Protein–RNA interactions for Protein: P28028

Braf, Serine/threonine-protein kinase B-raf, mousemouse

Predictions only

Length 804 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BrafP28028 Odf2-207ENSMUST00000113762 2353 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
BrafP28028 Plcxd2-201ENSMUST00000130481 7140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
BrafP28028 Gm10848-201ENSMUST00000192361 1811 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
BrafP28028 AC155245.1-201ENSMUST00000222266 1804 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
BrafP28028 Ifih1-201ENSMUST00000028259 5470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
BrafP28028 Zc3hc1-201ENSMUST00000080812 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
BrafP28028 Gm23272-201ENSMUST00000104053 129 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
BrafP28028 Gm11985-201ENSMUST00000122910 1007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
BrafP28028 Gm17231-202ENSMUST00000165858 663 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
BrafP28028 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
BrafP28028 Gm20662-201ENSMUST00000176356 601 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
BrafP28028 Mir6979-201ENSMUST00000183927 56 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
BrafP28028 Gm37597-201ENSMUST00000191853 382 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
BrafP28028 BC026585-203ENSMUST00000193791 778 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
BrafP28028 Gm44421-201ENSMUST00000205064 1221 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
BrafP28028 Itgax-203ENSMUST00000205460 1215 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
BrafP28028 Gm9132-201ENSMUST00000210182 832 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
BrafP28028 CT010465.1-201ENSMUST00000222463 809 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
BrafP28028 CT025602.2-201ENSMUST00000226553 772 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
BrafP28028 Odf3-201ENSMUST00000026555 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
BrafP28028 Gm6781-201ENSMUST00000038304 1242 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
BrafP28028 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
BrafP28028 1700017B05Rik-201ENSMUST00000034846 4152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
BrafP28028 Helz-202ENSMUST00000100305 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
BrafP28028 Rbms3-201ENSMUST00000044901 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
BrafP28028 AC122273.1-201ENSMUST00000213634 2327 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
BrafP28028 Arih2-201ENSMUST00000013338 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
BrafP28028 Nrxn1-215ENSMUST00000173917 1439 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
BrafP28028 Foxp1-201ENSMUST00000074346 2118 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
BrafP28028 Atxn1l-202ENSMUST00000212605 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
BrafP28028 Sept9-205ENSMUST00000106354 3869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
BrafP28028 Cacna1c-202ENSMUST00000078320 8062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
BrafP28028 Gm44153-201ENSMUST00000204162 1580 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
BrafP28028 Hoxa1-201ENSMUST00000000964 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
BrafP28028 Srcap-201ENSMUST00000066582 4545 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
BrafP28028 Pklr-201ENSMUST00000047111 2787 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
BrafP28028 Foxd2os-201ENSMUST00000123272 2908 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
BrafP28028 Uimc1-204ENSMUST00000127195 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
BrafP28028 Prss47-202ENSMUST00000203968 1353 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
BrafP28028 Exoc4-202ENSMUST00000090381 2598 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
BrafP28028 Sema3b-203ENSMUST00000102530 3410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
BrafP28028 A630052C17Rik-201ENSMUST00000129876 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
BrafP28028 Azin1-203ENSMUST00000110329 4217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
BrafP28028 Prom2-202ENSMUST00000103214 4190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
BrafP28028 Zkscan6-201ENSMUST00000018491 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
BrafP28028 Mybph-201ENSMUST00000038445 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
BrafP28028 Gm9415-201ENSMUST00000200462 1321 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
BrafP28028 Golm1-201ENSMUST00000022039 3954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
BrafP28028 Ahrr-201ENSMUST00000022059 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
BrafP28028 Snhg18-201ENSMUST00000181536 1486 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
BrafP28028 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
BrafP28028 Zfp398-202ENSMUST00000114598 8328 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
BrafP28028 Ttll1-201ENSMUST00000016897 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
BrafP28028 Gm25148-201ENSMUST00000104611 123 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
BrafP28028 Cdc42se1-204ENSMUST00000107201 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
BrafP28028 Gm11949-201ENSMUST00000117640 372 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
BrafP28028 Gm13166-201ENSMUST00000123828 940 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
BrafP28028 Cfap100-204ENSMUST00000134224 849 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
BrafP28028 Gm13236-201ENSMUST00000153010 940 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
BrafP28028 Tmem116-209ENSMUST00000156080 1184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
BrafP28028 Prss36-208ENSMUST00000156152 1132 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
BrafP28028 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
BrafP28028 Gm26787-201ENSMUST00000180474 608 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
BrafP28028 Gm29261-201ENSMUST00000188535 678 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
BrafP28028 1600010M07Rik-202ENSMUST00000188662 654 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
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BrafP28028 Gm45765-201ENSMUST00000212027 1035 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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BrafP28028 Csrp2-203ENSMUST00000219502 544 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
BrafP28028 Gm19046-201ENSMUST00000221263 1298 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
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BrafP28028 Gm10020-201ENSMUST00000081993 612 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
BrafP28028 Det1-202ENSMUST00000107431 1439 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
BrafP28028 Gm43307-201ENSMUST00000199465 2371 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
BrafP28028 Csgalnact1-201ENSMUST00000078350 3943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
BrafP28028 Rab27a-201ENSMUST00000034722 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
BrafP28028 Lsamp-201ENSMUST00000078873 2951 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
BrafP28028 Anks1b-233ENSMUST00000183156 4248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
BrafP28028 AC121870.2-201ENSMUST00000214343 1870 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
BrafP28028 Ywhaz-201ENSMUST00000022894 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
BrafP28028 Syncrip-208ENSMUST00000174282 3404 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
BrafP28028 Sorcs1-208ENSMUST00000211687 7080 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
BrafP28028 Atxn1l-201ENSMUST00000093162 7526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
BrafP28028 Tom1l2-203ENSMUST00000093048 4864 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
BrafP28028 Oc90-202ENSMUST00000079776 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
BrafP28028 Lig4-201ENSMUST00000095476 5028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
BrafP28028 Gm13684-201ENSMUST00000152569 2264 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
BrafP28028 Piwil1-202ENSMUST00000195959 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
BrafP28028 Elmo3-201ENSMUST00000109375 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
BrafP28028 Akap3-201ENSMUST00000095440 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
BrafP28028 Dclk2-209ENSMUST00000195561 3486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
BrafP28028 Nrp2-202ENSMUST00000063594 6342 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
BrafP28028 Syk-202ENSMUST00000118756 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
BrafP28028 Cnot8-202ENSMUST00000108843 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
BrafP28028 Svil-204ENSMUST00000127297 6243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.6 ms