Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJD6

Usp19, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 19, mousemouse

Predictions only

Length 1,360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp19Q3UJD6 Nek3-204ENSMUST00000178324 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Usp19Q3UJD6 Gm35021-201ENSMUST00000210105 2329 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Usp19Q3UJD6 Hectd2os-203ENSMUST00000142067 2662 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Usp19Q3UJD6 Gm8271-201ENSMUST00000171053 1469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Usp19Q3UJD6 Mkx-201ENSMUST00000079788 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Usp19Q3UJD6 Pik3cb-201ENSMUST00000035037 6478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Usp19Q3UJD6 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Usp19Q3UJD6 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Usp19Q3UJD6 Gm15264-201ENSMUST00000118050 502 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Usp19Q3UJD6 Gm11957-201ENSMUST00000118304 779 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Usp19Q3UJD6 Nnmt-202ENSMUST00000119426 912 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Usp19Q3UJD6 Gm12950-201ENSMUST00000121683 417 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Usp19Q3UJD6 Gm12745-201ENSMUST00000121767 214 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Usp19Q3UJD6 Tsc22d3-204ENSMUST00000123898 952 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Usp19Q3UJD6 Gm12676-201ENSMUST00000149078 808 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Usp19Q3UJD6 Gng2-203ENSMUST00000159073 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Usp19Q3UJD6 Olfr527-201ENSMUST00000172230 978 ntAPPRIS P1 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Usp19Q3UJD6 Gm25677-201ENSMUST00000174983 72 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Usp19Q3UJD6 Nme6-206ENSMUST00000197627 905 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Usp19Q3UJD6 Gm42710-201ENSMUST00000200608 985 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Usp19Q3UJD6 Gm45542-201ENSMUST00000210456 438 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Usp19Q3UJD6 Gm31557-201ENSMUST00000213825 973 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Usp19Q3UJD6 BC106175-201ENSMUST00000218578 695 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Usp19Q3UJD6 Frmd4b-201ENSMUST00000032146 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Usp19Q3UJD6 Ncmap-203ENSMUST00000105858 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Usp19Q3UJD6 Cryz-201ENSMUST00000029850 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Usp19Q3UJD6 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Usp19Q3UJD6 Mamdc2-201ENSMUST00000036069 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Usp19Q3UJD6 Gm37368-201ENSMUST00000193173 3212 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Usp19Q3UJD6 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Usp19Q3UJD6 Hsd3b1-202ENSMUST00000107016 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Usp19Q3UJD6 Gm12159-201ENSMUST00000143869 1447 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Usp19Q3UJD6 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Usp19Q3UJD6 Olfr582-202ENSMUST00000210119 1787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Usp19Q3UJD6 Hdac7-205ENSMUST00000118294 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Usp19Q3UJD6 Mirg-208ENSMUST00000182499 3187 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Usp19Q3UJD6 Mab21l3-202ENSMUST00000118411 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Usp19Q3UJD6 Pcdhb9-201ENSMUST00000057228 3055 ntAPPRIS P1 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Usp19Q3UJD6 Zswim9-201ENSMUST00000108532 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Usp19Q3UJD6 Itgb2-201ENSMUST00000000299 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Usp19Q3UJD6 Cxcl11-201ENSMUST00000077820 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Usp19Q3UJD6 Gm26658-201ENSMUST00000181067 2500 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Usp19Q3UJD6 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Usp19Q3UJD6 Gm10646-201ENSMUST00000213227 3293 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Usp19Q3UJD6 Zmiz2-205ENSMUST00000109787 4116 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Usp19Q3UJD6 Enpp7-201ENSMUST00000092373 1370 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Usp19Q3UJD6 Cct3-201ENSMUST00000001452 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Usp19Q3UJD6 Shc1-210ENSMUST00000191485 3154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Usp19Q3UJD6 Rps24-210ENSMUST00000225023 1613 ntAPPRIS P4 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Usp19Q3UJD6 Gm5697-201ENSMUST00000122295 2482 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Usp19Q3UJD6 Pa2g4-202ENSMUST00000131728 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Usp19Q3UJD6 Dmrtc1b-201ENSMUST00000101324 1200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Usp19Q3UJD6 Dmrtc1b-202ENSMUST00000113609 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Usp19Q3UJD6 Tprkb-204ENSMUST00000113752 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Usp19Q3UJD6 Impa1-202ENSMUST00000118410 2988 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Usp19Q3UJD6 Fam78b-202ENSMUST00000126198 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Usp19Q3UJD6 Gm11205-201ENSMUST00000137738 431 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Usp19Q3UJD6 Gm7211-201ENSMUST00000172692 1118 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Usp19Q3UJD6 Gm22876-201ENSMUST00000175450 298 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Usp19Q3UJD6 Tbc1d24-211ENSMUST00000201583 893 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Usp19Q3UJD6 Gm26782-203ENSMUST00000227103 751 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Usp19Q3UJD6 Elob-201ENSMUST00000069579 508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Usp19Q3UJD6 Taar7a-201ENSMUST00000078532 1077 ntAPPRIS P1 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Usp19Q3UJD6 Taar7b-201ENSMUST00000092658 1077 ntAPPRIS P1 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Usp19Q3UJD6 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Usp19Q3UJD6 Gm8378-202ENSMUST00000167777 2624 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Usp19Q3UJD6 Btc-201ENSMUST00000121044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Usp19Q3UJD6 Svop-201ENSMUST00000058472 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Usp19Q3UJD6 Dcaf11-206ENSMUST00000128490 2660 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Usp19Q3UJD6 Ctcfl-202ENSMUST00000179693 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Usp19Q3UJD6 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Usp19Q3UJD6 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Usp19Q3UJD6 Fam234a-202ENSMUST00000118487 2629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Usp19Q3UJD6 Myadm-202ENSMUST00000164553 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Usp19Q3UJD6 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Usp19Q3UJD6 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Usp19Q3UJD6 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Usp19Q3UJD6 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Usp19Q3UJD6 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Usp19Q3UJD6 A930003O13Rik-202ENSMUST00000197486 3098 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Usp19Q3UJD6 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Usp19Q3UJD6 Gm44913-201ENSMUST00000208060 2990 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Usp19Q3UJD6 Trim46-203ENSMUST00000107464 3252 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Usp19Q3UJD6 Gm3716-202ENSMUST00000198582 2879 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Usp19Q3UJD6 Olfr370-203ENSMUST00000214156 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Usp19Q3UJD6 Calhm2-201ENSMUST00000035822 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Usp19Q3UJD6 Gm22582-201ENSMUST00000102283 94 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Usp19Q3UJD6 Fas-202ENSMUST00000112472 555 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Usp19Q3UJD6 7330404K18Rik-201ENSMUST00000125558 487 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Usp19Q3UJD6 Gm13783-201ENSMUST00000131634 732 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Usp19Q3UJD6 Zfp961-203ENSMUST00000132848 781 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Usp19Q3UJD6 Gm15506-201ENSMUST00000148776 1133 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Usp19Q3UJD6 Slc1a3-208ENSMUST00000157065 728 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Usp19Q3UJD6 Gm37782-201ENSMUST00000194879 678 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Usp19Q3UJD6 Fgfbp1-203ENSMUST00000199894 1228 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Usp19Q3UJD6 Mustn1-201ENSMUST00000040715 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Usp19Q3UJD6 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Usp19Q3UJD6 Gm26632-201ENSMUST00000181120 1400 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Usp19Q3UJD6 Tldc1-201ENSMUST00000049156 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Usp19Q3UJD6 Gdi1-201ENSMUST00000015435 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.1 ms