Protein–RNA interactions for Protein: Q2QI47

Ush2A, Usherin, mousemouse

Predictions only

Length 5,193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ush2AQ2QI47 Olfr1491-205ENSMUST00000216377 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Ush2AQ2QI47 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Ush2AQ2QI47 Tex48-201ENSMUST00000102861 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Ush2AQ2QI47 Gm22604-201ENSMUST00000157604 311 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Ush2AQ2QI47 Gm6073-201ENSMUST00000198253 466 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Ush2AQ2QI47 AC159293.1-201ENSMUST00000222662 545 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Ush2AQ2QI47 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Ush2AQ2QI47 Ccdc136-202ENSMUST00000115275 3279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Ush2AQ2QI47 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Ush2AQ2QI47 A1cf-201ENSMUST00000075838 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Ush2AQ2QI47 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Ush2AQ2QI47 9530026P05Rik-204ENSMUST00000204449 1740 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Ush2AQ2QI47 Etnppl-202ENSMUST00000163620 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Ush2AQ2QI47 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Ush2AQ2QI47 Gm15958-202ENSMUST00000153479 2087 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Ush2AQ2QI47 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Ush2AQ2QI47 Bcar1-203ENSMUST00000212349 3116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Ush2AQ2QI47 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Ush2AQ2QI47 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Ush2AQ2QI47 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Ush2AQ2QI47 Gm17300-201ENSMUST00000172202 1527 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Ush2AQ2QI47 Rpl22-201ENSMUST00000103191 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Ush2AQ2QI47 Tmem91-202ENSMUST00000108404 485 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Ush2AQ2QI47 4933400F21Rik-201ENSMUST00000186098 1007 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Ush2AQ2QI47 Gm17815-201ENSMUST00000198305 895 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Ush2AQ2QI47 Gm18402-201ENSMUST00000203834 586 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Ush2AQ2QI47 Gm12691-202ENSMUST00000222516 918 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Ush2AQ2QI47 Pinx1-201ENSMUST00000022528 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Ush2AQ2QI47 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Ush2AQ2QI47 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Ush2AQ2QI47 Ppara-201ENSMUST00000057979 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Ush2AQ2QI47 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Ush2AQ2QI47 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Ush2AQ2QI47 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Ush2AQ2QI47 CT009713.3-201ENSMUST00000224987 1565 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Ush2AQ2QI47 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Ush2AQ2QI47 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Ush2AQ2QI47 Gm44886-201ENSMUST00000209009 1304 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Ush2AQ2QI47 Tubd1-203ENSMUST00000108030 1964 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Ush2AQ2QI47 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Ush2AQ2QI47 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Ush2AQ2QI47 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Ush2AQ2QI47 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Ush2AQ2QI47 Rps8-ps2-201ENSMUST00000118709 624 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Ush2AQ2QI47 Gm14438-201ENSMUST00000121572 624 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Ush2AQ2QI47 Gm40614-201ENSMUST00000125161 1254 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Ush2AQ2QI47 Gm12977-201ENSMUST00000133742 942 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Ush2AQ2QI47 Gm23598-201ENSMUST00000157262 144 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Ush2AQ2QI47 Rpl22l1-206ENSMUST00000194649 525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Ush2AQ2QI47 Gm37929-201ENSMUST00000195116 493 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Ush2AQ2QI47 Gm37481-201ENSMUST00000195176 403 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Ush2AQ2QI47 Gm18894-201ENSMUST00000198794 694 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Ush2AQ2QI47 Gm7684-201ENSMUST00000211891 829 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Ush2AQ2QI47 Sprr1a-201ENSMUST00000054599 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Ush2AQ2QI47 Psd3-213ENSMUST00000212505 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Ush2AQ2QI47 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Ush2AQ2QI47 Tmem109-201ENSMUST00000038128 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Ush2AQ2QI47 Mx1-202ENSMUST00000113768 2695 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Ush2AQ2QI47 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Ush2AQ2QI47 Kcne3-203ENSMUST00000178946 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Ush2AQ2QI47 D930007P13Rik-201ENSMUST00000181306 1324 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Ush2AQ2QI47 Gm38095-201ENSMUST00000192896 1402 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Ush2AQ2QI47 Tcn2-207ENSMUST00000109993 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Ush2AQ2QI47 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Ush2AQ2QI47 Vwa3b-206ENSMUST00000169057 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Ush2AQ2QI47 2310015K22Rik-201ENSMUST00000191452 1461 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Ush2AQ2QI47 Gm21370-201ENSMUST00000177659 573 ntAPPRIS P1 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Ush2AQ2QI47 Gm21188-201ENSMUST00000178618 573 ntAPPRIS P1 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Ush2AQ2QI47 Tmigd3-206ENSMUST00000199977 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Ush2AQ2QI47 Olfr1415-203ENSMUST00000204766 403 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Ush2AQ2QI47 Gm17909-201ENSMUST00000207587 907 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Ush2AQ2QI47 Gm10108-201ENSMUST00000078246 319 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Ush2AQ2QI47 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Ush2AQ2QI47 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Ush2AQ2QI47 Ctf2-202ENSMUST00000206038 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Ush2AQ2QI47 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Ush2AQ2QI47 Mtmr11-201ENSMUST00000054356 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Ush2AQ2QI47 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Ush2AQ2QI47 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Ush2AQ2QI47 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Ush2AQ2QI47 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Ush2AQ2QI47 Gal3st2-201ENSMUST00000094663 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Ush2AQ2QI47 Ebf3-205ENSMUST00000209578 1863 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Ush2AQ2QI47 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Ush2AQ2QI47 Gm17031-201ENSMUST00000016698 1669 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Ush2AQ2QI47 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Ush2AQ2QI47 Gm37389-201ENSMUST00000194885 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Ush2AQ2QI47 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Ush2AQ2QI47 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Ush2AQ2QI47 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Ush2AQ2QI47 Mcm2-201ENSMUST00000058011 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Ush2AQ2QI47 Olfr20-201ENSMUST00000108465 1061 ntAPPRIS P1 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Ush2AQ2QI47 Dnajc5b-202ENSMUST00000118735 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Ush2AQ2QI47 Gm24786-201ENSMUST00000157379 109 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Ush2AQ2QI47 Trav5d-4-201ENSMUST00000179701 343 ntAPPRIS P1 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Ush2AQ2QI47 Trav5n-4-201ENSMUST00000179997 343 ntAPPRIS P1 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Ush2AQ2QI47 Cdk2ap1-205ENSMUST00000196910 483 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Ush2AQ2QI47 Gm3289-201ENSMUST00000200819 756 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Ush2AQ2QI47 AC167017.1-201ENSMUST00000214975 412 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Ush2AQ2QI47 Cinp-205ENSMUST00000221182 774 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.9 ms