Protein–RNA interactions for Protein: P35822

Ptprk, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, mousemouse

Predictions only

Length 1,457 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprkP35822 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PtprkP35822 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PtprkP35822 Lig3-212ENSMUST00000173727 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PtprkP35822 Abcf3-201ENSMUST00000003319 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PtprkP35822 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PtprkP35822 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PtprkP35822 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PtprkP35822 Gm21939-201ENSMUST00000221137 2773 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PtprkP35822 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PtprkP35822 Gm11715-201ENSMUST00000129501 695 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PtprkP35822 4930538E20Rik-201ENSMUST00000131383 546 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PtprkP35822 Gm24368-201ENSMUST00000175388 106 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PtprkP35822 Gm18749-201ENSMUST00000222410 692 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PtprkP35822 Fibp-201ENSMUST00000025847 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PtprkP35822 Cxcl3-201ENSMUST00000031326 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PtprkP35822 Hpf1-201ENSMUST00000037190 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PtprkP35822 Cd247-202ENSMUST00000027849 1317 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PtprkP35822 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PtprkP35822 Gm38348-201ENSMUST00000191718 2273 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PtprkP35822 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PtprkP35822 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PtprkP35822 Vmn2r18-201ENSMUST00000165928 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PtprkP35822 Gm38220-201ENSMUST00000195774 1447 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PtprkP35822 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PtprkP35822 Sez6l-206ENSMUST00000212758 2664 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PtprkP35822 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PtprkP35822 Plrg1-204ENSMUST00000150268 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PtprkP35822 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PtprkP35822 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PtprkP35822 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PtprkP35822 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PtprkP35822 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PtprkP35822 Fhl1-206ENSMUST00000116596 1203 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PtprkP35822 Gm14108-201ENSMUST00000122234 494 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PtprkP35822 Gm15221-201ENSMUST00000144439 414 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PtprkP35822 Gm3052-201ENSMUST00000186409 829 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PtprkP35822 4933436E23Rik-201ENSMUST00000192824 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PtprkP35822 Gm7319-201ENSMUST00000210047 778 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PtprkP35822 Olfr1248-201ENSMUST00000216129 1078 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PtprkP35822 CT030011.1-201ENSMUST00000221959 264 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PtprkP35822 Xlr4b-201ENSMUST00000069077 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PtprkP35822 Olfr128-201ENSMUST00000080231 1050 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PtprkP35822 Gm8848-201ENSMUST00000197270 1343 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PtprkP35822 Myc-208ENSMUST00000191178 1362 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PtprkP35822 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PtprkP35822 Gm10344-201ENSMUST00000193498 1419 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PtprkP35822 Spert-201ENSMUST00000035243 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PtprkP35822 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PtprkP35822 Gemin8-202ENSMUST00000087169 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PtprkP35822 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PtprkP35822 Gm32828-202ENSMUST00000219198 2111 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PtprkP35822 Cutal-203ENSMUST00000113068 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PtprkP35822 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PtprkP35822 Magee2-201ENSMUST00000033575 2316 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PtprkP35822 Mknk2-201ENSMUST00000003433 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PtprkP35822 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PtprkP35822 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PtprkP35822 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PtprkP35822 Trim23-203ENSMUST00000069187 3546 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PtprkP35822 Gm3716-202ENSMUST00000198582 2879 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PtprkP35822 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PtprkP35822 Fut10-202ENSMUST00000110527 2327 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PtprkP35822 Optc-201ENSMUST00000124051 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PtprkP35822 Gm14858-201ENSMUST00000138614 1758 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PtprkP35822 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
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PtprkP35822 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PtprkP35822 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PtprkP35822 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PtprkP35822 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PtprkP35822 Gm8216-201ENSMUST00000117232 601 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
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PtprkP35822 Rplp1-ps1-201ENSMUST00000119410 345 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
PtprkP35822 Gm12499-201ENSMUST00000121961 546 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
PtprkP35822 Optc-204ENSMUST00000149380 1180 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PtprkP35822 Gm16184-201ENSMUST00000162324 573 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
PtprkP35822 Gm5205-201ENSMUST00000182253 1003 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
PtprkP35822 1700063D05Rik-203ENSMUST00000191461 666 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PtprkP35822 Rps27-202ENSMUST00000195998 458 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PtprkP35822 Gm21149-201ENSMUST00000197995 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PtprkP35822 Gm3889-201ENSMUST00000212467 612 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
PtprkP35822 Gimd1-205ENSMUST00000212852 1234 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PtprkP35822 Gm29783-201ENSMUST00000219398 369 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
PtprkP35822 Clpsl2-201ENSMUST00000025061 442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PtprkP35822 Eif3m-201ENSMUST00000028592 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PtprkP35822 Gm8186-201ENSMUST00000053575 386 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PtprkP35822 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PtprkP35822 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PtprkP35822 Actr1a-201ENSMUST00000040270 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PtprkP35822 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PtprkP35822 Eya2-201ENSMUST00000063433 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PtprkP35822 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PtprkP35822 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PtprkP35822 Fut8-203ENSMUST00000177595 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PtprkP35822 Gm11427-201ENSMUST00000117952 1696 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
PtprkP35822 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PtprkP35822 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PtprkP35822 6030469F06Rik-202ENSMUST00000218473 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PtprkP35822 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PtprkP35822 Ccl6-201ENSMUST00000019071 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
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