Protein–RNA interactions for Protein: Q4QQM4

Trp53i11, Tumor protein p53-inducible protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trp53i11Q4QQM4 Filip1l-202ENSMUST00000159414 3253 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Trp53i11Q4QQM4 Dnmt3aos-201ENSMUST00000144896 1385 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Trp53i11Q4QQM4 Ift88-201ENSMUST00000122063 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Trp53i11Q4QQM4 Gm5944-201ENSMUST00000118182 1001 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Trp53i11Q4QQM4 Anxa8-202ENSMUST00000120077 1208 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Trp53i11Q4QQM4 4930538E20Rik-202ENSMUST00000146717 497 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Trp53i11Q4QQM4 Gm20536-201ENSMUST00000172588 406 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Trp53i11Q4QQM4 Gm23153-201ENSMUST00000175323 313 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Trp53i11Q4QQM4 Gm20714-202ENSMUST00000176436 748 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Trp53i11Q4QQM4 Gm21844-201ENSMUST00000178699 663 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Trp53i11Q4QQM4 Gm26555-201ENSMUST00000180452 1037 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Trp53i11Q4QQM4 Gm2449-201ENSMUST00000180676 585 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Trp53i11Q4QQM4 Gm5210-201ENSMUST00000182150 1010 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Trp53i11Q4QQM4 Gm28215-201ENSMUST00000186146 346 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Trp53i11Q4QQM4 Gm28746-201ENSMUST00000187453 380 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Trp53i11Q4QQM4 Gm7880-201ENSMUST00000203748 871 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Trp53i11Q4QQM4 Gm7082-201ENSMUST00000209880 969 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Trp53i11Q4QQM4 Gm2594-201ENSMUST00000214774 742 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Trp53i11Q4QQM4 Crygd-201ENSMUST00000045028 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Trp53i11Q4QQM4 Snu13-202ENSMUST00000080622 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Trp53i11Q4QQM4 Acyp1-201ENSMUST00000008966 648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Trp53i11Q4QQM4 Exoc3l4-201ENSMUST00000072646 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Trp53i11Q4QQM4 Gm43522-201ENSMUST00000196697 1922 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Trp53i11Q4QQM4 Dpt-201ENSMUST00000027861 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Trp53i11Q4QQM4 Cops3-201ENSMUST00000019517 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Trp53i11Q4QQM4 Coq8a-201ENSMUST00000027766 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Trp53i11Q4QQM4 Slx4ip-206ENSMUST00000180277 2723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Trp53i11Q4QQM4 Tnpo3-201ENSMUST00000012679 4251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Trp53i11Q4QQM4 Prg4-201ENSMUST00000006171 1869 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Trp53i11Q4QQM4 Sln-201ENSMUST00000048485 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Trp53i11Q4QQM4 Nek4-201ENSMUST00000050171 2793 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Trp53i11Q4QQM4 Ahrr-201ENSMUST00000022059 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Trp53i11Q4QQM4 Dnmt1-202ENSMUST00000177754 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Trp53i11Q4QQM4 Gm17745-201ENSMUST00000212186 1692 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Trp53i11Q4QQM4 Fastkd5-201ENSMUST00000110262 3015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Trp53i11Q4QQM4 4933409D19Rik-201ENSMUST00000193674 1557 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Trp53i11Q4QQM4 Ccndbp1-202ENSMUST00000099488 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Trp53i11Q4QQM4 Stx1b-201ENSMUST00000106267 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Trp53i11Q4QQM4 Gm5833-202ENSMUST00000190707 1932 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Trp53i11Q4QQM4 Jam3-201ENSMUST00000034472 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Trp53i11Q4QQM4 Cpvl-202ENSMUST00000203101 1488 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Trp53i11Q4QQM4 Hyal2-206ENSMUST00000195681 2968 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Trp53i11Q4QQM4 Pigc-201ENSMUST00000028021 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Trp53i11Q4QQM4 Rtbdn-202ENSMUST00000109740 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Trp53i11Q4QQM4 Oprm1-222ENSMUST00000135502 1363 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Trp53i11Q4QQM4 Nipbl-201ENSMUST00000052965 8815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Trp53i11Q4QQM4 Arsb-201ENSMUST00000091403 4038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Trp53i11Q4QQM4 Gm10686-201ENSMUST00000215389 3247 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Trp53i11Q4QQM4 Mgat5-201ENSMUST00000038361 8436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Trp53i11Q4QQM4 Nedd9-202ENSMUST00000163623 4626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Trp53i11Q4QQM4 Rps9-204ENSMUST00000108625 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Trp53i11Q4QQM4 Sgcg-202ENSMUST00000121148 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Trp53i11Q4QQM4 Gm12570-201ENSMUST00000122047 1030 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Trp53i11Q4QQM4 Cryzl1-204ENSMUST00000122254 845 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Trp53i11Q4QQM4 Pet100-201ENSMUST00000156380 1193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Trp53i11Q4QQM4 Pfdn6-202ENSMUST00000173363 871 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Trp53i11Q4QQM4 Gm37852-201ENSMUST00000193027 350 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Trp53i11Q4QQM4 Gm37301-201ENSMUST00000195412 568 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Trp53i11Q4QQM4 Gm40414-201ENSMUST00000197608 481 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Trp53i11Q4QQM4 4930447C11Rik-201ENSMUST00000204503 928 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Trp53i11Q4QQM4 Gm33080-201ENSMUST00000205429 172 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Trp53i11Q4QQM4 Pet100-203ENSMUST00000207389 363 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Trp53i11Q4QQM4 Gm7600-201ENSMUST00000209657 785 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Trp53i11Q4QQM4 Olfr567-ps1-201ENSMUST00000210349 857 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Trp53i11Q4QQM4 AC165249.1-202ENSMUST00000217990 734 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Trp53i11Q4QQM4 Gm7525-201ENSMUST00000219425 454 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Trp53i11Q4QQM4 Mrpl30-201ENSMUST00000027256 969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Trp53i11Q4QQM4 E330021D16Rik-201ENSMUST00000058713 1116 ntAPPRIS P1 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Trp53i11Q4QQM4 Gm9962-201ENSMUST00000085241 321 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Trp53i11Q4QQM4 Wfdc6a-201ENSMUST00000099096 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Trp53i11Q4QQM4 Ctxn2-201ENSMUST00000099452 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Trp53i11Q4QQM4 Bmp4-202ENSMUST00000100676 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Trp53i11Q4QQM4 Thsd4-201ENSMUST00000034829 4816 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Trp53i11Q4QQM4 Synj2-203ENSMUST00000115784 2634 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Trp53i11Q4QQM4 Gpc6-202ENSMUST00000088483 3488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Trp53i11Q4QQM4 Chac2-202ENSMUST00000101394 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Trp53i11Q4QQM4 Fam222b-203ENSMUST00000155571 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Trp53i11Q4QQM4 H2-T24-201ENSMUST00000113760 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Trp53i11Q4QQM4 Nfkbiz-201ENSMUST00000036273 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Trp53i11Q4QQM4 Ppp1r26-205ENSMUST00000189694 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Trp53i11Q4QQM4 Ppp1r26-201ENSMUST00000040324 5466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Trp53i11Q4QQM4 9530082P21Rik-203ENSMUST00000181605 3162 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Trp53i11Q4QQM4 Mamdc2-201ENSMUST00000036069 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Trp53i11Q4QQM4 C920021L13Rik-201ENSMUST00000120398 1723 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Trp53i11Q4QQM4 Ccdc93-201ENSMUST00000036025 7274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Trp53i11Q4QQM4 Morc2a-201ENSMUST00000093389 5085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Trp53i11Q4QQM4 Nckap5-212ENSMUST00000162877 2630 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Trp53i11Q4QQM4 Gm38271-201ENSMUST00000192296 1603 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Trp53i11Q4QQM4 AC125409.1-201ENSMUST00000223213 3370 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Trp53i11Q4QQM4 St5-201ENSMUST00000077909 4612 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Trp53i11Q4QQM4 Btnl1-201ENSMUST00000080254 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Trp53i11Q4QQM4 Vwa5b2-207ENSMUST00000159780 4042 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Trp53i11Q4QQM4 Ccdc189-201ENSMUST00000072155 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Trp53i11Q4QQM4 Nr1h4-203ENSMUST00000105297 2013 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Trp53i11Q4QQM4 Thbs4-201ENSMUST00000022213 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Trp53i11Q4QQM4 Pfn1-202ENSMUST00000108549 608 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Trp53i11Q4QQM4 Pmp22-202ENSMUST00000108700 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Trp53i11Q4QQM4 Snx29-202ENSMUST00000115814 1125 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Trp53i11Q4QQM4 Gm11422-201ENSMUST00000118925 1103 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Trp53i11Q4QQM4 Vps25-205ENSMUST00000121331 790 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.1 ms