Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ02

Gm2056, Predicted gene 2056, mousemouse

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Length 144 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2056J3QQ02 L1cam-202ENSMUST00000102871 5113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm2056J3QQ02 Zfp518b-203ENSMUST00000179555 6816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm2056J3QQ02 Zfp462-202ENSMUST00000079605 4684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm2056J3QQ02 Rnf144b-201ENSMUST00000068891 4640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm2056J3QQ02 Amigo3-201ENSMUST00000085060 2543 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm2056J3QQ02 Tmem47-201ENSMUST00000026760 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm2056J3QQ02 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm2056J3QQ02 Dclre1b-203ENSMUST00000106832 2299 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm2056J3QQ02 Gm17746-201ENSMUST00000223429 3772 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm2056J3QQ02 Gm9466-201ENSMUST00000218144 2246 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm2056J3QQ02 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm2056J3QQ02 Manea-201ENSMUST00000041374 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm2056J3QQ02 Abi1-209ENSMUST00000140164 3403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm2056J3QQ02 Vgll4-201ENSMUST00000032459 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm2056J3QQ02 Fam120b-201ENSMUST00000055352 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm2056J3QQ02 Tlr12-201ENSMUST00000074829 3177 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm2056J3QQ02 Camk1d-201ENSMUST00000044009 6962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm2056J3QQ02 Slc6a12-205ENSMUST00000166457 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm2056J3QQ02 Tcirg1-204ENSMUST00000126070 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm2056J3QQ02 Tmem161a-201ENSMUST00000002413 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm2056J3QQ02 Galr1-201ENSMUST00000065224 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm2056J3QQ02 Herc4-201ENSMUST00000020258 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm2056J3QQ02 Zfp869-201ENSMUST00000080987 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm2056J3QQ02 Pcdhgb4-202ENSMUST00000195363 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm2056J3QQ02 Gabrb2-205ENSMUST00000192403 1539 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm2056J3QQ02 Calhm2-201ENSMUST00000035822 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm2056J3QQ02 Smco1-201ENSMUST00000093183 1408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm2056J3QQ02 Myh1-201ENSMUST00000018637 5938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm2056J3QQ02 Tardbp-210ENSMUST00000172073 6513 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm2056J3QQ02 Inpp4a-206ENSMUST00000132615 3038 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm2056J3QQ02 Ighv8-11-201ENSMUST00000103536 358 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm2056J3QQ02 Gm14234-201ENSMUST00000119539 845 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm2056J3QQ02 Gm15569-201ENSMUST00000133675 594 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm2056J3QQ02 Polr3c-205ENSMUST00000141377 808 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm2056J3QQ02 Gm15875-201ENSMUST00000152264 273 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm2056J3QQ02 Gm23673-201ENSMUST00000157474 298 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm2056J3QQ02 Gm16165-201ENSMUST00000160140 795 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm2056J3QQ02 Gm17214-201ENSMUST00000164501 541 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm2056J3QQ02 Prdx2-208ENSMUST00000164807 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm2056J3QQ02 Gm5529-201ENSMUST00000165691 891 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm2056J3QQ02 Gm20392-201ENSMUST00000173047 701 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm2056J3QQ02 Gm26119-201ENSMUST00000175601 104 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm2056J3QQ02 Olfr1432-201ENSMUST00000180978 930 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm2056J3QQ02 Gm38018-201ENSMUST00000195651 540 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm2056J3QQ02 Gm31274-201ENSMUST00000197356 229 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm2056J3QQ02 Cox6b1-204ENSMUST00000208838 354 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm2056J3QQ02 AC099934.4-201ENSMUST00000220745 523 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm2056J3QQ02 Gm19540-201ENSMUST00000221843 810 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm2056J3QQ02 Gm31513-201ENSMUST00000223261 684 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm2056J3QQ02 Lsm8-201ENSMUST00000056398 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm2056J3QQ02 Vmn1r231-201ENSMUST00000061278 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm2056J3QQ02 Sept4-202ENSMUST00000063156 1245 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm2056J3QQ02 Zfp865-202ENSMUST00000076791 1129 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm2056J3QQ02 Olfr128-201ENSMUST00000080231 1050 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm2056J3QQ02 Vmn1r85-201ENSMUST00000094829 927 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm2056J3QQ02 Spice1-201ENSMUST00000050897 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm2056J3QQ02 Gm20089-201ENSMUST00000192391 2084 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm2056J3QQ02 Cinp-201ENSMUST00000043716 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm2056J3QQ02 Zfp286-202ENSMUST00000108705 1979 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm2056J3QQ02 Tmod2-201ENSMUST00000064433 9884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm2056J3QQ02 Cbl-211ENSMUST00000206720 11372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm2056J3QQ02 Anxa9-202ENSMUST00000107183 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm2056J3QQ02 Hdac6-202ENSMUST00000115642 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm2056J3QQ02 Suclg2-201ENSMUST00000079847 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm2056J3QQ02 Tiam1-203ENSMUST00000114122 4596 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm2056J3QQ02 Son-203ENSMUST00000117633 8731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm2056J3QQ02 Il6st-201ENSMUST00000070731 5207 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm2056J3QQ02 Ccdc136-201ENSMUST00000096084 3826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm2056J3QQ02 Dcun1d3-202ENSMUST00000098080 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm2056J3QQ02 Cenpn-203ENSMUST00000212263 1616 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm2056J3QQ02 Gpr173-201ENSMUST00000070316 4855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm2056J3QQ02 Gm44153-201ENSMUST00000204162 1580 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm2056J3QQ02 Oprm1-208ENSMUST00000092734 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm2056J3QQ02 Parp11-202ENSMUST00000112191 3414 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm2056J3QQ02 Lhx9-205ENSMUST00000112030 4633 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm2056J3QQ02 Gm39214-201ENSMUST00000210912 1542 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm2056J3QQ02 Rxrg-201ENSMUST00000015987 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm2056J3QQ02 Recql4-201ENSMUST00000036852 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm2056J3QQ02 Ttll1-201ENSMUST00000016897 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm2056J3QQ02 Asb7-202ENSMUST00000124899 4928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm2056J3QQ02 Nono-201ENSMUST00000033673 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm2056J3QQ02 Lgals12-201ENSMUST00000079902 2590 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm2056J3QQ02 Gtf3c1-204ENSMUST00000205659 6570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm2056J3QQ02 Gm42499-201ENSMUST00000196193 1412 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm2056J3QQ02 5330413D20Rik-201ENSMUST00000208649 1416 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm2056J3QQ02 C530043K16Rik-201ENSMUST00000201865 3109 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm2056J3QQ02 Tubd1-203ENSMUST00000108030 1964 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm2056J3QQ02 Fggy-201ENSMUST00000043335 1910 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm2056J3QQ02 Tmcc2-203ENSMUST00000132435 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm2056J3QQ02 Slc38a5-203ENSMUST00000115591 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm2056J3QQ02 Plin2-201ENSMUST00000000466 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm2056J3QQ02 Gm14005-209ENSMUST00000224993 1832 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm2056J3QQ02 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm2056J3QQ02 Glb1l-201ENSMUST00000113623 2339 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm2056J3QQ02 Rnf214-208ENSMUST00000161187 2847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm2056J3QQ02 Igkv3-10-201ENSMUST00000103397 356 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm2056J3QQ02 Gm11996-201ENSMUST00000117538 915 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm2056J3QQ02 Gm15036-201ENSMUST00000118880 400 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm2056J3QQ02 Gm11952-201ENSMUST00000121172 821 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm2056J3QQ02 Gm12453-201ENSMUST00000121981 331 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
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