Protein–RNA interactions for Protein: P70122

Sbds, Ribosome maturation protein SBDS, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbdsP70122 Ubr1-201ENSMUST00000028728 7768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SbdsP70122 Sgk3-203ENSMUST00000168907 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SbdsP70122 Gm38901-201ENSMUST00000202448 3008 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SbdsP70122 1700030K09Rik-202ENSMUST00000121902 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
SbdsP70122 Gm44617-202ENSMUST00000209122 2763 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SbdsP70122 Tead3-207ENSMUST00000219703 1320 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SbdsP70122 Adgra1-201ENSMUST00000026548 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SbdsP70122 Aspm-201ENSMUST00000053364 9867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SbdsP70122 Cstf1-201ENSMUST00000116375 3451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SbdsP70122 Srpx2-201ENSMUST00000033606 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SbdsP70122 Gm8271-201ENSMUST00000171053 1469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
SbdsP70122 Cpvl-202ENSMUST00000203101 1488 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SbdsP70122 D2hgdh-201ENSMUST00000097633 3232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
SbdsP70122 Ank2-214ENSMUST00000182547 2428 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
SbdsP70122 Specc1-214ENSMUST00000202389 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
SbdsP70122 Mst1r-201ENSMUST00000035203 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
SbdsP70122 Prpf40b-202ENSMUST00000118287 3129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
SbdsP70122 Slc18a1-201ENSMUST00000037478 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
SbdsP70122 Tns1-217ENSMUST00000191104 9904 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
SbdsP70122 Sema3b-203ENSMUST00000102530 3410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
SbdsP70122 Clock-201ENSMUST00000075159 7478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
SbdsP70122 Prdm1-202ENSMUST00000105490 4025 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
SbdsP70122 Lrtm2-201ENSMUST00000068351 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
SbdsP70122 Pigk-204ENSMUST00000159899 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
SbdsP70122 Ypel4-201ENSMUST00000090729 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
SbdsP70122 Trpm1-201ENSMUST00000085222 5711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
SbdsP70122 Epn2-203ENSMUST00000108712 4458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
SbdsP70122 Myc-206ENSMUST00000167731 1821 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
SbdsP70122 4931423N10Rik-201ENSMUST00000028113 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
SbdsP70122 S100a16-206ENSMUST00000107335 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
SbdsP70122 Eif4e1b-201ENSMUST00000110003 2131 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
SbdsP70122 Eapp-202ENSMUST00000110713 886 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
SbdsP70122 Gm16587-201ENSMUST00000161943 863 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
SbdsP70122 Calm5-202ENSMUST00000184271 423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
SbdsP70122 Gm29088-201ENSMUST00000189363 581 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
SbdsP70122 Mir124-2hg-207ENSMUST00000189868 535 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
SbdsP70122 BC026585-203ENSMUST00000193791 778 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
SbdsP70122 Gm17831-201ENSMUST00000205579 900 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
SbdsP70122 CT485606.1-201ENSMUST00000213187 878 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
SbdsP70122 Fam151b-201ENSMUST00000040106 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
SbdsP70122 Skp2-201ENSMUST00000096482 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
SbdsP70122 B630019A10Rik-201ENSMUST00000149488 2407 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
SbdsP70122 A430105I19Rik-201ENSMUST00000059997 4703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
SbdsP70122 Als2-201ENSMUST00000027178 6342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
SbdsP70122 Ap1m2-201ENSMUST00000003397 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
SbdsP70122 Bace1-202ENSMUST00000078111 4041 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
SbdsP70122 Angptl2-201ENSMUST00000004208 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
SbdsP70122 Glb1l-201ENSMUST00000113623 2339 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
SbdsP70122 Mthfd1l-203ENSMUST00000120585 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
SbdsP70122 Olfr520-202ENSMUST00000220185 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
SbdsP70122 Prdm10-204ENSMUST00000215499 6772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
SbdsP70122 Snhg18-201ENSMUST00000181536 1486 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
SbdsP70122 4933408B17Rik-201ENSMUST00000056932 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
SbdsP70122 Rtn4ip1-201ENSMUST00000054418 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
SbdsP70122 Plekha7-201ENSMUST00000084664 4312 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
SbdsP70122 Dcun1d2-204ENSMUST00000110840 2853 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SbdsP70122 Ralgps1-202ENSMUST00000091039 2738 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SbdsP70122 Clu-201ENSMUST00000022616 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SbdsP70122 Gm7967-202ENSMUST00000191042 5042 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
SbdsP70122 Aldoa-201ENSMUST00000032934 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SbdsP70122 Arhgap24-204ENSMUST00000112852 2783 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SbdsP70122 Olfr6-203ENSMUST00000213651 4457 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SbdsP70122 Lct-201ENSMUST00000073490 6174 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SbdsP70122 Zfp423-203ENSMUST00000165770 4334 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SbdsP70122 C2-206ENSMUST00000152417 2157 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SbdsP70122 Armcx6-201ENSMUST00000052431 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SbdsP70122 Ankub1-202ENSMUST00000197088 1854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SbdsP70122 Spg20-203ENSMUST00000117341 2957 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SbdsP70122 Csrnp3-208ENSMUST00000176109 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SbdsP70122 Gpc4-201ENSMUST00000033450 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SbdsP70122 Kit-201ENSMUST00000005815 5214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SbdsP70122 Dgkh-201ENSMUST00000074729 3967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SbdsP70122 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
SbdsP70122 4930595D18Rik-201ENSMUST00000121608 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SbdsP70122 Gm12224-201ENSMUST00000124047 567 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SbdsP70122 Smim5-203ENSMUST00000152171 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SbdsP70122 Bloc1s1-205ENSMUST00000153731 613 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SbdsP70122 Gm3233-201ENSMUST00000168997 693 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SbdsP70122 Gm20535-201ENSMUST00000173157 1268 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SbdsP70122 Gm17709-201ENSMUST00000174536 1096 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
SbdsP70122 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
SbdsP70122 Gm20662-201ENSMUST00000176356 601 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SbdsP70122 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SbdsP70122 Gm4812-201ENSMUST00000182847 993 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
SbdsP70122 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SbdsP70122 Gm37826-201ENSMUST00000195329 322 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
SbdsP70122 Gm43692-201ENSMUST00000198236 1062 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
SbdsP70122 Gm30946-201ENSMUST00000198288 724 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
SbdsP70122 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SbdsP70122 Tepp-207ENSMUST00000212056 613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SbdsP70122 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SbdsP70122 AC154826.1-201ENSMUST00000217369 498 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SbdsP70122 CT010506.1-201ENSMUST00000223673 349 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
SbdsP70122 Atp5h-201ENSMUST00000043931 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SbdsP70122 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SbdsP70122 Gm32511-202ENSMUST00000217021 2069 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SbdsP70122 Gtf2ird1-204ENSMUST00000100652 3693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SbdsP70122 E2f8-201ENSMUST00000058745 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SbdsP70122 Axin2-202ENSMUST00000106711 2551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SbdsP70122 Atxn2l-206ENSMUST00000206577 3894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms