Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

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Length 467 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Dock6-207ENSMUST00000217336 6880 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
RxraP28700 Nfx1-201ENSMUST00000030133 4349 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
RxraP28700 Siglec1-203ENSMUST00000110227 5790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
RxraP28700 Zfp869-201ENSMUST00000080987 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
RxraP28700 Pard3-213ENSMUST00000160766 4949 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
RxraP28700 Chdh-202ENSMUST00000118917 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
RxraP28700 Tnk2-204ENSMUST00000115123 4225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
RxraP28700 Mrgpre-201ENSMUST00000054048 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
RxraP28700 Mkl1-204ENSMUST00000134469 4392 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
RxraP28700 Fam53a-203ENSMUST00000065162 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
RxraP28700 Ctnnd1-204ENSMUST00000099941 5783 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
RxraP28700 Slc1a2-201ENSMUST00000005220 2127 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
RxraP28700 Zfp606-202ENSMUST00000123589 3509 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
RxraP28700 Pdgfra-202ENSMUST00000168162 6834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
RxraP28700 Pfkfb3-202ENSMUST00000049849 2076 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
RxraP28700 Optc-201ENSMUST00000124051 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
RxraP28700 Etv1-211ENSMUST00000162563 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
RxraP28700 Gstm4-202ENSMUST00000106670 777 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
RxraP28700 0610010K14Rik-206ENSMUST00000108576 576 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
RxraP28700 Pmp22-203ENSMUST00000108701 723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
RxraP28700 Gm7929-201ENSMUST00000178711 624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
RxraP28700 Gm3015-202ENSMUST00000179803 624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
RxraP28700 Gm4895-201ENSMUST00000181646 1137 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
RxraP28700 Gm27232-201ENSMUST00000184373 597 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
RxraP28700 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
RxraP28700 Eef1b2-209ENSMUST00000188524 681 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
RxraP28700 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
RxraP28700 4930557B06Rik-201ENSMUST00000200193 381 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
RxraP28700 Gm45550-201ENSMUST00000209380 946 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
RxraP28700 5830428M24Rik-204ENSMUST00000223143 1034 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
RxraP28700 Lgi3-203ENSMUST00000226548 1001 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
RxraP28700 Nme6-201ENSMUST00000035053 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
RxraP28700 Snora73b-201ENSMUST00000083419 205 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
RxraP28700 Gm10179-201ENSMUST00000086233 688 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
RxraP28700 Gmps-201ENSMUST00000029405 8105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
RxraP28700 Chd1-201ENSMUST00000024620 3196 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
RxraP28700 Zfp36-201ENSMUST00000051241 2790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
RxraP28700 Olfr1349-206ENSMUST00000213656 4492 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
RxraP28700 Trp63-207ENSMUST00000115308 2380 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
RxraP28700 Vmn2r18-201ENSMUST00000165928 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
RxraP28700 Mamdc2-201ENSMUST00000036069 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
RxraP28700 Tubb2b-201ENSMUST00000075774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
RxraP28700 Syn2-203ENSMUST00000203450 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
RxraP28700 Sirpa-201ENSMUST00000049262 3644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
RxraP28700 Gpm6b-209ENSMUST00000112235 4480 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
RxraP28700 Gria4-202ENSMUST00000063508 5352 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
RxraP28700 Tmem126b-201ENSMUST00000032843 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
RxraP28700 Serpinb6b-203ENSMUST00000164541 1719 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
RxraP28700 Zdhhc3-208ENSMUST00000147563 6987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
RxraP28700 Fibcd1-201ENSMUST00000028188 4751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
RxraP28700 Tsc2-201ENSMUST00000097373 6018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
RxraP28700 Hrc-201ENSMUST00000085351 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
RxraP28700 Gm18210-201ENSMUST00000209001 1524 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
RxraP28700 Ciita-201ENSMUST00000023147 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
RxraP28700 Dhdds-201ENSMUST00000012262 3133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
RxraP28700 Myo18a-224ENSMUST00000172303 6339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
RxraP28700 Slc25a17-201ENSMUST00000023040 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
RxraP28700 Qars-203ENSMUST00000134939 2374 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
RxraP28700 Ano10-203ENSMUST00000214409 2384 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
RxraP28700 Pak7-201ENSMUST00000035264 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
RxraP28700 Rufy4-202ENSMUST00000127134 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
RxraP28700 Asap1-202ENSMUST00000110114 4409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
RxraP28700 Thoc6-202ENSMUST00000095579 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
RxraP28700 Adcy6-205ENSMUST00000228566 3707 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.89□□□□□ -0.67
RxraP28700 Clip1-202ENSMUST00000063905 4589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
RxraP28700 Gm29684-201ENSMUST00000220248 1982 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
RxraP28700 Ndor1-201ENSMUST00000100329 4517 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
RxraP28700 Gm14892-201ENSMUST00000117636 267 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
RxraP28700 Tctex1d1-205ENSMUST00000140654 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
RxraP28700 1700122E12Rik-202ENSMUST00000147538 479 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
RxraP28700 Mir1943-201ENSMUST00000158276 73 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
RxraP28700 Gm17877-201ENSMUST00000192578 814 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
RxraP28700 Gm37986-201ENSMUST00000193285 383 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
RxraP28700 Pcdhga1-201ENSMUST00000194190 4692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
RxraP28700 9530034A14Rik-201ENSMUST00000197919 1083 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
RxraP28700 Gm18561-201ENSMUST00000206027 804 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
RxraP28700 Gm7972-202ENSMUST00000208453 505 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
RxraP28700 Gm8436-201ENSMUST00000210152 1080 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
RxraP28700 Gm5749-201ENSMUST00000210673 1090 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
RxraP28700 CT485607.1-201ENSMUST00000216100 85 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
RxraP28700 Gm32939-201ENSMUST00000222336 843 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
RxraP28700 2210010C04Rik-201ENSMUST00000031931 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
RxraP28700 Scgb2b2-201ENSMUST00000038835 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
RxraP28700 Cuzd1-201ENSMUST00000046611 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
RxraP28700 Stk38-201ENSMUST00000009138 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
RxraP28700 Recql-202ENSMUST00000100832 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
RxraP28700 Vcan-202ENSMUST00000109544 5702 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
RxraP28700 Ormdl2-201ENSMUST00000026409 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
RxraP28700 Anks1b-233ENSMUST00000183156 4248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
RxraP28700 Gm10417-201ENSMUST00000194341 3522 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
RxraP28700 Ap5z1-201ENSMUST00000038699 3689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
RxraP28700 Plpp3-201ENSMUST00000064139 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
RxraP28700 Tnk2os-201ENSMUST00000141256 1392 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
RxraP28700 Ikzf2-204ENSMUST00000188110 1365 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
RxraP28700 Ikzf2-208ENSMUST00000190855 1359 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
RxraP28700 Mobp-202ENSMUST00000093773 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
RxraP28700 Nrg1-213ENSMUST00000208617 2787 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
RxraP28700 Txlng-201ENSMUST00000041370 3862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
RxraP28700 Ccdc136-207ENSMUST00000154619 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
RxraP28700 Unkl-202ENSMUST00000039734 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
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