Protein–RNA interactions for Protein: Q5XPI3

Rnf123, E3 ubiquitin-protein ligase RNF123, mousemouse

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Length 1,314 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf123Q5XPI3 Hyal1-203ENSMUST00000123005 843 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rnf123Q5XPI3 Tnfrsf14-201ENSMUST00000123514 1018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rnf123Q5XPI3 Pet100-201ENSMUST00000156380 1193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rnf123Q5XPI3 Hcrtr1-204ENSMUST00000164887 1251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rnf123Q5XPI3 1700109G14Rik-202ENSMUST00000188538 754 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rnf123Q5XPI3 Gm29040-201ENSMUST00000189899 1188 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rnf123Q5XPI3 Gm7880-201ENSMUST00000203748 871 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Rnf123Q5XPI3 Gm18561-201ENSMUST00000206027 804 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Rnf123Q5XPI3 Gm18204-201ENSMUST00000209835 793 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Rnf123Q5XPI3 Gm8170-201ENSMUST00000218581 945 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Rnf123Q5XPI3 Chmp3-202ENSMUST00000065364 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rnf123Q5XPI3 Naca-201ENSMUST00000073868 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Rnf123Q5XPI3 Acyp1-201ENSMUST00000008966 648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rnf123Q5XPI3 Gm38025-201ENSMUST00000193926 2308 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rnf123Q5XPI3 Gpr39-201ENSMUST00000027581 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rnf123Q5XPI3 Cd6-203ENSMUST00000080292 3032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rnf123Q5XPI3 Pcdh20-202ENSMUST00000192557 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rnf123Q5XPI3 Il18bp-202ENSMUST00000209368 2596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Rnf123Q5XPI3 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rnf123Q5XPI3 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rnf123Q5XPI3 Gm15567-201ENSMUST00000148699 2130 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rnf123Q5XPI3 Gm12530-201ENSMUST00000152074 1759 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rnf123Q5XPI3 Morf4l2-215ENSMUST00000169418 1782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rnf123Q5XPI3 Atp6v0e2-201ENSMUST00000040361 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rnf123Q5XPI3 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rnf123Q5XPI3 Stk4-201ENSMUST00000018353 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Rnf123Q5XPI3 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rnf123Q5XPI3 Baat-201ENSMUST00000043056 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rnf123Q5XPI3 Clec4a3-201ENSMUST00000088468 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rnf123Q5XPI3 Gsdma3-202ENSMUST00000107508 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rnf123Q5XPI3 Col19a1-202ENSMUST00000115244 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rnf123Q5XPI3 A530032D15Rik-201ENSMUST00000160792 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rnf123Q5XPI3 Nfic-201ENSMUST00000020461 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rnf123Q5XPI3 Cap2-202ENSMUST00000119341 2454 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rnf123Q5XPI3 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rnf123Q5XPI3 Prpf40b-202ENSMUST00000118287 3129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rnf123Q5XPI3 Igsf3-202ENSMUST00000195164 3876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rnf123Q5XPI3 Bzw2-201ENSMUST00000020856 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rnf123Q5XPI3 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rnf123Q5XPI3 Actn2-201ENSMUST00000064204 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Rnf123Q5XPI3 Cryz-201ENSMUST00000029850 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rnf123Q5XPI3 Gad1-ps-201ENSMUST00000167243 1776 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
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Rnf123Q5XPI3 Gm3289-201ENSMUST00000200819 756 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Rnf123Q5XPI3 Lsm8-201ENSMUST00000056398 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Rnf123Q5XPI3 Hspa2-201ENSMUST00000080449 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Rnf123Q5XPI3 Exoc7-202ENSMUST00000106411 3205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rnf123Q5XPI3 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rnf123Q5XPI3 Mkrn1-204ENSMUST00000114823 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rnf123Q5XPI3 Bmp4-202ENSMUST00000100676 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Rnf123Q5XPI3 Pced1b-204ENSMUST00000228521 1790 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Rnf123Q5XPI3 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rnf123Q5XPI3 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rnf123Q5XPI3 4930488L21Rik-202ENSMUST00000212638 3164 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Rnf123Q5XPI3 Cx3cl1-201ENSMUST00000034230 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rnf123Q5XPI3 Ccdc78-201ENSMUST00000095500 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rnf123Q5XPI3 Tldc1-201ENSMUST00000049156 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rnf123Q5XPI3 March10-201ENSMUST00000049995 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rnf123Q5XPI3 Tdrd3-202ENSMUST00000168275 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rnf123Q5XPI3 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rnf123Q5XPI3 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rnf123Q5XPI3 Nppa-201ENSMUST00000103230 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rnf123Q5XPI3 Derl2-202ENSMUST00000108523 884 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rnf123Q5XPI3 Gm21987-201ENSMUST00000119704 456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rnf123Q5XPI3 Gzmn-201ENSMUST00000015587 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rnf123Q5XPI3 Gm21964-201ENSMUST00000178785 936 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rnf123Q5XPI3 Dydc1-203ENSMUST00000189865 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rnf123Q5XPI3 Gm8918-201ENSMUST00000190587 1087 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Rnf123Q5XPI3 Gm42780-201ENSMUST00000197083 734 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Rnf123Q5XPI3 Gm43380-201ENSMUST00000200421 220 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms