Protein–RNA interactions for Protein: J3QNP2

Smim18, Small integral membrane protein 18, mousemouse

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Length 93 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim18J3QNP2 Acsm2-201ENSMUST00000084647 2051 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Smim18J3QNP2 Ccnc-201ENSMUST00000065928 3484 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Smim18J3QNP2 Msh4-203ENSMUST00000188338 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Smim18J3QNP2 Zdhhc9-201ENSMUST00000037960 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Smim18J3QNP2 Ubox5-201ENSMUST00000028761 3731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Smim18J3QNP2 Scn8a-201ENSMUST00000082209 11293 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Smim18J3QNP2 Ufsp2-201ENSMUST00000034051 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Smim18J3QNP2 Wnk4-201ENSMUST00000103108 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Smim18J3QNP2 Gm12758-201ENSMUST00000127010 4175 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Smim18J3QNP2 Txndc9-208ENSMUST00000195247 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Smim18J3QNP2 Bag6-211ENSMUST00000173550 3536 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Smim18J3QNP2 Pcdhb5-201ENSMUST00000078271 3535 ntAPPRIS P1 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Smim18J3QNP2 Abhd12b-203ENSMUST00000169156 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Smim18J3QNP2 Rrh-202ENSMUST00000171313 1759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Smim18J3QNP2 Il1rap-201ENSMUST00000023156 4520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Smim18J3QNP2 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Smim18J3QNP2 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Smim18J3QNP2 Acox2-204ENSMUST00000164598 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Smim18J3QNP2 Nupl1-202ENSMUST00000041905 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Smim18J3QNP2 Samd15-202ENSMUST00000182869 2031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Smim18J3QNP2 Clasp2-203ENSMUST00000166734 4108 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Smim18J3QNP2 Usp28-203ENSMUST00000213874 4109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Smim18J3QNP2 Rad50-201ENSMUST00000020649 5153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Smim18J3QNP2 Myo18a-211ENSMUST00000130627 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Smim18J3QNP2 Cel-201ENSMUST00000028161 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Smim18J3QNP2 Slc24a1-201ENSMUST00000037798 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Smim18J3QNP2 Celsr2-201ENSMUST00000090558 10598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Smim18J3QNP2 Dspp-201ENSMUST00000112771 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Smim18J3QNP2 Cntln-203ENSMUST00000107190 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Smim18J3QNP2 Trmt13-201ENSMUST00000041524 3402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Smim18J3QNP2 Gm31024-201ENSMUST00000207600 2353 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
Smim18J3QNP2 AC168276.1-201ENSMUST00000218963 2385 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Smim18J3QNP2 Atp11c-202ENSMUST00000101527 6044 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Smim18J3QNP2 Lipe-204ENSMUST00000149349 3713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Smim18J3QNP2 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Smim18J3QNP2 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
Smim18J3QNP2 Uox-202ENSMUST00000121133 768 ntTSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Smim18J3QNP2 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Smim18J3QNP2 Gm11587-201ENSMUST00000128274 1120 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Smim18J3QNP2 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Smim18J3QNP2 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
Smim18J3QNP2 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
Smim18J3QNP2 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
Smim18J3QNP2 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Smim18J3QNP2 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Smim18J3QNP2 Gm37020-201ENSMUST00000195303 992 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
Smim18J3QNP2 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Smim18J3QNP2 Gm19091-201ENSMUST00000208120 978 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
Smim18J3QNP2 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Smim18J3QNP2 Gm4978-201ENSMUST00000071565 801 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
Smim18J3QNP2 Dync1i2-208ENSMUST00000112144 2565 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Smim18J3QNP2 Ttc16-205ENSMUST00000161089 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Smim18J3QNP2 Edaradd-201ENSMUST00000179308 6668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Smim18J3QNP2 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Smim18J3QNP2 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Smim18J3QNP2 Apba2-206ENSMUST00000206246 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Smim18J3QNP2 4933425M03Rik-201ENSMUST00000195991 1544 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
Smim18J3QNP2 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Smim18J3QNP2 Pitpnm2os1-201ENSMUST00000161697 1618 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Smim18J3QNP2 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Smim18J3QNP2 Nfrkb-201ENSMUST00000086167 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Smim18J3QNP2 Cdca2-205ENSMUST00000150006 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Smim18J3QNP2 A1bg-201ENSMUST00000096418 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Smim18J3QNP2 Zfp446-203ENSMUST00000108536 3705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Smim18J3QNP2 Atp9a-202ENSMUST00000109175 3729 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Smim18J3QNP2 Zbtb8os-204ENSMUST00000141235 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Smim18J3QNP2 Gm45837-201ENSMUST00000084894 4139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Smim18J3QNP2 Irf2-201ENSMUST00000034041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Smim18J3QNP2 Ctns-201ENSMUST00000006103 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Smim18J3QNP2 Gm17816-201ENSMUST00000219991 2603 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
Smim18J3QNP2 Ankrd31-203ENSMUST00000208758 5859 ntTSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Smim18J3QNP2 Snx25-201ENSMUST00000041582 3206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Smim18J3QNP2 Tle3-208ENSMUST00000160882 3523 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Smim18J3QNP2 Shc4-201ENSMUST00000042246 4059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Smim18J3QNP2 Gpr35-203ENSMUST00000169198 4214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Smim18J3QNP2 Ehmt1-202ENSMUST00000091348 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Smim18J3QNP2 Pik3r4-210ENSMUST00000191268 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Smim18J3QNP2 Clip1-204ENSMUST00000111564 5609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Smim18J3QNP2 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Smim18J3QNP2 Ass1-201ENSMUST00000102840 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Smim18J3QNP2 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
Smim18J3QNP2 Gm25148-201ENSMUST00000104611 123 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
Smim18J3QNP2 Bcas3-206ENSMUST00000108062 3724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Smim18J3QNP2 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
Smim18J3QNP2 Mro-202ENSMUST00000120033 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Smim18J3QNP2 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Smim18J3QNP2 Mgat4a-202ENSMUST00000143636 1802 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Smim18J3QNP2 Pcdh15-221ENSMUST00000146682 1891 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Smim18J3QNP2 D030047H15Rik-201ENSMUST00000148318 2536 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Smim18J3QNP2 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Smim18J3QNP2 Hgd-203ENSMUST00000160847 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Smim18J3QNP2 Myl6-201ENSMUST00000164181 665 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Smim18J3QNP2 Dhx30-203ENSMUST00000165596 3726 ntTSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Smim18J3QNP2 Vangl1-208ENSMUST00000168312 1740 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Smim18J3QNP2 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Smim18J3QNP2 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Smim18J3QNP2 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Smim18J3QNP2 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
Smim18J3QNP2 1700126A01Rik-201ENSMUST00000185283 2061 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
Smim18J3QNP2 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms