Protein–RNA interactions for Protein: P20801

Tnnc2, Troponin C, skeletal muscle, mousemouse

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Length 160 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnc2P20801 Tmcc2-201ENSMUST00000045473 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tnnc2P20801 Vmn2r-ps25-201ENSMUST00000202322 2321 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Tnnc2P20801 Atxn2l-206ENSMUST00000206577 3894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tnnc2P20801 Mab21l1-201ENSMUST00000075422 2492 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tnnc2P20801 Gm38140-201ENSMUST00000193617 2755 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Tnnc2P20801 Dysf-202ENSMUST00000089595 6613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tnnc2P20801 Impdh2-ps-201ENSMUST00000120826 1545 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
Tnnc2P20801 Triml2-202ENSMUST00000209200 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Tnnc2P20801 Lrp2bp-201ENSMUST00000066451 1525 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Tnnc2P20801 Cct3-204ENSMUST00000164166 1804 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Tnnc2P20801 Cklf-202ENSMUST00000098464 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Tnnc2P20801 Slc38a5-202ENSMUST00000115590 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Tnnc2P20801 Tmcc1-210ENSMUST00000204353 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Tnnc2P20801 Lig1-211ENSMUST00000177588 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Tnnc2P20801 Scyl2-204ENSMUST00000174252 4817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Tnnc2P20801 Snapc1-201ENSMUST00000021532 6275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tnnc2P20801 Rnf20-201ENSMUST00000029989 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tnnc2P20801 Spata5-202ENSMUST00000108112 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tnnc2P20801 Atxn1l-202ENSMUST00000212605 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tnnc2P20801 Kat6b-204ENSMUST00000182405 6977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tnnc2P20801 4930402K13Rik-201ENSMUST00000059967 1781 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tnnc2P20801 Ccr6-205ENSMUST00000177568 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tnnc2P20801 Ift88-201ENSMUST00000122063 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tnnc2P20801 Gpr37-201ENSMUST00000054867 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tnnc2P20801 D030068K23Rik-201ENSMUST00000180382 2617 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tnnc2P20801 Wdr46-ps-201ENSMUST00000200591 1712 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Tnnc2P20801 Cldn12-201ENSMUST00000060947 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tnnc2P20801 Gm17151-201ENSMUST00000105760 367 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tnnc2P20801 Ndufb5-204ENSMUST00000127477 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tnnc2P20801 Gm16323-201ENSMUST00000134920 556 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tnnc2P20801 Gm5244-201ENSMUST00000164001 339 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Tnnc2P20801 Park2-203ENSMUST00000168593 735 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tnnc2P20801 Taar8c-201ENSMUST00000170267 1035 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tnnc2P20801 Platr17-201ENSMUST00000172817 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tnnc2P20801 Gm24809-201ENSMUST00000175318 271 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Tnnc2P20801 Gm29521-201ENSMUST00000187061 745 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tnnc2P20801 Gm7596-202ENSMUST00000202171 737 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tnnc2P20801 Gm18059-201ENSMUST00000208073 580 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Tnnc2P20801 AC116680.1-201ENSMUST00000222804 613 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tnnc2P20801 Gm26670-202ENSMUST00000226862 340 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Tnnc2P20801 Taar8a-201ENSMUST00000051133 1035 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tnnc2P20801 Mcts2-201ENSMUST00000062148 917 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tnnc2P20801 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tnnc2P20801 Slc6a12-209ENSMUST00000171008 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tnnc2P20801 Tiam1-203ENSMUST00000114122 4596 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tnnc2P20801 Abca3-203ENSMUST00000117337 5202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tnnc2P20801 Gm17281-201ENSMUST00000180732 3589 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tnnc2P20801 Mirg-201ENSMUST00000181496 1906 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tnnc2P20801 Loxhd1-202ENSMUST00000096547 6595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tnnc2P20801 Anks1b-233ENSMUST00000183156 4248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tnnc2P20801 Tjp1-201ENSMUST00000032729 6102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tnnc2P20801 Limk2-201ENSMUST00000101638 3514 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tnnc2P20801 Samhd1-203ENSMUST00000109549 3245 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tnnc2P20801 Cdc20b-204ENSMUST00000181568 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tnnc2P20801 CT030159.3-201ENSMUST00000222936 1481 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tnnc2P20801 Eef2k-203ENSMUST00000106488 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tnnc2P20801 Dpt-201ENSMUST00000027861 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tnnc2P20801 Exoc3l4-201ENSMUST00000072646 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tnnc2P20801 Svil-211ENSMUST00000143254 6594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tnnc2P20801 Sgk1-213ENSMUST00000164659 2602 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tnnc2P20801 4933409D19Rik-201ENSMUST00000193674 1557 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tnnc2P20801 Plpbp-203ENSMUST00000209525 5767 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tnnc2P20801 Flad1-202ENSMUST00000107426 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tnnc2P20801 Tmcc2-203ENSMUST00000132435 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tnnc2P20801 Col19a1-202ENSMUST00000115244 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tnnc2P20801 Gm14820-201ENSMUST00000126286 1449 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tnnc2P20801 Arrb2-201ENSMUST00000079056 1443 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tnnc2P20801 Gm36987-201ENSMUST00000194704 2979 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Tnnc2P20801 Serpina1f-202ENSMUST00000117053 2830 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tnnc2P20801 A330033J07Rik-201ENSMUST00000180921 2816 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tnnc2P20801 Ighv1-52-201ENSMUST00000103522 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tnnc2P20801 Ighv1-61-201ENSMUST00000103531 351 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tnnc2P20801 Ifna2-201ENSMUST00000105147 1032 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tnnc2P20801 Nop56-204ENSMUST00000136621 868 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tnnc2P20801 Rtl1-201ENSMUST00000149046 6358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tnnc2P20801 Ubl5-211ENSMUST00000162303 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tnnc2P20801 Gm16755-201ENSMUST00000180595 933 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tnnc2P20801 Gm8705-201ENSMUST00000180823 812 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tnnc2P20801 Gm37301-201ENSMUST00000195412 568 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Tnnc2P20801 Klk1b15-ps-201ENSMUST00000206273 715 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Tnnc2P20801 Gm45338-204ENSMUST00000210658 1105 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tnnc2P20801 Gm9487-201ENSMUST00000216600 472 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Tnnc2P20801 Stt3a-209ENSMUST00000217599 285 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tnnc2P20801 AC154572.1-201ENSMUST00000226098 1204 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Tnnc2P20801 Hddc2-201ENSMUST00000000304 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tnnc2P20801 Gm4744-201ENSMUST00000073642 792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tnnc2P20801 Gm4950-201ENSMUST00000091905 618 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tnnc2P20801 Gm10334-201ENSMUST00000095999 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tnnc2P20801 Stard4-201ENSMUST00000025236 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tnnc2P20801 Mical1-202ENSMUST00000099934 3292 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tnnc2P20801 Pcsk9-201ENSMUST00000049507 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tnnc2P20801 Nckap5-212ENSMUST00000162877 2630 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tnnc2P20801 Gm44740-201ENSMUST00000205603 1614 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Tnnc2P20801 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tnnc2P20801 Lrrc4-201ENSMUST00000062304 3615 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tnnc2P20801 Cyp2j13-202ENSMUST00000097973 1648 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tnnc2P20801 Hectd4-201ENSMUST00000042614 15482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tnnc2P20801 Astn1-209ENSMUST00000194369 3344 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tnnc2P20801 Dcaf12-201ENSMUST00000030145 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tnnc2P20801 Jak3-202ENSMUST00000110012 3774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms