Protein–RNA interactions for Protein: P81068

Irx1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx1P81068 Cd2bp2-202ENSMUST00000166791 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Irx1P81068 Mre11a-201ENSMUST00000034405 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Irx1P81068 Gm44153-201ENSMUST00000204162 1580 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Irx1P81068 Pdlim5-204ENSMUST00000168967 1755 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Irx1P81068 Eef1a1-201ENSMUST00000042235 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Irx1P81068 Etv3-201ENSMUST00000117293 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Irx1P81068 Lig3-212ENSMUST00000173727 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Irx1P81068 Scn8a-201ENSMUST00000082209 11293 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Irx1P81068 Ddr1-201ENSMUST00000003628 3802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Irx1P81068 2610005L07Rik-202ENSMUST00000140111 4009 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Irx1P81068 Tardbp-209ENSMUST00000165113 6495 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Irx1P81068 Hyal2-206ENSMUST00000195681 2968 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Irx1P81068 Gm4846-201ENSMUST00000143922 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Irx1P81068 Kir3dl2-201ENSMUST00000072125 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Irx1P81068 Ccdc130-202ENSMUST00000098578 2119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Irx1P81068 Bcl2l11-202ENSMUST00000089634 2301 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Irx1P81068 Traip-201ENSMUST00000049348 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Irx1P81068 Lrrc61-202ENSMUST00000114545 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Irx1P81068 1700030K09Rik-201ENSMUST00000064853 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Irx1P81068 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Irx1P81068 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Irx1P81068 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Irx1P81068 Cdk2ap1-204ENSMUST00000111474 1286 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Irx1P81068 Olfr1258-202ENSMUST00000111516 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Irx1P81068 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Irx1P81068 Gm12501-201ENSMUST00000119163 529 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Irx1P81068 Gm12266-201ENSMUST00000120311 962 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Irx1P81068 Trub2-210ENSMUST00000177467 744 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Irx1P81068 Gm8705-201ENSMUST00000180823 812 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Irx1P81068 Gm29187-201ENSMUST00000186681 689 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Irx1P81068 1700013M08Rik-202ENSMUST00000200080 798 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Irx1P81068 Gm42588-201ENSMUST00000200538 1297 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Irx1P81068 Gm8342-201ENSMUST00000209839 757 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Irx1P81068 Gm45338-206ENSMUST00000211460 1155 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Irx1P81068 Tex35-201ENSMUST00000027884 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Irx1P81068 Lamb1-201ENSMUST00000002979 5784 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Irx1P81068 Gm45336-201ENSMUST00000210010 3230 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Irx1P81068 Rrp7a-201ENSMUST00000018184 4363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Irx1P81068 Mov10-203ENSMUST00000106775 3584 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Irx1P81068 Mov10-206ENSMUST00000166979 3584 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Irx1P81068 Fmo3-201ENSMUST00000028010 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Irx1P81068 Slx1b-203ENSMUST00000144897 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Irx1P81068 Armc2-201ENSMUST00000095729 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Irx1P81068 Tnc-203ENSMUST00000107372 7106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Irx1P81068 Ttc1-201ENSMUST00000048578 1438 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Irx1P81068 AC165080.1-201ENSMUST00000215257 3123 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Irx1P81068 Gm37264-201ENSMUST00000194916 2192 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Irx1P81068 Bace1-202ENSMUST00000078111 4041 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Irx1P81068 Gm3372-201ENSMUST00000198806 1792 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Irx1P81068 Themis3-201ENSMUST00000024914 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Irx1P81068 Tmem106a-201ENSMUST00000039581 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Irx1P81068 Dcun1d2-204ENSMUST00000110840 2853 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Irx1P81068 Cd160-203ENSMUST00000165991 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Irx1P81068 Bcl2l11-201ENSMUST00000019281 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Irx1P81068 Col4a3-201ENSMUST00000113457 8554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Irx1P81068 Tmco4-201ENSMUST00000043042 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Irx1P81068 Sertad3-201ENSMUST00000068641 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Irx1P81068 Ido1-202ENSMUST00000110667 1656 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Irx1P81068 Hal-202ENSMUST00000129421 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Irx1P81068 Ttll5-205ENSMUST00000110224 4647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Irx1P81068 Enpp5-201ENSMUST00000024756 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Irx1P81068 Gm43972-201ENSMUST00000181398 1467 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Irx1P81068 Zc3h18-202ENSMUST00000093073 3705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Irx1P81068 Olfr1199-204ENSMUST00000213138 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Irx1P81068 Atp5g1-201ENSMUST00000090541 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Irx1P81068 Kcne2-202ENSMUST00000113971 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Irx1P81068 Anxa11os-201ENSMUST00000184083 2479 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Irx1P81068 Gm38357-201ENSMUST00000195382 2464 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Irx1P81068 Olfr478-202ENSMUST00000210173 2477 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Irx1P81068 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Irx1P81068 Gm11331-201ENSMUST00000119764 288 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Irx1P81068 Mir1896-201ENSMUST00000122641 81 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Irx1P81068 Gm14397-201ENSMUST00000124728 576 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Irx1P81068 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Irx1P81068 Mrip-ps-201ENSMUST00000184613 940 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Irx1P81068 Gm43378-201ENSMUST00000199336 582 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Irx1P81068 Gm42997-202ENSMUST00000200321 985 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Irx1P81068 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Irx1P81068 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Irx1P81068 Gm10069-203ENSMUST00000204081 907 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Irx1P81068 1700012D14Rik-202ENSMUST00000209959 629 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Irx1P81068 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Irx1P81068 Gm5532-201ENSMUST00000097531 1751 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Irx1P81068 Prox1-203ENSMUST00000177288 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Irx1P81068 Gm44617-202ENSMUST00000209122 2763 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Irx1P81068 Det1-202ENSMUST00000107431 1439 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Irx1P81068 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Irx1P81068 Uaca-202ENSMUST00000214354 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Irx1P81068 March10-201ENSMUST00000049995 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Irx1P81068 Slc16a5-202ENSMUST00000106532 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Irx1P81068 Notch2-201ENSMUST00000079812 10500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Irx1P81068 Gm29125-201ENSMUST00000187121 3220 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Irx1P81068 Gm44103-201ENSMUST00000204364 3662 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Irx1P81068 Gpr37-201ENSMUST00000054867 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Irx1P81068 Gm26511-201ENSMUST00000181400 1895 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Irx1P81068 Reps1-210ENSMUST00000164556 2537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Irx1P81068 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Irx1P81068 Gm43633-201ENSMUST00000202455 2330 ntBASIC11.4□□□□□ -0.59
Irx1P81068 Hipk2-204ENSMUST00000160360 3907 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Irx1P81068 Tacr1-201ENSMUST00000032122 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms