Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 Ddx55-201ENSMUST00000071057 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
NipblQ6KCD5 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
NipblQ6KCD5 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.3□□□□□ -1.08
NipblQ6KCD5 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
NipblQ6KCD5 Axin2-202ENSMUST00000106711 2551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.29□□□□□ -1.08
NipblQ6KCD5 Cfi-201ENSMUST00000077918 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
NipblQ6KCD5 Smok2b-201ENSMUST00000059824 1584 ntAPPRIS P1 BASIC8.29□□□□□ -1.08
NipblQ6KCD5 Gpat3-202ENSMUST00000092990 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
NipblQ6KCD5 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC8.29□□□□□ -1.08
NipblQ6KCD5 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
NipblQ6KCD5 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.29□□□□□ -1.08
NipblQ6KCD5 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC8.29□□□□□ -1.08
NipblQ6KCD5 Gm13777-201ENSMUST00000118208 345 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
NipblQ6KCD5 Gm14997-201ENSMUST00000119232 636 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
NipblQ6KCD5 Ywhaq-ps3-201ENSMUST00000120944 738 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
NipblQ6KCD5 Gm6238-201ENSMUST00000120999 465 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
NipblQ6KCD5 Fthl17-ps2-201ENSMUST00000122268 528 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
NipblQ6KCD5 Pax5-212ENSMUST00000173733 885 ntTSL 5 BASIC8.29□□□□□ -1.08
NipblQ6KCD5 Gm6794-201ENSMUST00000203829 457 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
NipblQ6KCD5 Gm32591-203ENSMUST00000204725 696 ntTSL 3 BASIC8.29□□□□□ -1.08
NipblQ6KCD5 AC116680.1-201ENSMUST00000222804 613 ntTSL 3 BASIC8.29□□□□□ -1.08
NipblQ6KCD5 Gm22341-201ENSMUST00000083775 129 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
NipblQ6KCD5 Gm4419-201ENSMUST00000180671 1729 ntTSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
NipblQ6KCD5 Syt14-201ENSMUST00000016344 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
NipblQ6KCD5 Lin54-209ENSMUST00000152387 2760 ntTSL 5 BASIC8.29□□□□□ -1.08
NipblQ6KCD5 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
NipblQ6KCD5 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
NipblQ6KCD5 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
NipblQ6KCD5 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.29□□□□□ -1.08
NipblQ6KCD5 Klk1b26-201ENSMUST00000048945 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
NipblQ6KCD5 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
NipblQ6KCD5 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
NipblQ6KCD5 Igsf11-202ENSMUST00000114706 1578 ntTSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
NipblQ6KCD5 Stx17-203ENSMUST00000107721 1771 ntTSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
NipblQ6KCD5 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
NipblQ6KCD5 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
NipblQ6KCD5 4933413J09Rik-202ENSMUST00000059648 3387 ntTSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
NipblQ6KCD5 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
NipblQ6KCD5 Prdm5-204ENSMUST00000172638 1714 ntTSL 5 BASIC8.29□□□□□ -1.08
NipblQ6KCD5 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
NipblQ6KCD5 Ikbkg-204ENSMUST00000114128 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.29□□□□□ -1.08
NipblQ6KCD5 Slc10a1-201ENSMUST00000095572 1674 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
NipblQ6KCD5 Ints10-201ENSMUST00000034328 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
NipblQ6KCD5 Plac9b-201ENSMUST00000100809 388 ntTSL 2 BASIC8.29□□□□□ -1.08
NipblQ6KCD5 Gm14592-201ENSMUST00000117201 560 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
NipblQ6KCD5 Gm5764-201ENSMUST00000118817 885 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
NipblQ6KCD5 Gm25288-201ENSMUST00000122800 265 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
NipblQ6KCD5 Gm11465-201ENSMUST00000127942 435 ntTSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
NipblQ6KCD5 Gm9458-201ENSMUST00000135273 727 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
NipblQ6KCD5 Baat-202ENSMUST00000166036 1263 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.29□□□□□ -1.08
NipblQ6KCD5 Gm9639-201ENSMUST00000172205 678 ntAPPRIS P1 BASIC8.29□□□□□ -1.08
NipblQ6KCD5 Ighv6-4-201ENSMUST00000177949 297 ntAPPRIS P1 BASIC8.29□□□□□ -1.08
NipblQ6KCD5 Gal3st2b-201ENSMUST00000177958 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
NipblQ6KCD5 Tcstv1-202ENSMUST00000190512 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
NipblQ6KCD5 9530062K07Rik-201ENSMUST00000203332 787 ntTSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
NipblQ6KCD5 AC140314.1-201ENSMUST00000219549 554 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
NipblQ6KCD5 AC160109.1-201ENSMUST00000225592 729 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
NipblQ6KCD5 Fam209-201ENSMUST00000029007 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
NipblQ6KCD5 Klk1b22-201ENSMUST00000077528 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
NipblQ6KCD5 Tfap2b-204ENSMUST00000187754 3023 ntTSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
NipblQ6KCD5 Jak3-202ENSMUST00000110012 3774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.29□□□□□ -1.08
NipblQ6KCD5 Snx29-201ENSMUST00000096273 1622 ntTSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
NipblQ6KCD5 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
NipblQ6KCD5 Nfe2l1-203ENSMUST00000107658 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
NipblQ6KCD5 Nop16-201ENSMUST00000026987 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
NipblQ6KCD5 Kdelc1-201ENSMUST00000027213 1765 ntTSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
NipblQ6KCD5 Aldh3a2-201ENSMUST00000066277 2892 ntTSL 2 BASIC8.29□□□□□ -1.08
NipblQ6KCD5 Eef1b2-204ENSMUST00000129339 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
NipblQ6KCD5 Gm43375-201ENSMUST00000196705 2480 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
NipblQ6KCD5 Hibch-202ENSMUST00000159352 1704 ntTSL 5 BASIC8.29□□□□□ -1.08
NipblQ6KCD5 Rbm8a-201ENSMUST00000048915 2608 ntTSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
NipblQ6KCD5 Celf1-204ENSMUST00000111448 4432 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.29□□□□□ -1.08
NipblQ6KCD5 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
NipblQ6KCD5 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
NipblQ6KCD5 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
NipblQ6KCD5 Brat1-201ENSMUST00000041588 3333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
NipblQ6KCD5 Milr1-202ENSMUST00000106794 1514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
NipblQ6KCD5 Bet1-201ENSMUST00000049166 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
NipblQ6KCD5 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
NipblQ6KCD5 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
NipblQ6KCD5 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.28□□□□□ -1.08
NipblQ6KCD5 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
NipblQ6KCD5 Exosc9-201ENSMUST00000029269 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
NipblQ6KCD5 Psmb3-201ENSMUST00000103147 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
NipblQ6KCD5 Katnal2-203ENSMUST00000123650 638 ntTSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
NipblQ6KCD5 Gm12679-201ENSMUST00000123899 636 ntTSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
NipblQ6KCD5 Gm6665-201ENSMUST00000165131 258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.28□□□□□ -1.08
NipblQ6KCD5 Gast-201ENSMUST00000017309 460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
NipblQ6KCD5 Gm9117-201ENSMUST00000177735 1098 ntAPPRIS P1 BASIC8.28□□□□□ -1.08
NipblQ6KCD5 Gm28065-201ENSMUST00000185290 833 ntTSL 3 BASIC8.28□□□□□ -1.08
NipblQ6KCD5 1700095A13Rik-201ENSMUST00000185460 711 ntTSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
NipblQ6KCD5 Gm42915-201ENSMUST00000197478 323 ntBASIC8.28□□□□□ -1.08
NipblQ6KCD5 Rarres2-203ENSMUST00000204182 672 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.28□□□□□ -1.08
NipblQ6KCD5 AC133517.1-201ENSMUST00000225825 594 ntBASIC8.28□□□□□ -1.08
NipblQ6KCD5 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
NipblQ6KCD5 Olfr649-201ENSMUST00000060440 939 ntAPPRIS P1 BASIC8.28□□□□□ -1.08
NipblQ6KCD5 Olfr1512-201ENSMUST00000071221 942 ntAPPRIS P1 BASIC8.28□□□□□ -1.08
NipblQ6KCD5 Foxp1-201ENSMUST00000074346 2118 ntTSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
NipblQ6KCD5 Gm18806-201ENSMUST00000207607 1775 ntBASIC8.28□□□□□ -1.08
NipblQ6KCD5 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.8 ms