Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1P4

Lgr5, Leucine-rich repeat-containing G-protein coupled receptor 5, mousemouse

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Length 907 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lgr5Q9Z1P4 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lgr5Q9Z1P4 Dmtf1-201ENSMUST00000071921 3806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lgr5Q9Z1P4 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Lgr5Q9Z1P4 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Lgr5Q9Z1P4 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lgr5Q9Z1P4 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lgr5Q9Z1P4 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC13□□□□□ -0.33
Lgr5Q9Z1P4 Palm2-201ENSMUST00000102904 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lgr5Q9Z1P4 Fut8-203ENSMUST00000177595 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lgr5Q9Z1P4 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Lgr5Q9Z1P4 Acsbg1-201ENSMUST00000034822 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lgr5Q9Z1P4 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lgr5Q9Z1P4 Cyb5r3-202ENSMUST00000162178 2547 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lgr5Q9Z1P4 Pcgf2-206ENSMUST00000169807 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lgr5Q9Z1P4 Mak16-201ENSMUST00000033983 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lgr5Q9Z1P4 A830018L16Rik-209ENSMUST00000179089 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lgr5Q9Z1P4 Ppid-201ENSMUST00000029382 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lgr5Q9Z1P4 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lgr5Q9Z1P4 Kng2-203ENSMUST00000115349 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lgr5Q9Z1P4 Efna1-203ENSMUST00000118860 1403 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Lgr5Q9Z1P4 Gm13608-201ENSMUST00000121807 1406 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Lgr5Q9Z1P4 Ano4-202ENSMUST00000181976 1410 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lgr5Q9Z1P4 Ccdc130-201ENSMUST00000005120 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Lgr5Q9Z1P4 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lgr5Q9Z1P4 Cd300ld5-201ENSMUST00000100239 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lgr5Q9Z1P4 Cd300ld4-201ENSMUST00000100240 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lgr5Q9Z1P4 Wfdc3-202ENSMUST00000109328 726 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lgr5Q9Z1P4 Pxmp4-202ENSMUST00000109703 560 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lgr5Q9Z1P4 Eapp-202ENSMUST00000110713 886 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lgr5Q9Z1P4 Gm11235-201ENSMUST00000117763 333 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Lgr5Q9Z1P4 Gm13333-201ENSMUST00000119424 781 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Lgr5Q9Z1P4 Rpl10a-ps1-201ENSMUST00000120360 654 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Lgr5Q9Z1P4 Gm15815-201ENSMUST00000120569 255 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Lgr5Q9Z1P4 Gm3298-202ENSMUST00000172110 615 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Lgr5Q9Z1P4 Marc1-203ENSMUST00000189492 1239 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Lgr5Q9Z1P4 Gm28505-201ENSMUST00000190466 680 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lgr5Q9Z1P4 Gm5543-201ENSMUST00000193329 1091 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Lgr5Q9Z1P4 Zfp655-204ENSMUST00000199003 601 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Lgr5Q9Z1P4 AC132384.2-201ENSMUST00000218018 526 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Lgr5Q9Z1P4 CT010486.3-201ENSMUST00000224555 811 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Lgr5Q9Z1P4 1110034G24Rik-201ENSMUST00000061891 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lgr5Q9Z1P4 Cd300ld3-201ENSMUST00000092459 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lgr5Q9Z1P4 Slc4a8-204ENSMUST00000162049 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lgr5Q9Z1P4 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lgr5Q9Z1P4 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lgr5Q9Z1P4 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Lgr5Q9Z1P4 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lgr5Q9Z1P4 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lgr5Q9Z1P4 Dcst2-201ENSMUST00000208216 2285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Lgr5Q9Z1P4 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lgr5Q9Z1P4 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Lgr5Q9Z1P4 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lgr5Q9Z1P4 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lgr5Q9Z1P4 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lgr5Q9Z1P4 Fam109b-203ENSMUST00000161178 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lgr5Q9Z1P4 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lgr5Q9Z1P4 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lgr5Q9Z1P4 Zfp830-201ENSMUST00000056677 1591 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lgr5Q9Z1P4 4930566F21Rik-201ENSMUST00000201177 1535 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lgr5Q9Z1P4 Oprm1-211ENSMUST00000105602 1366 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lgr5Q9Z1P4 Igf1-207ENSMUST00000122386 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lgr5Q9Z1P4 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lgr5Q9Z1P4 Rps6-201ENSMUST00000102814 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lgr5Q9Z1P4 Gm11473-201ENSMUST00000118980 359 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Lgr5Q9Z1P4 Stamos-201ENSMUST00000152524 801 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lgr5Q9Z1P4 Ube4bos3-201ENSMUST00000155845 756 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lgr5Q9Z1P4 Gm16227-201ENSMUST00000160088 563 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lgr5Q9Z1P4 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lgr5Q9Z1P4 Rab26-204ENSMUST00000176533 965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lgr5Q9Z1P4 Gm18443-201ENSMUST00000185358 556 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Lgr5Q9Z1P4 Gm17944-201ENSMUST00000186351 643 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Lgr5Q9Z1P4 Gm29669-201ENSMUST00000188605 881 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lgr5Q9Z1P4 Cpsf4l-201ENSMUST00000018871 1235 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lgr5Q9Z1P4 4930444A19Rik-202ENSMUST00000190007 633 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lgr5Q9Z1P4 Gm36982-201ENSMUST00000193796 1128 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Lgr5Q9Z1P4 Gm37944-201ENSMUST00000194233 414 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Lgr5Q9Z1P4 AC124613.1-201ENSMUST00000198711 88 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Lgr5Q9Z1P4 Rarres2-203ENSMUST00000204182 672 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lgr5Q9Z1P4 Olfr1335-202ENSMUST00000219094 1148 ntAPPRIS P2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lgr5Q9Z1P4 AC187103.3-201ENSMUST00000225725 646 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Lgr5Q9Z1P4 AC103672.1-201ENSMUST00000227502 365 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Lgr5Q9Z1P4 AC164883.7-201ENSMUST00000228534 851 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Lgr5Q9Z1P4 Olfr1394-201ENSMUST00000052668 939 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lgr5Q9Z1P4 Zfp868-201ENSMUST00000074982 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lgr5Q9Z1P4 Gm25125-201ENSMUST00000083340 136 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Lgr5Q9Z1P4 Olfr1335-201ENSMUST00000084313 1148 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lgr5Q9Z1P4 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lgr5Q9Z1P4 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lgr5Q9Z1P4 Brat1-201ENSMUST00000041588 3333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lgr5Q9Z1P4 0610040B10Rik-203ENSMUST00000198455 1643 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Lgr5Q9Z1P4 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Lgr5Q9Z1P4 B3glct-201ENSMUST00000100404 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Lgr5Q9Z1P4 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Lgr5Q9Z1P4 Tmem181b-ps-201ENSMUST00000167717 1413 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Lgr5Q9Z1P4 Gm29245-201ENSMUST00000187332 1416 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Lgr5Q9Z1P4 AC107763.1-201ENSMUST00000226082 1365 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Lgr5Q9Z1P4 Rnf214-208ENSMUST00000161187 2847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Lgr5Q9Z1P4 Snora68-201ENSMUST00000104375 131 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Lgr5Q9Z1P4 Gm15074-201ENSMUST00000117603 936 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Lgr5Q9Z1P4 Gm16518-201ENSMUST00000117960 508 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49 ms