Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

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Length 422 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 1700123L14Rik-201ENSMUST00000090061 1747 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
VdrP48281 Gm45675-201ENSMUST00000211202 3429 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
VdrP48281 4933400A11Rik-203ENSMUST00000112102 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
VdrP48281 Cetn2-203ENSMUST00000114551 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
VdrP48281 Gm14724-201ENSMUST00000118400 537 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
VdrP48281 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
VdrP48281 Gm12196-201ENSMUST00000120954 262 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
VdrP48281 B9d1os-201ENSMUST00000137010 674 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
VdrP48281 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
VdrP48281 Zfp133-ps-204ENSMUST00000149523 424 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
VdrP48281 D630008O14Rik-202ENSMUST00000149909 1043 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
VdrP48281 Gm24074-201ENSMUST00000158178 260 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
VdrP48281 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
VdrP48281 Ubl5-206ENSMUST00000161486 794 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
VdrP48281 Dhx34-207ENSMUST00000163968 3801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
VdrP48281 Ssty2-201ENSMUST00000179136 684 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
VdrP48281 Mrip-ps-201ENSMUST00000184613 940 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
VdrP48281 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
VdrP48281 Gm5244-202ENSMUST00000189517 743 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
VdrP48281 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
VdrP48281 Atraid-205ENSMUST00000201136 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
VdrP48281 Gm7504-201ENSMUST00000201449 424 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
VdrP48281 Gm8615-202ENSMUST00000201946 737 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
VdrP48281 Gm5302-201ENSMUST00000202130 796 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
VdrP48281 Pip-202ENSMUST00000203244 736 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
VdrP48281 Saa2-202ENSMUST00000210272 511 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
VdrP48281 Pmis2-201ENSMUST00000051495 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
VdrP48281 Nell2-202ENSMUST00000166170 3366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
VdrP48281 Pcdh20-202ENSMUST00000192557 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
VdrP48281 Ampd2-201ENSMUST00000078912 3368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
VdrP48281 L3mbtl1-201ENSMUST00000035751 2724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
VdrP48281 Pabpc4-201ENSMUST00000078734 2700 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
VdrP48281 Ern2-201ENSMUST00000033153 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
VdrP48281 Prdm16-203ENSMUST00000097759 8544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
VdrP48281 Uba6-202ENSMUST00000113373 3504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
VdrP48281 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
VdrP48281 Clip1-203ENSMUST00000111561 5883 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
VdrP48281 Mlc1-202ENSMUST00000109368 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
VdrP48281 Olfr1490-202ENSMUST00000213900 5165 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
VdrP48281 Tubb2b-201ENSMUST00000075774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
VdrP48281 Ism2-201ENSMUST00000051601 1350 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
VdrP48281 C230024C17Rik-201ENSMUST00000190663 3337 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
VdrP48281 Gm20715-201ENSMUST00000054781 4460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
VdrP48281 Gtf2i-222ENSMUST00000174354 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
VdrP48281 Ss18l2-206ENSMUST00000215966 2316 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
VdrP48281 Olfr707-205ENSMUST00000214112 1735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
VdrP48281 Xlr4c-201ENSMUST00000068551 1500 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
VdrP48281 Tti2-204ENSMUST00000210129 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
VdrP48281 Cfi-201ENSMUST00000077918 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
VdrP48281 Nanog-201ENSMUST00000012540 2211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
VdrP48281 Lin54-209ENSMUST00000152387 2760 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
VdrP48281 Ap5z1-201ENSMUST00000038699 3689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
VdrP48281 Gpcpd1-202ENSMUST00000060955 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
VdrP48281 Trgv2-201ENSMUST00000103563 491 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
VdrP48281 Gm25148-201ENSMUST00000104611 123 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
VdrP48281 Tatdn3-203ENSMUST00000110891 1214 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
VdrP48281 Tatdn3-204ENSMUST00000110893 1242 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
VdrP48281 Gm15549-201ENSMUST00000121595 622 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
VdrP48281 Cryzl1-204ENSMUST00000122254 845 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
VdrP48281 Gm11772-201ENSMUST00000136542 532 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
VdrP48281 Gm2965-201ENSMUST00000198365 343 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
VdrP48281 Gm8342-201ENSMUST00000209839 757 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
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VdrP48281 Abhd14b-210ENSMUST00000217496 631 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
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VdrP48281 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
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VdrP48281 Gm10288-201ENSMUST00000084614 537 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
VdrP48281 Invs-201ENSMUST00000030029 5633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
VdrP48281 Commd1-204ENSMUST00000159081 4508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
VdrP48281 Supt16-201ENSMUST00000046709 4673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
VdrP48281 Gm18642-201ENSMUST00000206642 1400 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
VdrP48281 Olfr95-201ENSMUST00000060728 5129 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
VdrP48281 Slc7a3-203ENSMUST00000113710 2750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
VdrP48281 Sp140-201ENSMUST00000080204 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
VdrP48281 Hdac9-206ENSMUST00000209990 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
VdrP48281 Atxn7l3-203ENSMUST00000107134 3712 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
VdrP48281 Tom1l2-203ENSMUST00000093048 4864 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
VdrP48281 Pex19-202ENSMUST00000111252 2844 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
VdrP48281 Qtrt2-201ENSMUST00000023387 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
VdrP48281 Snx31-203ENSMUST00000161202 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
VdrP48281 Lin37-202ENSMUST00000108164 1312 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
VdrP48281 AC160863.4-201ENSMUST00000218099 1334 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
VdrP48281 Arhgap33os-201ENSMUST00000124276 2648 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
VdrP48281 Cap1-201ENSMUST00000069533 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
VdrP48281 Amd-ps3-201ENSMUST00000072796 1496 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
VdrP48281 Gne-201ENSMUST00000030201 5384 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
VdrP48281 Rab2b-201ENSMUST00000022765 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
VdrP48281 Synpo2l-203ENSMUST00000119483 3696 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
VdrP48281 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
VdrP48281 Ccdc163-202ENSMUST00000106462 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
VdrP48281 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
VdrP48281 Olfr999-ps1-201ENSMUST00000122319 949 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
VdrP48281 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
VdrP48281 Gm8100-201ENSMUST00000182906 988 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
VdrP48281 Nkx2-2os-202ENSMUST00000184407 458 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
VdrP48281 Gm29187-201ENSMUST00000186681 689 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
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