Protein–RNA interactions for Protein: Q9D478

Odf2l, Outer dense fiber protein 2-like, mousemouse

Predictions only

Length 642 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf2lQ9D478 Myo15b-201ENSMUST00000040703 2825 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Odf2lQ9D478 Mybph-202ENSMUST00000191577 2320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Odf2lQ9D478 Ddr1-212ENSMUST00000166980 3627 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Odf2lQ9D478 Rbbp5-201ENSMUST00000027700 3385 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Odf2lQ9D478 Tspan18-202ENSMUST00000111265 3751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Odf2lQ9D478 Nckap5-212ENSMUST00000162877 2630 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Odf2lQ9D478 Rbbp5-202ENSMUST00000187505 1977 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Odf2lQ9D478 Gnl2-201ENSMUST00000030684 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Odf2lQ9D478 Arhgap11a-202ENSMUST00000110947 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Odf2lQ9D478 Ctcfl-202ENSMUST00000179693 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Odf2lQ9D478 Gm35363-201ENSMUST00000209330 1317 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Odf2lQ9D478 Ppargc1b-201ENSMUST00000063307 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Odf2lQ9D478 Mcf2l-202ENSMUST00000098927 3215 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Odf2lQ9D478 Cldn19-202ENSMUST00000094823 4168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Odf2lQ9D478 Pcdh10-202ENSMUST00000170695 8234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Odf2lQ9D478 Hyal2-206ENSMUST00000195681 2968 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Odf2lQ9D478 Anp32e-202ENSMUST00000165307 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Odf2lQ9D478 Lrtm2-204ENSMUST00000168793 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Odf2lQ9D478 Samd4-206ENSMUST00000137543 6874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Odf2lQ9D478 Airn-205ENSMUST00000161890 1375 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Odf2lQ9D478 Pcdhga1-201ENSMUST00000194190 4692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Odf2lQ9D478 Cd6-203ENSMUST00000080292 3032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Odf2lQ9D478 Col19a1-202ENSMUST00000115244 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Odf2lQ9D478 Myh1-203ENSMUST00000124516 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Odf2lQ9D478 Tacc2-217ENSMUST00000209108 3310 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Odf2lQ9D478 Anxa3-205ENSMUST00000198631 1523 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Odf2lQ9D478 Supt3-201ENSMUST00000050630 1508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Odf2lQ9D478 Saxo2-201ENSMUST00000056728 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Odf2lQ9D478 Vezt-202ENSMUST00000118077 2223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Odf2lQ9D478 Zdhhc21-201ENSMUST00000030110 8763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Odf2lQ9D478 Gm6559-201ENSMUST00000204678 1694 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Odf2lQ9D478 Nox4-201ENSMUST00000032781 3753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Odf2lQ9D478 Gpm6b-209ENSMUST00000112235 4480 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Odf2lQ9D478 A230009B12Rik-202ENSMUST00000159602 1810 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Odf2lQ9D478 Tdrd3-202ENSMUST00000168275 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Odf2lQ9D478 Trav13d-1-201ENSMUST00000103588 396 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Odf2lQ9D478 Gm25063-201ENSMUST00000104666 94 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Odf2lQ9D478 Oprl1-204ENSMUST00000108767 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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Odf2lQ9D478 Gm12791-201ENSMUST00000120788 655 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Odf2lQ9D478 Gm12030-201ENSMUST00000121917 223 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Odf2lQ9D478 Gm12208-201ENSMUST00000122004 163 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Odf2lQ9D478 Smim6-201ENSMUST00000132961 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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Odf2lQ9D478 Prr30-202ENSMUST00000187304 2104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
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Odf2lQ9D478 Gm42817-201ENSMUST00000198962 607 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
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Odf2lQ9D478 Mgp-201ENSMUST00000032342 617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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Odf2lQ9D478 Wfdc6a-201ENSMUST00000099096 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Odf2lQ9D478 Dok4-204ENSMUST00000212810 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Odf2lQ9D478 Oprm1-208ENSMUST00000092734 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Odf2lQ9D478 Gm26846-201ENSMUST00000181865 4869 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Odf2lQ9D478 Adcy6-201ENSMUST00000096224 6038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Odf2lQ9D478 Inf2-201ENSMUST00000101029 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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Odf2lQ9D478 Pcsk9-201ENSMUST00000049507 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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Odf2lQ9D478 Snw1-201ENSMUST00000021428 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Odf2lQ9D478 Ncor2-202ENSMUST00000086083 8575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Odf2lQ9D478 Alms1-ps2-202ENSMUST00000161983 2290 ntBASIC12.83□□□□□ -0.35
Odf2lQ9D478 Apol7a-203ENSMUST00000175919 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Odf2lQ9D478 Atp11c-201ENSMUST00000033480 5939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
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Odf2lQ9D478 Gm17745-201ENSMUST00000212186 1692 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Odf2lQ9D478 Ypel4-201ENSMUST00000090729 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
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Odf2lQ9D478 Fer1l4-201ENSMUST00000109611 6106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
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Odf2lQ9D478 Pde6b-201ENSMUST00000031456 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Odf2lQ9D478 Bicd2-202ENSMUST00000110084 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Odf2lQ9D478 Gm16677-201ENSMUST00000181229 2174 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Odf2lQ9D478 Gm27174-201ENSMUST00000184493 2174 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Odf2lQ9D478 Nxpe5-203ENSMUST00000159964 3585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Odf2lQ9D478 Scyl2-204ENSMUST00000174252 4817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Odf2lQ9D478 Ap5s1-201ENSMUST00000089506 1432 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Odf2lQ9D478 Art5-203ENSMUST00000106935 495 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Odf2lQ9D478 Sgcg-202ENSMUST00000121148 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Odf2lQ9D478 Gm12570-201ENSMUST00000122047 1030 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Odf2lQ9D478 Mir1901-201ENSMUST00000122616 78 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Odf2lQ9D478 Snhg17-205ENSMUST00000151331 529 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Odf2lQ9D478 Gm22442-201ENSMUST00000157256 144 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Odf2lQ9D478 Gm16553-201ENSMUST00000160490 716 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Odf2lQ9D478 Gm8705-201ENSMUST00000180823 812 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Odf2lQ9D478 Gm9081-201ENSMUST00000182346 991 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
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Odf2lQ9D478 Gm40414-201ENSMUST00000197608 481 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Odf2lQ9D478 Gm43671-201ENSMUST00000200422 433 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms