMUST00000042299 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ggta1P23336 Ltbp1-203ENSMUST00000112516 5140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
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Ggta1P23336 Gm7642-201ENSMUST00000216345 1809 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Ggta1P23336 Acnat1-202ENSMUST00000107697 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ggta1P23336 Gm3765-201ENSMUST00000130985 1447 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Ggta1P23336 Trim23-203ENSMUST00000069187 3546 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ggta1P23336 Gpr149-201ENSMUST00000058535 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ggta1P23336 Epb41-202ENSMUST00000054917 4948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ggta1P23336 Odf2l-204ENSMUST00000106192 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ggta1P23336 Ceacam1-205ENSMUST00000206171 1722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ggta1P23336 Thsd4-201ENSMUST00000034829 4816 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ggta1P23336 Pcdhga7-201ENSMUST00000192511 4730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ggta1P23336 Ackr2-202ENSMUST00000214340 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ggta1P23336 Lrrc61-201ENSMUST00000101436 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ggta1P23336 Col11a1-201ENSMUST00000092155 7667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ggta1P23336 Zfp423-203ENSMUST00000165770 4334 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ggta1P23336 Lhx9-205ENSMUST00000112030 4633 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ggta1P23336 Bco1-203ENSMUST00000176860 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ggta1P23336 A130071D04Rik-201ENSMUST00000194467 5864 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
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Ggta1P23336 Thg1l-201ENSMUST00000011398 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ggta1P23336 Trpv6-201ENSMUST00000031902 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ggta1P23336 C030037D09Rik-203ENSMUST00000138007 3220 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ggta1P23336 Gtf2h5-202ENSMUST00000100955 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
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Ggta1P23336 Gm26982-201ENSMUST00000182250 1151 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Ggta1P23336 Gm29283-201ENSMUST00000187394 288 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
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Ggta1P23336 Nnmt-201ENSMUST00000034808 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
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Ggta1P23336 Rfesd-201ENSMUST00000050997 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ggta1P23336 Lamb1-205ENSMUST00000169088 5557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ggta1P23336 Cpt1c-201ENSMUST00000063761 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ggta1P23336 Fyb2-202ENSMUST00000106804 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
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Ggta1P23336 A230009B12Rik-202ENSMUST00000159602 1810 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ggta1P23336 Gm17281-201ENSMUST00000180732 3589 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ggta1P23336 Prkcd-201ENSMUST00000022521 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
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Ggta1P23336 Unkl-201ENSMUST00000015271 3414 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ggta1P23336 Ric8a-201ENSMUST00000026558 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
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Ggta1P23336 Smc4-202ENSMUST00000107803 3983 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ggta1P23336 Abi1-206ENSMUST00000126112 3360 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ggta1P23336 Pif1-203ENSMUST00000134538 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ggta1P23336 Tas1r2-202ENSMUST00000166773 2524 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ggta1P23336 Ccdc189-201ENSMUST00000072155 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ggta1P23336 Atxn1l-201ENSMUST00000093162 7526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ggta1P23336 Gm38140-201ENSMUST00000193617 2755 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Ggta1P23336 Slc37a4-202ENSMUST00000213268 1353 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ggta1P23336 Ncf1-202ENSMUST00000111275 2721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ggta1P23336 Ndrg4-203ENSMUST00000080666 2738 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ggta1P23336 Stkld1-201ENSMUST00000055406 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ggta1P23336 Cops3-201ENSMUST00000019517 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ggta1P23336 Ddx54-201ENSMUST00000031598 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ggta1P23336 Hnrnph2-203ENSMUST00000074950 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ggta1P23336 Coq8a-201ENSMUST00000027766 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ggta1P23336 Harbi1-202ENSMUST00000111322 1316 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ggta1P23336 Gm6641-201ENSMUST00000196100 1315 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Ggta1P23336 Peg3-201ENSMUST00000051209 8694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ggta1P23336 Hacl1-212ENSMUST00000167066 1566 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ggta1P23336 Ank3-242ENSMUST00000183261 4999 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
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Ggta1P23336 Kat6b-204ENSMUST00000182405 6977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ggta1P23336 Pip5k1b-201ENSMUST00000025800 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
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Ggta1P23336 Ighv1-61-201ENSMUST00000103531 351 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
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Ggta1P23336 Smim6-201ENSMUST00000132961 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
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