Protein–RNA interactions for Protein: P28705

Rxrg, Retinoic acid receptor RXR-gamma, mousemouse

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Length 463 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxrgP28705 Gm43778-201ENSMUST00000199438 199 ntBASIC11□□□□□ -0.65
RxrgP28705 5830411K02Rik-201ENSMUST00000200000 997 ntBASIC11□□□□□ -0.65
RxrgP28705 Bcap31-201ENSMUST00000002091 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
RxrgP28705 4930543N07Rik-202ENSMUST00000209503 1117 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
RxrgP28705 Gm30978-201ENSMUST00000211581 1066 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
RxrgP28705 D830035M03Rik-201ENSMUST00000213677 1041 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
RxrgP28705 CT025602.2-201ENSMUST00000226553 772 ntBASIC11□□□□□ -0.65
RxrgP28705 Tspo2-201ENSMUST00000024794 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
RxrgP28705 Magi1-203ENSMUST00000093769 4598 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
RxrgP28705 Abhd18-201ENSMUST00000108077 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
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RxrgP28705 Gtf2ird1-204ENSMUST00000100652 3693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
RxrgP28705 Fam109b-203ENSMUST00000161178 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
RxrgP28705 Gm29895-201ENSMUST00000209933 5652 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
RxrgP28705 1500002C15Rik-201ENSMUST00000178987 2183 ntBASIC11□□□□□ -0.65
RxrgP28705 Dync1i2-208ENSMUST00000112144 2565 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
RxrgP28705 Gm12799-201ENSMUST00000118151 2560 ntBASIC11□□□□□ -0.65
RxrgP28705 Ank3-220ENSMUST00000182439 2586 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
RxrgP28705 Gmps-201ENSMUST00000029405 8105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
RxrgP28705 C130060K24Rik-203ENSMUST00000170608 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
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RxrgP28705 AC125374.1-201ENSMUST00000213573 1400 ntBASIC11□□□□□ -0.65
RxrgP28705 Meikin-201ENSMUST00000094193 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
RxrgP28705 Atp6v1a-201ENSMUST00000063661 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
RxrgP28705 Mier1-204ENSMUST00000106857 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
RxrgP28705 Col6a4-201ENSMUST00000121963 7371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
RxrgP28705 Hsd17b6-203ENSMUST00000219447 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
RxrgP28705 Ccdc162-212ENSMUST00000219054 3182 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
RxrgP28705 Sparcl1-201ENSMUST00000031249 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RxrgP28705 Capn8-201ENSMUST00000048941 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RxrgP28705 Spata5-201ENSMUST00000029277 2890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RxrgP28705 Brat1-201ENSMUST00000041588 3333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RxrgP28705 Anxa6-201ENSMUST00000102727 2471 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RxrgP28705 Lexm-202ENSMUST00000106788 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RxrgP28705 Gm13652-201ENSMUST00000143898 3412 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RxrgP28705 Slc1a2-201ENSMUST00000005220 2127 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RxrgP28705 Matn2-205ENSMUST00000227759 3569 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
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RxrgP28705 Mad1l1-201ENSMUST00000031534 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RxrgP28705 Gm45218-201ENSMUST00000205533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RxrgP28705 Ttll5-202ENSMUST00000040273 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
RxrgP28705 Agpat3-204ENSMUST00000105389 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RxrgP28705 Rad18-204ENSMUST00000113182 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
RxrgP28705 Bdkrb2-201ENSMUST00000001652 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RxrgP28705 Slc7a4-201ENSMUST00000063544 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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RxrgP28705 Gm13572-201ENSMUST00000153675 559 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RxrgP28705 BC016548-202ENSMUST00000153797 805 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RxrgP28705 Gas5-224ENSMUST00000162558 502 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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RxrgP28705 Dhx40-201ENSMUST00000018569 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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RxrgP28705 Spata3-201ENSMUST00000052854 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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RxrgP28705 6430562O15Rik-201ENSMUST00000180491 2488 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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RxrgP28705 Srp54a-207ENSMUST00000110708 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RxrgP28705 Tnpo3-201ENSMUST00000012679 4251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RxrgP28705 Nr1i2-201ENSMUST00000023504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RxrgP28705 Psd2-203ENSMUST00000175734 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RxrgP28705 Ezr-201ENSMUST00000064234 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RxrgP28705 Dzip1l-203ENSMUST00000112885 4350 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RxrgP28705 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RxrgP28705 Bpifb9b-201ENSMUST00000088921 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RxrgP28705 Gdi1-201ENSMUST00000015435 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RxrgP28705 Klhl3-201ENSMUST00000091583 6871 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
RxrgP28705 Uhrf1-202ENSMUST00000113035 3402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RxrgP28705 Iqce-201ENSMUST00000041783 6037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RxrgP28705 Kat6b-201ENSMUST00000069648 7649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
RxrgP28705 Gm11033-203ENSMUST00000156185 2321 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
RxrgP28705 C1rl-201ENSMUST00000049124 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
RxrgP28705 B3glct-201ENSMUST00000100404 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
RxrgP28705 Dglucy-204ENSMUST00000110073 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
RxrgP28705 Msh3-201ENSMUST00000022220 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
RxrgP28705 Elovl7-201ENSMUST00000022207 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
RxrgP28705 Tnxb-201ENSMUST00000087399 12209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
RxrgP28705 Lamb1-205ENSMUST00000169088 5557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
RxrgP28705 Chml-204ENSMUST00000211207 1866 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
RxrgP28705 Fdft1-201ENSMUST00000054963 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
RxrgP28705 Cat-202ENSMUST00000111168 779 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
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