Protein–RNA interactions for Protein: P23463

Hoxd8, Homeobox protein Hox-D8, mousemouse

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Length 289 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd8P23463 Gm22388-201ENSMUST00000158194 248 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxd8P23463 Gm24346-201ENSMUST00000158712 194 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxd8P23463 Tstd1-201ENSMUST00000171362 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxd8P23463 Cd9-ps-201ENSMUST00000174687 650 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxd8P23463 Gm22923-201ENSMUST00000174952 110 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxd8P23463 Gm26875-201ENSMUST00000181006 950 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxd8P23463 Gm5801-201ENSMUST00000182247 780 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxd8P23463 Gm28180-201ENSMUST00000189608 722 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxd8P23463 Gm42710-201ENSMUST00000200608 985 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxd8P23463 Gm42474-201ENSMUST00000201073 505 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxd8P23463 4930478P22Rik-202ENSMUST00000201921 723 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxd8P23463 Wbp1-209ENSMUST00000205023 716 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxd8P23463 Gm45682-201ENSMUST00000209434 1256 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxd8P23463 Cryab-205ENSMUST00000216755 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxd8P23463 Rhno1-207ENSMUST00000223237 1081 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxd8P23463 Olfr63-201ENSMUST00000067840 955 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxd8P23463 Syne3-202ENSMUST00000095439 3357 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxd8P23463 Cd247-205ENSMUST00000161559 1816 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxd8P23463 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxd8P23463 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxd8P23463 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxd8P23463 Mkrn1-ps1-201ENSMUST00000122035 1390 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxd8P23463 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxd8P23463 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxd8P23463 Bcar1-203ENSMUST00000212349 3116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxd8P23463 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxd8P23463 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxd8P23463 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxd8P23463 4930431P19Rik-202ENSMUST00000207761 2959 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxd8P23463 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxd8P23463 Psd3-213ENSMUST00000212505 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxd8P23463 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxd8P23463 Selenbp2-204ENSMUST00000173849 1323 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxd8P23463 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxd8P23463 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxd8P23463 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxd8P23463 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxd8P23463 Gm15567-201ENSMUST00000148699 2130 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxd8P23463 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxd8P23463 Pidd1-202ENSMUST00000106005 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxd8P23463 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxd8P23463 Gm23062-201ENSMUST00000102349 110 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxd8P23463 Gm15912-201ENSMUST00000128914 578 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxd8P23463 Gm12744-201ENSMUST00000146976 519 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxd8P23463 Gm8185-201ENSMUST00000160999 669 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxd8P23463 Gm6612-201ENSMUST00000170777 395 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxd8P23463 Gm7627-201ENSMUST00000183205 999 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxd8P23463 Gm38007-201ENSMUST00000192187 313 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxd8P23463 Gm38038-201ENSMUST00000193803 259 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxd8P23463 Gm45060-201ENSMUST00000203293 593 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxd8P23463 Chac2-201ENSMUST00000020553 1018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxd8P23463 Gm7238-201ENSMUST00000206467 973 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxd8P23463 Gm6518-201ENSMUST00000208450 342 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxd8P23463 Gm45745-201ENSMUST00000211447 1180 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxd8P23463 Gm9204-201ENSMUST00000212641 947 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxd8P23463 Gm1000-202ENSMUST00000222329 757 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxd8P23463 AC152169.2-201ENSMUST00000224558 613 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxd8P23463 Pmis2-201ENSMUST00000051495 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxd8P23463 Rhox8-201ENSMUST00000071885 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxd8P23463 Mir326-201ENSMUST00000083637 95 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxd8P23463 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxd8P23463 Gm44975-201ENSMUST00000207435 1390 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxd8P23463 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxd8P23463 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxd8P23463 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxd8P23463 Slc17a8-202ENSMUST00000105295 1863 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxd8P23463 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxd8P23463 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxd8P23463 Tfrc-201ENSMUST00000023486 4890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxd8P23463 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxd8P23463 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxd8P23463 Phka2-203ENSMUST00000112377 3947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxd8P23463 Gm38111-201ENSMUST00000194817 2741 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxd8P23463 Ttc30b-201ENSMUST00000099996 2737 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxd8P23463 A930006I01Rik-201ENSMUST00000139065 2229 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxd8P23463 H2-T3-201ENSMUST00000025312 2114 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxd8P23463 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxd8P23463 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxd8P23463 F730016J06Rik-201ENSMUST00000126140 1344 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxd8P23463 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxd8P23463 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxd8P23463 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxd8P23463 Serhl-205ENSMUST00000166427 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxd8P23463 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxd8P23463 Ifnar1-201ENSMUST00000023689 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxd8P23463 Rab11fip4os1-201ENSMUST00000145652 2187 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxd8P23463 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxd8P23463 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxd8P23463 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxd8P23463 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxd8P23463 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxd8P23463 Ddx56-201ENSMUST00000004507 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxd8P23463 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxd8P23463 2810006K23Rik-201ENSMUST00000077376 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxd8P23463 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxd8P23463 Ptpn2-202ENSMUST00000120934 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxd8P23463 Gm26912-201ENSMUST00000180988 1483 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxd8P23463 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxd8P23463 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxd8P23463 B430203G13Rik-201ENSMUST00000169657 1375 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
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