Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCU6

Mrpl4, 39S ribosomal protein L4, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 294 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl4Q9DCU6 Tubb1-201ENSMUST00000016399 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Mrpl4Q9DCU6 Fam47e-202ENSMUST00000131166 1500 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Mrpl4Q9DCU6 Cops3-201ENSMUST00000019517 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Mrpl4Q9DCU6 Msh3-201ENSMUST00000022220 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Mrpl4Q9DCU6 9530026P05Rik-204ENSMUST00000204449 1740 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Mrpl4Q9DCU6 Spns3-201ENSMUST00000021154 1804 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Mrpl4Q9DCU6 Fam222b-203ENSMUST00000155571 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Mrpl4Q9DCU6 Arhgap25-201ENSMUST00000071024 2635 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Mrpl4Q9DCU6 Eif4g2-206ENSMUST00000161051 3548 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Mrpl4Q9DCU6 Gm23061-201ENSMUST00000102348 116 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Mrpl4Q9DCU6 Art5-203ENSMUST00000106935 495 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Mrpl4Q9DCU6 Pfn1-202ENSMUST00000108549 608 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Mrpl4Q9DCU6 Oprl1-204ENSMUST00000108767 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Mrpl4Q9DCU6 Sfxn5-204ENSMUST00000113788 514 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Mrpl4Q9DCU6 Gm11380-201ENSMUST00000118067 560 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Mrpl4Q9DCU6 Gm13937-201ENSMUST00000121000 988 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Mrpl4Q9DCU6 Rpsa-ps4-201ENSMUST00000121691 888 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Mrpl4Q9DCU6 Treml4-202ENSMUST00000125426 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Mrpl4Q9DCU6 Gm15978-201ENSMUST00000161043 738 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Mrpl4Q9DCU6 Gm5244-201ENSMUST00000164001 339 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Mrpl4Q9DCU6 Park2-203ENSMUST00000168593 735 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Mrpl4Q9DCU6 Agtpbp1-219ENSMUST00000170378 653 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Mrpl4Q9DCU6 Gm37638-201ENSMUST00000194337 1123 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Mrpl4Q9DCU6 Gm9884-201ENSMUST00000194343 1222 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Mrpl4Q9DCU6 Gm42660-201ENSMUST00000197733 947 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Mrpl4Q9DCU6 Ube2d3-216ENSMUST00000199613 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Mrpl4Q9DCU6 Gm7880-201ENSMUST00000203748 871 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Mrpl4Q9DCU6 Gm8162-201ENSMUST00000213951 665 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Mrpl4Q9DCU6 Park2-210ENSMUST00000218435 865 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Mrpl4Q9DCU6 CT030166.5-201ENSMUST00000222249 420 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Mrpl4Q9DCU6 Psmb7-201ENSMUST00000028083 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Mrpl4Q9DCU6 Mrps34-201ENSMUST00000043907 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Mrpl4Q9DCU6 Krtap4-13-201ENSMUST00000050106 815 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Mrpl4Q9DCU6 Fam83a-201ENSMUST00000050374 1189 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Mrpl4Q9DCU6 Acyp1-201ENSMUST00000008966 648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Mrpl4Q9DCU6 Airn-205ENSMUST00000161890 1375 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Mrpl4Q9DCU6 AC156631.1-201ENSMUST00000215213 1358 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Mrpl4Q9DCU6 AC108416.1-201ENSMUST00000228755 1558 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Mrpl4Q9DCU6 Etv3-201ENSMUST00000117293 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Mrpl4Q9DCU6 Gm43375-201ENSMUST00000196705 2480 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Mrpl4Q9DCU6 Abcf3-201ENSMUST00000003319 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Mrpl4Q9DCU6 Ctcfl-202ENSMUST00000179693 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Mrpl4Q9DCU6 Sept2-201ENSMUST00000027495 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Mrpl4Q9DCU6 Gria4-202ENSMUST00000063508 5352 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Mrpl4Q9DCU6 Cep250-204ENSMUST00000109619 7977 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Mrpl4Q9DCU6 Cep250-201ENSMUST00000039994 7979 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Mrpl4Q9DCU6 Asap1-202ENSMUST00000110114 4409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Mrpl4Q9DCU6 Lig3-212ENSMUST00000173727 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Mrpl4Q9DCU6 Fam90a1b-201ENSMUST00000044989 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Mrpl4Q9DCU6 Arhgap33os-201ENSMUST00000124276 2648 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Mrpl4Q9DCU6 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Mrpl4Q9DCU6 Dock6-207ENSMUST00000217336 6880 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Mrpl4Q9DCU6 Bcl9l-203ENSMUST00000218183 6771 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Mrpl4Q9DCU6 Patz1-207ENSMUST00000134089 1904 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Mrpl4Q9DCU6 Zbtb43-203ENSMUST00000113156 1828 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Mrpl4Q9DCU6 Myc-206ENSMUST00000167731 1821 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Mrpl4Q9DCU6 Gm37697-201ENSMUST00000195680 1844 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Mrpl4Q9DCU6 Gm45140-202ENSMUST00000204419 5061 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Mrpl4Q9DCU6 Zfp280b-201ENSMUST00000061617 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Mrpl4Q9DCU6 Krt34-201ENSMUST00000056362 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Mrpl4Q9DCU6 Gm13104-201ENSMUST00000119651 1446 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Mrpl4Q9DCU6 Ccdc96-201ENSMUST00000060100 3585 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Mrpl4Q9DCU6 Ndor1-201ENSMUST00000100329 4517 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Mrpl4Q9DCU6 Axin2-202ENSMUST00000106711 2551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Mrpl4Q9DCU6 Sgk1-203ENSMUST00000100036 2476 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Mrpl4Q9DCU6 Sgk1-201ENSMUST00000020145 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Mrpl4Q9DCU6 Ttll5-202ENSMUST00000040273 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Mrpl4Q9DCU6 Nf2-202ENSMUST00000056290 2394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Mrpl4Q9DCU6 Atp11c-202ENSMUST00000101527 6044 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Mrpl4Q9DCU6 Pcdhga1-201ENSMUST00000194190 4692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Mrpl4Q9DCU6 Slc25a36-202ENSMUST00000085206 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Mrpl4Q9DCU6 Arhgef2-231ENSMUST00000177498 3966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Mrpl4Q9DCU6 9530059O14Rik-201ENSMUST00000181107 3978 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Mrpl4Q9DCU6 Ccdc78-201ENSMUST00000095500 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Mrpl4Q9DCU6 Gm20649-201ENSMUST00000160950 2740 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Mrpl4Q9DCU6 Apbb1-217ENSMUST00000191011 2712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Mrpl4Q9DCU6 Wipf2-201ENSMUST00000037480 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Mrpl4Q9DCU6 Ccdc85a-206ENSMUST00000146385 3798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Mrpl4Q9DCU6 Lrrc8b-201ENSMUST00000112707 6726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Mrpl4Q9DCU6 Pnpla6-212ENSMUST00000208002 4444 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Mrpl4Q9DCU6 Gm12829-201ENSMUST00000146346 2434 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Mrpl4Q9DCU6 Amz1-202ENSMUST00000120630 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Mrpl4Q9DCU6 Ifit1bl1-202ENSMUST00000168254 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Mrpl4Q9DCU6 Gm16518-201ENSMUST00000117960 508 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Mrpl4Q9DCU6 Igf1-205ENSMUST00000121952 798 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Mrpl4Q9DCU6 Rbm18-202ENSMUST00000122456 781 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Mrpl4Q9DCU6 6820431F20Rik-201ENSMUST00000150051 936 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Mrpl4Q9DCU6 Pet100-201ENSMUST00000156380 1193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Mrpl4Q9DCU6 Gm9081-201ENSMUST00000182346 991 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Mrpl4Q9DCU6 Abhd14a-204ENSMUST00000185334 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Mrpl4Q9DCU6 Rpain-201ENSMUST00000018593 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Mrpl4Q9DCU6 Tmem108-203ENSMUST00000189066 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Mrpl4Q9DCU6 Gm3726-201ENSMUST00000203110 785 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Mrpl4Q9DCU6 Timm10b-210ENSMUST00000209588 373 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Mrpl4Q9DCU6 D830035M03Rik-201ENSMUST00000213677 1041 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Mrpl4Q9DCU6 Akr1c18-201ENSMUST00000021635 1200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Mrpl4Q9DCU6 Gm7525-201ENSMUST00000219425 454 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Mrpl4Q9DCU6 Gm18556-201ENSMUST00000219748 1031 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Mrpl4Q9DCU6 CT009718.3-201ENSMUST00000221116 367 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Mrpl4Q9DCU6 AC134869.3-201ENSMUST00000225581 343 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64 ms