Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGG7

Ubash3b, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein B, mousemouse

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Length 638 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubash3bQ8BGG7 Gm32296-201ENSMUST00000220590 1057 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ubash3bQ8BGG7 AC125070.1-201ENSMUST00000223523 555 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ubash3bQ8BGG7 CT573047.1-201ENSMUST00000223652 851 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Ubash3bQ8BGG7 Olfr1395-201ENSMUST00000059379 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ubash3bQ8BGG7 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ubash3bQ8BGG7 Ccdc54-201ENSMUST00000062439 1296 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ubash3bQ8BGG7 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ubash3bQ8BGG7 AC174797.1-201ENSMUST00000224339 1649 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Ubash3bQ8BGG7 Uba6-202ENSMUST00000113373 3504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ubash3bQ8BGG7 Gm19972-201ENSMUST00000218180 5664 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Ubash3bQ8BGG7 B230312C02Rik-201ENSMUST00000145549 1703 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ubash3bQ8BGG7 Ano1-202ENSMUST00000118556 4566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ubash3bQ8BGG7 Atf7ip2-201ENSMUST00000044005 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ubash3bQ8BGG7 Rwdd3-204ENSMUST00000106466 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ubash3bQ8BGG7 Gm37651-201ENSMUST00000194679 1494 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Ubash3bQ8BGG7 Mybph-201ENSMUST00000038445 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ubash3bQ8BGG7 Mybpc3-201ENSMUST00000111430 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ubash3bQ8BGG7 Fdft1-201ENSMUST00000054963 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ubash3bQ8BGG7 Il17ra-201ENSMUST00000002976 7752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ubash3bQ8BGG7 Katnal2-205ENSMUST00000126153 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ubash3bQ8BGG7 Emp1-201ENSMUST00000032330 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ubash3bQ8BGG7 Gm43274-201ENSMUST00000202545 5000 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Ubash3bQ8BGG7 Clrn1-203ENSMUST00000072551 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ubash3bQ8BGG7 Abcf1-201ENSMUST00000043757 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ubash3bQ8BGG7 Gm9333-201ENSMUST00000205452 1323 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Ubash3bQ8BGG7 Stk17b-201ENSMUST00000027263 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ubash3bQ8BGG7 Spty2d1-201ENSMUST00000061639 5223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ubash3bQ8BGG7 Acot11-202ENSMUST00000102762 5689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ubash3bQ8BGG7 Prpf6-203ENSMUST00000136481 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ubash3bQ8BGG7 Tmem88b-201ENSMUST00000097742 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ubash3bQ8BGG7 Ank1-205ENSMUST00000117296 6794 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ubash3bQ8BGG7 Fam227a-202ENSMUST00000109646 1896 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ubash3bQ8BGG7 Gm43482-201ENSMUST00000202797 1861 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Ubash3bQ8BGG7 Bicd1-203ENSMUST00000111513 4049 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ubash3bQ8BGG7 Amz1-202ENSMUST00000120630 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ubash3bQ8BGG7 Sirpa-204ENSMUST00000103203 3674 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ubash3bQ8BGG7 Agpat3-204ENSMUST00000105389 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ubash3bQ8BGG7 Bco1-203ENSMUST00000176860 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ubash3bQ8BGG7 Anxa7-201ENSMUST00000065504 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ubash3bQ8BGG7 Lss-201ENSMUST00000048678 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ubash3bQ8BGG7 Cacna1c-210ENSMUST00000187474 6911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ubash3bQ8BGG7 Rbm27-201ENSMUST00000046972 6134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ubash3bQ8BGG7 C130060K24Rik-203ENSMUST00000170608 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ubash3bQ8BGG7 Ift88-201ENSMUST00000122063 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ubash3bQ8BGG7 Bbs2-201ENSMUST00000034206 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ubash3bQ8BGG7 Gm28693-201ENSMUST00000189622 2638 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Ubash3bQ8BGG7 5730405O15Rik-201ENSMUST00000127521 1749 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ubash3bQ8BGG7 Gm14659-201ENSMUST00000117667 843 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Ubash3bQ8BGG7 Gm15615-201ENSMUST00000118876 198 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Ubash3bQ8BGG7 Gm8302-201ENSMUST00000119217 852 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Ubash3bQ8BGG7 Gm16219-201ENSMUST00000120096 274 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Ubash3bQ8BGG7 Gm15412-201ENSMUST00000137193 1096 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ubash3bQ8BGG7 Gm37604-201ENSMUST00000191749 1272 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Ubash3bQ8BGG7 Gm38217-201ENSMUST00000194358 910 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Ubash3bQ8BGG7 AC153912.1-201ENSMUST00000217011 724 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
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Ubash3bQ8BGG7 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ubash3bQ8BGG7 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ubash3bQ8BGG7 Olfr584-201ENSMUST00000098210 964 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Ubash3bQ8BGG7 Olfr1163-201ENSMUST00000099835 1043 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ubash3bQ8BGG7 Pex19-202ENSMUST00000111252 2844 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ubash3bQ8BGG7 Clock-201ENSMUST00000075159 7478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ubash3bQ8BGG7 Epb41-202ENSMUST00000054917 4948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
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Ubash3bQ8BGG7 AL645745.1-201ENSMUST00000222202 5348 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ubash3bQ8BGG7 Prkcd-201ENSMUST00000022521 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ubash3bQ8BGG7 Olfr1121-202ENSMUST00000213792 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ubash3bQ8BGG7 Colq-201ENSMUST00000112027 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ubash3bQ8BGG7 Pex26-203ENSMUST00000120066 3861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.75
Ubash3bQ8BGG7 Zeb2os-201ENSMUST00000127150 1305 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ubash3bQ8BGG7 Art3-202ENSMUST00000117108 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ubash3bQ8BGG7 Art3-203ENSMUST00000118106 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ubash3bQ8BGG7 Rbpsuh-rs3-201ENSMUST00000182751 1441 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Ubash3bQ8BGG7 Zfp354b-201ENSMUST00000109124 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ubash3bQ8BGG7 Irf9-202ENSMUST00000130697 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ubash3bQ8BGG7 Dnajb6-203ENSMUST00000114839 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ubash3bQ8BGG7 Dpt-201ENSMUST00000027861 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ubash3bQ8BGG7 Dpep2-201ENSMUST00000034373 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ubash3bQ8BGG7 Ubr1-201ENSMUST00000028728 7768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ubash3bQ8BGG7 Vgll4-201ENSMUST00000032459 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ubash3bQ8BGG7 Zfp280d-211ENSMUST00000184036 3459 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ubash3bQ8BGG7 Vmn1r184-207ENSMUST00000228369 6361 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ubash3bQ8BGG7 Abhd4-201ENSMUST00000041197 2401 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ubash3bQ8BGG7 Txndc16-203ENSMUST00000123879 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ubash3bQ8BGG7 Nod1-202ENSMUST00000168172 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ubash3bQ8BGG7 Sept9-203ENSMUST00000100193 2924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ubash3bQ8BGG7 2410004P03Rik-201ENSMUST00000095823 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ubash3bQ8BGG7 Gm10417-201ENSMUST00000194341 3522 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Ubash3bQ8BGG7 Thbd-201ENSMUST00000099270 3723 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ubash3bQ8BGG7 Trav13-1-201ENSMUST00000103651 331 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ubash3bQ8BGG7 Gm24541-201ENSMUST00000103871 96 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Ubash3bQ8BGG7 Gm22711-201ENSMUST00000116890 133 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Ubash3bQ8BGG7 Gm25509-201ENSMUST00000116985 106 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Ubash3bQ8BGG7 Wsb2-ps-201ENSMUST00000117937 1217 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Ubash3bQ8BGG7 4631405J19Rik-204ENSMUST00000145926 936 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ubash3bQ8BGG7 Gm16312-201ENSMUST00000156285 362 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ubash3bQ8BGG7 Phf11b-201ENSMUST00000166121 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ubash3bQ8BGG7 Ppy-201ENSMUST00000017460 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ubash3bQ8BGG7 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms