Protein–RNA interactions for Protein: Q00977

Gjb2, Gap junction beta-2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb2Q00977 AC122382.1-201ENSMUST00000225869 2371 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Gjb2Q00977 Spata13-210ENSMUST00000162945 5469 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gjb2Q00977 Ppef2-202ENSMUST00000201130 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gjb2Q00977 Arhgef4-204ENSMUST00000159747 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gjb2Q00977 AC140462.2-201ENSMUST00000225718 2433 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Gjb2Q00977 Mkl1-204ENSMUST00000134469 4392 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gjb2Q00977 Gpc4-201ENSMUST00000033450 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gjb2Q00977 AC122367.1-201ENSMUST00000221978 1709 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Gjb2Q00977 Rnf121-203ENSMUST00000106953 2545 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gjb2Q00977 Cutal-203ENSMUST00000113068 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gjb2Q00977 Gm3642-201ENSMUST00000166895 1762 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gjb2Q00977 AC130823.1-201ENSMUST00000228929 1549 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Gjb2Q00977 Pttg1-203ENSMUST00000101340 700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gjb2Q00977 Pttg1-205ENSMUST00000118368 696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gjb2Q00977 Mrps17-204ENSMUST00000119604 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gjb2Q00977 2810408I11Rik-201ENSMUST00000122813 435 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gjb2Q00977 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gjb2Q00977 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Gjb2Q00977 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Gjb2Q00977 Dusp13-211ENSMUST00000183943 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gjb2Q00977 Gm42423-201ENSMUST00000196396 670 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gjb2Q00977 Gm36028-202ENSMUST00000205931 1161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gjb2Q00977 6430531B16Rik-204ENSMUST00000209335 898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gjb2Q00977 C330004P14Rik-201ENSMUST00000218833 628 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gjb2Q00977 AC154435.1-201ENSMUST00000223938 959 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Gjb2Q00977 AC154680.1-201ENSMUST00000224376 859 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Gjb2Q00977 AC154305.2-201ENSMUST00000225813 901 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Gjb2Q00977 AC134793.1-202ENSMUST00000227444 803 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Gjb2Q00977 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gjb2Q00977 Gm32200-201ENSMUST00000192778 2385 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gjb2Q00977 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gjb2Q00977 Fer1l4-201ENSMUST00000109611 6106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gjb2Q00977 Cstf1-201ENSMUST00000116375 3451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gjb2Q00977 Ampd3-206ENSMUST00000170374 3489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gjb2Q00977 Chd7-206ENSMUST00000170391 3462 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gjb2Q00977 Vezt-202ENSMUST00000118077 2223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gjb2Q00977 Arpp21-217ENSMUST00000161412 1687 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gjb2Q00977 1500004A13Rik-209ENSMUST00000185189 1659 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gjb2Q00977 Psd-202ENSMUST00000096029 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gjb2Q00977 Eef2k-201ENSMUST00000047875 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gjb2Q00977 C920021L13Rik-201ENSMUST00000120398 1723 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gjb2Q00977 Gm38312-201ENSMUST00000195426 1746 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Gjb2Q00977 Maml3-202ENSMUST00000121440 8288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gjb2Q00977 Arhgap15os-201ENSMUST00000139948 1761 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gjb2Q00977 Ttll9-201ENSMUST00000099197 1797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gjb2Q00977 Epx-201ENSMUST00000049768 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gjb2Q00977 Cep250-202ENSMUST00000094421 7919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gjb2Q00977 Tiam1-203ENSMUST00000114122 4596 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gjb2Q00977 Kalrn-201ENSMUST00000076810 8940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gjb2Q00977 Tln2-205ENSMUST00000215267 4999 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gjb2Q00977 Snapc1-201ENSMUST00000021532 6275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gjb2Q00977 Myo15b-201ENSMUST00000040703 2825 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gjb2Q00977 Gm15411-201ENSMUST00000133243 3488 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gjb2Q00977 Tnfsf13b-203ENSMUST00000207792 4771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gjb2Q00977 Cd300ld2-202ENSMUST00000106578 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gjb2Q00977 Gm14892-201ENSMUST00000117636 267 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Gjb2Q00977 Elof1-202ENSMUST00000166335 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gjb2Q00977 Gm17019-201ENSMUST00000167908 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gjb2Q00977 Gm6407-201ENSMUST00000176468 549 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Gjb2Q00977 Gm44696-201ENSMUST00000181943 1229 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gjb2Q00977 Scgb2b27-203ENSMUST00000185399 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gjb2Q00977 4933402C05Rik-201ENSMUST00000208189 1035 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gjb2Q00977 Gm45682-201ENSMUST00000209434 1256 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gjb2Q00977 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gjb2Q00977 Gm9102-201ENSMUST00000219250 465 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Gjb2Q00977 Nmi-201ENSMUST00000028314 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gjb2Q00977 Rln1-201ENSMUST00000044143 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gjb2Q00977 Aplp2-202ENSMUST00000079758 3504 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gjb2Q00977 Map3k12-208ENSMUST00000171565 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gjb2Q00977 Slco2a1-201ENSMUST00000035148 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gjb2Q00977 4632415L05Rik-202ENSMUST00000198527 4087 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Gjb2Q00977 Alas1-202ENSMUST00000112524 3089 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gjb2Q00977 Asz1-201ENSMUST00000010940 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gjb2Q00977 Pex2-201ENSMUST00000059021 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gjb2Q00977 Tmem62-202ENSMUST00000110686 2417 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gjb2Q00977 B630019A10Rik-201ENSMUST00000149488 2407 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gjb2Q00977 Zc3h12a-201ENSMUST00000036188 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gjb2Q00977 Exoc7-202ENSMUST00000106411 3205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gjb2Q00977 Lrrc4-201ENSMUST00000062304 3615 ntAPPRIS P1 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gjb2Q00977 Adgrl3-201ENSMUST00000036068 6203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gjb2Q00977 Adgrl3-202ENSMUST00000072521 6203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gjb2Q00977 Ampd2-203ENSMUST00000102638 3650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gjb2Q00977 Orc4-201ENSMUST00000028098 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gjb2Q00977 Zmym3-209ENSMUST00000121520 5564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gjb2Q00977 Plrg1-204ENSMUST00000150268 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gjb2Q00977 Arfgef3-201ENSMUST00000019999 5606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gjb2Q00977 Prph2-201ENSMUST00000024773 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gjb2Q00977 Ankrd26-201ENSMUST00000112830 6930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gjb2Q00977 Gm38025-201ENSMUST00000193926 2308 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gjb2Q00977 Cfb-207ENSMUST00000176203 2733 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gjb2Q00977 Gm37613-201ENSMUST00000195677 3580 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Gjb2Q00977 Ncmap-203ENSMUST00000105858 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gjb2Q00977 3000002C10Rik-201ENSMUST00000125451 1614 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gjb2Q00977 Gm43052-201ENSMUST00000201451 1628 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Gjb2Q00977 Ocstamp-201ENSMUST00000029213 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gjb2Q00977 Bace2-201ENSMUST00000047275 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gjb2Q00977 Nfic-201ENSMUST00000020461 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gjb2Q00977 Fam222b-203ENSMUST00000155571 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gjb2Q00977 Krtap4-6-201ENSMUST00000100476 918 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gjb2Q00977 2300003K06Rik-201ENSMUST00000105054 1265 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms