Protein–RNA interactions for Protein: Q6XAS3

Ssx9, MCG116991, isoform CRA_b, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssx9Q6XAS3 Hottip-201ENSMUST00000141300 2346 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ssx9Q6XAS3 Ticam2-201ENSMUST00000070084 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ssx9Q6XAS3 Pcdhga1-201ENSMUST00000194190 4692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ssx9Q6XAS3 Gm5122-202ENSMUST00000216854 1637 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ssx9Q6XAS3 Ppp1r16b-203ENSMUST00000103116 6370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ssx9Q6XAS3 Rpl23-201ENSMUST00000103146 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ssx9Q6XAS3 Scp2-202ENSMUST00000106701 772 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ssx9Q6XAS3 Skap1-206ENSMUST00000107663 742 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ssx9Q6XAS3 Cspp1-204ENSMUST00000119714 1268 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ssx9Q6XAS3 Gm11952-201ENSMUST00000121172 821 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Ssx9Q6XAS3 Mir1893-201ENSMUST00000122565 83 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Ssx9Q6XAS3 Rdh9-203ENSMUST00000136223 1276 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ssx9Q6XAS3 2310057J18Rik-204ENSMUST00000152363 1043 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ssx9Q6XAS3 Gm20441-201ENSMUST00000173512 756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ssx9Q6XAS3 Pcgf1-207ENSMUST00000177177 854 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ssx9Q6XAS3 Gm6408-201ENSMUST00000179032 1171 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ssx9Q6XAS3 Gm4895-201ENSMUST00000181646 1137 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Ssx9Q6XAS3 Gm27910-201ENSMUST00000185004 107 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Ssx9Q6XAS3 Gm34821-201ENSMUST00000208399 1031 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ssx9Q6XAS3 AC153891.1-201ENSMUST00000213761 742 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ssx9Q6XAS3 AC164618.2-201ENSMUST00000224770 573 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Ssx9Q6XAS3 CT025679.1-201ENSMUST00000227106 449 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Ssx9Q6XAS3 E330021D16Rik-201ENSMUST00000058713 1116 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ssx9Q6XAS3 Pmp22-201ENSMUST00000018361 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ssx9Q6XAS3 Tnfaip8l3-201ENSMUST00000098760 4403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ssx9Q6XAS3 Vcan-202ENSMUST00000109544 5702 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ssx9Q6XAS3 Madd-213ENSMUST00000111376 5927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ssx9Q6XAS3 Madd-206ENSMUST00000099725 5905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ssx9Q6XAS3 Orc4-201ENSMUST00000028098 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ssx9Q6XAS3 Zfp330-201ENSMUST00000034147 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ssx9Q6XAS3 Mypn-201ENSMUST00000095580 5246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ssx9Q6XAS3 Adamts9-201ENSMUST00000113438 8016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ssx9Q6XAS3 Scamp1-203ENSMUST00000152555 1877 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ssx9Q6XAS3 Trim36-202ENSMUST00000167364 4543 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ssx9Q6XAS3 Slc39a14-210ENSMUST00000152067 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ssx9Q6XAS3 Pax5-205ENSMUST00000107827 1315 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ssx9Q6XAS3 Pigm-201ENSMUST00000052455 7554 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ssx9Q6XAS3 Cutal-203ENSMUST00000113068 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ssx9Q6XAS3 Aldh1a3-201ENSMUST00000015278 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ssx9Q6XAS3 Morf4l2-213ENSMUST00000166478 1720 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ssx9Q6XAS3 Ap1m2-201ENSMUST00000003397 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ssx9Q6XAS3 Chd7-206ENSMUST00000170391 3462 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ssx9Q6XAS3 Gm15651-201ENSMUST00000159953 2507 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ssx9Q6XAS3 Atp11c-202ENSMUST00000101527 6044 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ssx9Q6XAS3 Nmt1-201ENSMUST00000021314 4861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ssx9Q6XAS3 Prpf40b-202ENSMUST00000118287 3129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ssx9Q6XAS3 Atp6v0a4-202ENSMUST00000114908 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ssx9Q6XAS3 Zfp217-202ENSMUST00000109155 5670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ssx9Q6XAS3 Samd4-206ENSMUST00000137543 6874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Ssx9Q6XAS3 Cln8-201ENSMUST00000027554 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Ssx9Q6XAS3 Gm45699-201ENSMUST00000212838 1576 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Ssx9Q6XAS3 Slc7a4-201ENSMUST00000063544 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Ssx9Q6XAS3 Palm2-201ENSMUST00000102904 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Ssx9Q6XAS3 Clcn6-205ENSMUST00000137724 5198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Ssx9Q6XAS3 Arsb-201ENSMUST00000091403 4038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Ssx9Q6XAS3 B630019A10Rik-201ENSMUST00000149488 2407 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Ssx9Q6XAS3 AC164092.1-201ENSMUST00000215635 2232 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Ssx9Q6XAS3 Sirpa-204ENSMUST00000103203 3674 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Ssx9Q6XAS3 Spata31d1a-203ENSMUST00000224982 5325 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Ssx9Q6XAS3 Pigh-203ENSMUST00000217998 2868 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ssx9Q6XAS3 Hrh1-201ENSMUST00000088987 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ssx9Q6XAS3 Rnf121-203ENSMUST00000106953 2545 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ssx9Q6XAS3 0610010K14Rik-206ENSMUST00000108576 576 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ssx9Q6XAS3 Il1rn-202ENSMUST00000114485 728 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ssx9Q6XAS3 Akr1b10-202ENSMUST00000115051 1022 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ssx9Q6XAS3 4930589P08Rik-201ENSMUST00000129097 1084 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ssx9Q6XAS3 Smim6-201ENSMUST00000132961 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ssx9Q6XAS3 Rps19-ps10-201ENSMUST00000159750 435 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Ssx9Q6XAS3 Gm17115-201ENSMUST00000164075 885 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ssx9Q6XAS3 Mir6979-201ENSMUST00000183927 56 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Ssx9Q6XAS3 Scgb2b27-203ENSMUST00000185399 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ssx9Q6XAS3 Gm6677-201ENSMUST00000195100 441 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Ssx9Q6XAS3 Gm9369-201ENSMUST00000196009 733 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Ssx9Q6XAS3 Gm7047-201ENSMUST00000196224 1063 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Ssx9Q6XAS3 Gm43520-201ENSMUST00000197996 164 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Ssx9Q6XAS3 Gm18561-201ENSMUST00000206027 804 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Ssx9Q6XAS3 Gm18974-201ENSMUST00000221478 1031 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Ssx9Q6XAS3 Psmb7-201ENSMUST00000028083 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ssx9Q6XAS3 Emp3-201ENSMUST00000038876 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ssx9Q6XAS3 Mill2-201ENSMUST00000072386 1121 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ssx9Q6XAS3 Rsg1-201ENSMUST00000097813 985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ssx9Q6XAS3 Car12-202ENSMUST00000085420 3639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ssx9Q6XAS3 Gemin8-202ENSMUST00000087169 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ssx9Q6XAS3 AC140462.2-201ENSMUST00000225718 2433 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Ssx9Q6XAS3 Mageb4-201ENSMUST00000096378 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ssx9Q6XAS3 1600014C10Rik-202ENSMUST00000165308 3335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ssx9Q6XAS3 1600014C10Rik-204ENSMUST00000178207 3341 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ssx9Q6XAS3 Tia1-206ENSMUST00000113713 3108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ssx9Q6XAS3 Abl2-202ENSMUST00000166172 10151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ssx9Q6XAS3 Vrtn-203ENSMUST00000167227 3440 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ssx9Q6XAS3 Nfkbiz-201ENSMUST00000036273 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ssx9Q6XAS3 Rxra-206ENSMUST00000166775 3216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ssx9Q6XAS3 Gpr179-201ENSMUST00000093942 9219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ssx9Q6XAS3 Gm45124-201ENSMUST00000206723 2755 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Ssx9Q6XAS3 Rnf6-206ENSMUST00000161859 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ssx9Q6XAS3 Alas1-202ENSMUST00000112524 3089 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ssx9Q6XAS3 Phtf1os-201ENSMUST00000160110 4046 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Ssx9Q6XAS3 Slc6a12-209ENSMUST00000171008 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ssx9Q6XAS3 Cd2bp2-203ENSMUST00000205316 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ssx9Q6XAS3 Ngfr-201ENSMUST00000000122 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
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